Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G327300.1
Synonym Sb03g037330
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence. (PubMedID : 27586543)
expressed protein
UniProt A0A1B6Q6M1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g58800.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027178
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G327300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G199300 - -
2 Sobic.003G357900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@strictosidine synthase, putative, expressed -
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4 Sobic.003G205000 DUF623 domain containing protein, expressed -
5 Sobic.009G215100 jacalin-like lectin domain containing protein, expressed -
6 Sobic.006G053550 - -
7 Sobic.002G109700 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
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10 Sobic.003G031300 - -
11 Sobic.010G266400 - -
12 Sobic.001G137900 cytochrome P450, putative, expressed -
13 Sobic.002G412300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
14 Sobic.001G443400 conserved hypothetical protein -
15 Sobic.003G059450 - -
16 Sobic.003G436100 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
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18 Sobic.001G324300 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
19 Sobic.007G050650 - -
20 Sobic.K031400 ATP synthase protein YMF19, putative, expressed K02109: ATPF0B, F-type H+-transporting ATPase subunit b


Gene co-expression network
sample Sobic003G327300 Sobic003G327300 Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic003G327300--Sobic002G199300 Sobic003G357900 Sobic003G357900 Sobic003G327300--Sobic003G357900 Sobic002G334700 Sobic002G334700 Sobic003G327300--Sobic002G334700 Sobic003G205000 Sobic003G205000 Sobic003G327300--Sobic003G205000 Sobic009G215100 Sobic009G215100 Sobic003G327300--Sobic009G215100 Sobic006G053550 Sobic006G053550 Sobic003G327300--Sobic006G053550 Sobic002G109700 Sobic002G109700 Sobic003G327300--Sobic002G109700 Sobic002G400700 Sobic002G400700 Sobic003G327300--Sobic002G400700 Sobic002G033550 Sobic002G033550 Sobic003G327300--Sobic002G033550 Sobic002G199300--Sobic003G205000 Sobic002G199300--Sobic002G334700 Sobic010G266400 Sobic010G266400 Sobic002G199300--Sobic010G266400 Sobic002G199300--Sobic009G215100 Sobic002G199300--Sobic006G053550 Sobic001G443400 Sobic001G443400 Sobic002G199300--Sobic001G443400 Sobic006G174050 Sobic006G174050 Sobic002G199300--Sobic006G174050 Sobic005G192350 Sobic005G192350 Sobic002G199300--Sobic005G192350 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic002G199300--Sobic010G166201 Sobic003G357900--Sobic001G443400 Sobic005G165300 Sobic005G165300 Sobic003G357900--Sobic005G165300 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic003G357900--Sobic009G025750 Sobic005G168900 Sobic005G168900 Sobic003G357900--Sobic005G168900 Sobic003G357900--Sobic006G174050 Sobic001G334800 Sobic001G334800 Sobic003G357900--Sobic001G334800 Sobic006G250350 Sobic006G250350 Sobic003G357900--Sobic006G250350 Sobic002G018800 Sobic002G018800 Sobic003G357900--Sobic002G018800 Sobic003G357900--Sobic010G166201 Sobic002G334700--Sobic003G205000 Sobic002G334700--Sobic002G199300 Sobic002G334700--Sobic009G215100 Sobic002G334700--Sobic006G053550 Sobic003G436100 Sobic003G436100 Sobic002G334700--Sobic003G436100 Sobic003G059450 Sobic003G059450 Sobic002G334700--Sobic003G059450 Sobic009G188200 Sobic009G188200 Sobic002G334700--Sobic009G188200 Sobic002G094100 Sobic002G094100 Sobic002G334700--Sobic002G094100 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic002G334700--Sobic003G031300 Sobic003G205000--Sobic009G215100 Sobic003G205000--Sobic006G053550 Sobic003G205000--Sobic002G199300 Sobic003G205000--Sobic002G334700 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic003G205000--Sobic004G310350 Sobic003G173200 Sobic003G173200 Sobic003G205000--Sobic003G173200 Sobic001G224500 Sobic001G224500 Sobic003G205000--Sobic001G224500 SobicK031400 SobicK031400 Sobic003G205000--SobicK031400 Sobic003G205000--Sobic002G094100 Sobic009G215100--Sobic006G053550 Sobic009G215100--Sobic003G173200 Sobic009G215100--Sobic003G205000 Sobic009G215100--SobicK031400 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic009G215100--Sobic003G268100 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic009G215100--Sobic010G098800 Sobic009G215100--Sobic001G224500 SobicK031900 SobicK031900 Sobic009G215100--SobicK031900 Sobic009G215100--Sobic004G310350 Sobic006G053550--Sobic009G215100 Sobic006G053550--Sobic004G310350 Sobic006G053550--Sobic003G205000 Sobic006G053550--Sobic001G224500 Sobic006G053550--SobicK031400 Sobic006G053550--Sobic003G173200 Sobic006G053550--SobicK031900 Sobic006G053550--Sobic003G268100 Sobic006G053550--Sobic002G334700 Sobic008G142450 Sobic008G142450 Sobic002G109700--Sobic008G142450 Sobic001G324300 Sobic001G324300 Sobic002G109700--Sobic001G324300 Sobic009G206900 Sobic009G206900 Sobic002G109700--Sobic009G206900 Sobic008G123700 Sobic008G123700 Sobic002G109700--Sobic008G123700 Sobic002G109700--Sobic003G031300 Sobic001G137900 Sobic001G137900 Sobic002G109700--Sobic001G137900 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic002G109700--Sobic004G079400 Sobic009G056950 Sobic009G056950 Sobic002G109700--Sobic009G056950 Sobic004G252250 Sobic004G252250 Sobic002G109700--Sobic004G252250 Sobic002G400700--Sobic003G031300 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic002G400700--Sobic006G239200 Sobic002G400700--Sobic003G059450 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic002G400700--Sobic003G311300 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic002G400700--Sobic007G134700 Sobic002G400700--Sobic003G436100 Sobic002G400700--Sobic002G334700 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic002G400700--Sobic001G208133 Sobic002G400700--Sobic009G188200 Sobic002G033550--Sobic001G137900 Sobic001G413300 Sobic001G413300 Sobic002G033550--Sobic001G413300 Sobic004G199100 Sobic004G199100 Sobic002G033550--Sobic004G199100 Sobic006G279600 Sobic006G279600 Sobic002G033550--Sobic006G279600 Sobic003G143600 Sobic003G143600 Sobic002G033550--Sobic003G143600 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic002G033550--Sobic003G169700 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic002G033550--Sobic003G208200 Sobic009G106601 Sobic009G106601 Sobic002G033550--Sobic009G106601 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic002G033550--Sobic005G019250
Octagon: transcription factors


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