Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G163801.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VXL6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g12950.1 : transposon protein, putative, Pong sub-class, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G085001 - -
2 Sobic.010G117000 anthocyanin 3-O-beta-glucosyltransferase, putative, expressed -
3 Sobic.001G530000 expressed protein K19323: ataxin-10
4 Sobic.006G222901 - -
5 Sobic.001G324200 - -
6 Sobic.001G147800 - -
7 Sobic.003G276901 - K13210: far upstream element-binding protein
8 Sobic.005G039350 - -
9 Sobic.003G327300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
10 Sobic.002G325000 O-methyltransferase, putative, expressed -
11 Sobic.005G131600 expressed protein -
12 Sobic.009G124850 - -
13 Sobic.003G395800 photosystem II 44 kDa reaction center protein, putative, expressed K02705: photosystem II CP43 chlorophyll apoprotein
14 Sobic.003G433600 pentatricopeptide, putative, expressed -
15 Sobic.001G377900 OsFBX9 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G400700 - -
17 Sobic.006G200650 - -
18 Sobic.002G219600 RIO1 family protein, expressed K08818: cell division cycle 2-like
19 Sobic.005G043100 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed K12619: XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2
20 Sobic.002G316400 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G163801 Sobic003G163801 Sobic009G085001 Sobic009G085001 Sobic003G163801--Sobic009G085001 Sobic010G117000 Sobic010G117000 Sobic003G163801--Sobic010G117000 Sobic001G530000 Sobic001G530000 Sobic003G163801--Sobic001G530000 Sobic006G222901 Sobic006G222901 Sobic003G163801--Sobic006G222901 Sobic001G324200 Sobic001G324200 Sobic003G163801--Sobic001G324200 Sobic001G147800 Sobic001G147800 Sobic003G163801--Sobic001G147800 Sobic003G276901 Sobic003G276901 Sobic003G163801--Sobic003G276901 Sobic005G039350 Sobic005G039350 Sobic003G163801--Sobic005G039350 Sobic003G327300 Sobic003G327300 Sobic003G163801--Sobic003G327300 Sobic009G085001--Sobic003G163801 Sobic009G085001--Sobic010G117000 Sobic009G085001--Sobic001G530000 Sobic009G085001--Sobic001G147800 Sobic009G085001--Sobic003G276901 Sobic010G132100 Sobic010G132100 Sobic009G085001--Sobic010G132100 Sobic009G085001--Sobic006G222901 Sobic002G325000 Sobic002G325000 Sobic009G085001--Sobic002G325000 Sobic002G316400 Sobic002G316400 Sobic009G085001--Sobic002G316400 Sobic006G183301 Sobic006G183301 Sobic010G117000--Sobic006G183301 Sobic010G117000--Sobic001G147800 Sobic010G117000--Sobic009G085001 Sobic010G117000--Sobic003G163801 Sobic001G377900 Sobic001G377900 Sobic010G117000--Sobic001G377900 Sobic010G117000--Sobic001G324200 Sobic008G174850 Sobic008G174850 Sobic010G117000--Sobic008G174850 Sobic005G181600 Sobic005G181600 Sobic010G117000--Sobic005G181600 Sobic010G117000--Sobic005G039350 Sobic001G530000--Sobic003G163801 Sobic001G530000--Sobic002G325000 Sobic001G530000--Sobic009G085001 Sobic001G276500 Sobic001G276500 Sobic001G530000--Sobic001G276500 Sobic003G395800 Sobic003G395800 Sobic001G530000--Sobic003G395800 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic001G530000--Sobic001G202800 Sobic002G142400 Sobic002G142400 Sobic001G530000--Sobic002G142400 Sobic001G530000--Sobic002G316400 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic001G530000--Sobic003G311300 Sobic002G163950 Sobic002G163950 Sobic006G222901--Sobic002G163950 Sobic007G183500 Sobic007G183500 Sobic006G222901--Sobic007G183500 Sobic006G222901--Sobic002G325000 Sobic004G039000 Sobic004G039000 Sobic006G222901--Sobic004G039000 Sobic006G222901--Sobic002G316400 Sobic006G222901--Sobic002G142400 Sobic006G222901--Sobic001G202800 Sobic003G105200 Sobic003G105200 Sobic006G222901--Sobic003G105200 Sobic005G148300 Sobic005G148300 Sobic006G222901--Sobic005G148300 Sobic006G060400 Sobic006G060400 Sobic001G324200--Sobic006G060400 Sobic001G324200--Sobic003G163801 Sobic001G324200--Sobic010G117000 Sobic001G324200--Sobic005G039350 Sobic006G113301 Sobic006G113301 Sobic001G324200--Sobic006G113301 Sobic001G324200--Sobic008G174850 Sobic005G049100 Sobic005G049100 Sobic001G324200--Sobic005G049100 Sobic001G112550 Sobic001G112550 Sobic001G324200--Sobic001G112550 Sobic001G216900 Sobic001G216900 Sobic001G324200--Sobic001G216900 Sobic005G076700 Sobic005G076700 Sobic001G147800--Sobic005G076700 Sobic001G147800--Sobic010G117000 Sobic007G059150 Sobic007G059150 Sobic001G147800--Sobic007G059150 Sobic004G166600 Sobic004G166600 Sobic001G147800--Sobic004G166600 Sobic005G075700 Sobic005G075700 Sobic001G147800--Sobic005G075700 Sobic007G079901 Sobic007G079901 Sobic001G147800--Sobic007G079901 Sobic005G210400 Sobic005G210400 Sobic001G147800--Sobic005G210400 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic001G147800--Sobic001G527550 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic001G147800--Sobic002G018200 Sobic003G433600 Sobic003G433600 Sobic003G276901--Sobic003G433600 Sobic003G276901--Sobic010G117000 Sobic003G276901--Sobic003G163801 Sobic009G027200 Sobic009G027200 Sobic003G276901--Sobic009G027200 Sobic003G276901--Sobic009G085001 Sobic007G113101 Sobic007G113101 Sobic003G276901--Sobic007G113101 Sobic005G023000 Sobic005G023000 Sobic003G276901--Sobic005G023000 Sobic010G244400 Sobic010G244400 Sobic003G276901--Sobic010G244400 Sobic003G276901--Sobic006G183301 Sobic005G039350--Sobic001G216900 Sobic009G260800 Sobic009G260800 Sobic005G039350--Sobic009G260800 Sobic005G043100 Sobic005G043100 Sobic005G039350--Sobic005G043100 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic005G039350--Sobic003G429500 Sobic006G055100 Sobic006G055100 Sobic005G039350--Sobic006G055100 Sobic005G039350--Sobic001G324200 Sobic005G039350--Sobic010G117000 Sobic005G039350--Sobic003G163801 Sobic007G101000 Sobic007G101000 Sobic005G039350--Sobic007G101000 Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic003G327300--Sobic002G199300 Sobic003G357900 Sobic003G357900 Sobic003G327300--Sobic003G357900 Sobic002G334700 Sobic002G334700 Sobic003G327300--Sobic002G334700 Sobic003G205000 Sobic003G205000 Sobic003G327300--Sobic003G205000 Sobic009G215100 Sobic009G215100 Sobic003G327300--Sobic009G215100 Sobic006G053550 Sobic006G053550 Sobic003G327300--Sobic006G053550 Sobic002G109700 Sobic002G109700 Sobic003G327300--Sobic002G109700 Sobic002G400700 Sobic002G400700 Sobic003G327300--Sobic002G400700 Sobic002G033550 Sobic002G033550 Sobic003G327300--Sobic002G033550
Octagon: transcription factors


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