Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G530000.1
Synonym MEE50, Sb01g049305
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5SBT0
Pfam PF09759
Panther DB PTHR13255 PTHR13255:SF0
NCBI CDD -
KEGG Orthology K19323; ataxin-10
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G00231 : ARM repeat superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g02720.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000255
Brachypodium KQK23959 , KQK23960
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G163801 - -
2 Sobic.002G325000 O-methyltransferase, putative, expressed -
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19 Sobic.003G031300 - -
20 Sobic.006G037800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G530000 Sobic001G530000 Sobic003G163801 Sobic003G163801 Sobic001G530000--Sobic003G163801 Sobic002G325000 Sobic002G325000 Sobic001G530000--Sobic002G325000 Sobic009G085001 Sobic009G085001 Sobic001G530000--Sobic009G085001 Sobic001G276500 Sobic001G276500 Sobic001G530000--Sobic001G276500 Sobic003G395800 Sobic003G395800 Sobic001G530000--Sobic003G395800 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic001G530000--Sobic001G202800 Sobic002G142400 Sobic002G142400 Sobic001G530000--Sobic002G142400 Sobic002G316400 Sobic002G316400 Sobic001G530000--Sobic002G316400 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic001G530000--Sobic003G311300 Sobic003G163801--Sobic009G085001 Sobic010G117000 Sobic010G117000 Sobic003G163801--Sobic010G117000 Sobic003G163801--Sobic001G530000 Sobic006G222901 Sobic006G222901 Sobic003G163801--Sobic006G222901 Sobic001G324200 Sobic001G324200 Sobic003G163801--Sobic001G324200 Sobic001G147800 Sobic001G147800 Sobic003G163801--Sobic001G147800 Sobic003G276901 Sobic003G276901 Sobic003G163801--Sobic003G276901 Sobic005G039350 Sobic005G039350 Sobic003G163801--Sobic005G039350 Sobic003G327300 Sobic003G327300 Sobic003G163801--Sobic003G327300 Sobic004G039000 Sobic004G039000 Sobic002G325000--Sobic004G039000 Sobic010G252301 Sobic010G252301 Sobic002G325000--Sobic010G252301 Sobic002G025900 Sobic002G025900 Sobic002G325000--Sobic002G025900 Sobic010G045966 Sobic010G045966 Sobic002G325000--Sobic010G045966 Sobic002G075400 Sobic002G075400 Sobic002G325000--Sobic002G075400 Sobic001G325100 Sobic001G325100 Sobic002G325000--Sobic001G325100 Sobic005G183900 Sobic005G183900 Sobic002G325000--Sobic005G183900 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic002G325000--Sobic007G134700 Sobic003G254850 Sobic003G254850 Sobic002G325000--Sobic003G254850 Sobic009G085001--Sobic003G163801 Sobic009G085001--Sobic010G117000 Sobic009G085001--Sobic001G530000 Sobic009G085001--Sobic001G147800 Sobic009G085001--Sobic003G276901 Sobic010G132100 Sobic010G132100 Sobic009G085001--Sobic010G132100 Sobic009G085001--Sobic006G222901 Sobic009G085001--Sobic002G325000 Sobic009G085001--Sobic002G316400 Sobic001G036400 Sobic001G036400 Sobic001G276500--Sobic001G036400 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic001G276500--Sobic005G019250 Sobic006G233200 Sobic006G233200 Sobic001G276500--Sobic006G233200 Sobic006G261650 Sobic006G261650 Sobic001G276500--Sobic006G261650 Sobic004G060000 Sobic004G060000 Sobic001G276500--Sobic004G060000 Sobic007G190466 Sobic007G190466 Sobic001G276500--Sobic007G190466 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic001G276500--Sobic007G190600 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic001G276500--Sobic005G154600 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic001G276500--Sobic004G310350 Sobic010G225175 Sobic010G225175 Sobic003G395800--Sobic010G225175 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic003G395800--Sobic002G154450 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic003G395800--Sobic007G127200 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic003G395800--Sobic010G052100 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic003G395800--Sobic001G323101 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic003G395800--Sobic004G127350 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic003G395800--Sobic001G045900 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic003G395800--Sobic004G134400 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic003G395800--Sobic010G247750 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic001G202800--Sobic009G011050 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic001G202800--Sobic006G239200 Sobic001G202800--Sobic002G142400 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic001G202800--Sobic006G037800 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic001G202800--Sobic010G149000 Sobic001G202800--Sobic007G134700 Sobic002G117800 Sobic002G117800 Sobic001G202800--Sobic002G117800 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic001G202800--Sobic001G208133 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic001G202800--Sobic003G024450 Sobic002G142400--Sobic001G202800 Sobic002G142400--Sobic006G239200 Sobic002G142400--Sobic009G011050 Sobic002G142400--Sobic003G311300 Sobic002G142400--Sobic001G208133 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic002G142400--Sobic003G031300 Sobic002G142400--Sobic006G037800 Sobic002G142400--Sobic004G039000 Sobic002G142400--Sobic003G254850 Sobic002G316400--Sobic002G025900 Sobic002G316400--Sobic010G045966 Sobic002G316400--Sobic002G325000 Sobic003G365450 Sobic003G365450 Sobic002G316400--Sobic003G365450 Sobic002G316400--Sobic010G252301 Sobic002G316400--Sobic001G325100 Sobic010G094750 Sobic010G094750 Sobic002G316400--Sobic010G094750 Sobic001G325500 Sobic001G325500 Sobic002G316400--Sobic001G325500 Sobic003G233332 Sobic003G233332 Sobic002G316400--Sobic003G233332 Sobic003G311300--Sobic001G208133 Sobic003G311300--Sobic006G239200 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic003G311300--Sobic004G079400 Sobic003G311300--Sobic003G031300 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic003G311300--Sobic006G038050 Sobic003G311300--Sobic009G011050 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic003G311300--Sobic004G061100 Sobic003G311300--Sobic001G202800 Sobic003G030100 Sobic003G030100 Sobic003G311300--Sobic003G030100
Octagon: transcription factors


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