Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G276901.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VZ53
Pfam PF00013
Panther DB PTHR10288 PTHR10288:SF145
NCBI CDD -
KEGG Orthology K13210; far upstream element-binding protein
Gene Ontology GO:0003723; RNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G10070 : KH domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g01930.1 : KH domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039133 , Zm00025a030288 , Zm00025a040212
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G433600 pentatricopeptide, putative, expressed -
2 Sobic.010G117000 anthocyanin 3-O-beta-glucosyltransferase, putative, expressed -
3 Sobic.003G163801 - -
4 Sobic.009G027200 tetraspanin family protein, putative, expressed -
5 Sobic.009G085001 - -
6 Sobic.007G113101 - -
7 Sobic.005G023000 OsFBX369 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.010G244400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.006G183301 - -
10 Sobic.001G490800 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
11 Sobic.005G131600 expressed protein -
12 Sobic.006G275900 pentatricopeptide, putative, expressed -
13 Sobic.002G337400 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
14 Sobic.007G085400 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
15 Sobic.008G093300 - -
16 Sobic.003G032301 - -
17 Sobic.001G530000 expressed protein K19323: ataxin-10
18 Sobic.009G131550 - K15032: mTERF domain-containing protein, mitochondrial
19 Sobic.007G200700 pyridoxamine 5\'-phosphate oxidase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G423200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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