Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G039350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RGJ1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G216900 - -
2 Sobic.009G260800 - -
3 Sobic.005G043100 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed K12619: XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2
4 Sobic.003G429500 - -
5 Sobic.006G055100 - -
6 Sobic.001G324200 - -
7 Sobic.010G117000 anthocyanin 3-O-beta-glucosyltransferase, putative, expressed -
8 Sobic.003G163801 - -
9 Sobic.007G101000 - -
10 Sobic.002G431200 - -
11 Sobic.008G052450 - -
12 Sobic.008G065400 - -
13 Sobic.003G366850 - -
14 Sobic.006G034650 - -
15 Sobic.005G181600 expressed protein -
16 Sobic.009G121750 - -
17 Sobic.008G150200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G104200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
19 Sobic.010G022350 - -
20 Sobic.001G278600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G039350 Sobic005G039350 Sobic001G216900 Sobic001G216900 Sobic005G039350--Sobic001G216900 Sobic009G260800 Sobic009G260800 Sobic005G039350--Sobic009G260800 Sobic005G043100 Sobic005G043100 Sobic005G039350--Sobic005G043100 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic005G039350--Sobic003G429500 Sobic006G055100 Sobic006G055100 Sobic005G039350--Sobic006G055100 Sobic001G324200 Sobic001G324200 Sobic005G039350--Sobic001G324200 Sobic010G117000 Sobic010G117000 Sobic005G039350--Sobic010G117000 Sobic003G163801 Sobic003G163801 Sobic005G039350--Sobic003G163801 Sobic007G101000 Sobic007G101000 Sobic005G039350--Sobic007G101000 Sobic001G216900--Sobic009G260800 Sobic001G216900--Sobic005G039350 Sobic010G022350 Sobic010G022350 Sobic001G216900--Sobic010G022350 Sobic008G145400 Sobic008G145400 Sobic001G216900--Sobic008G145400 Sobic005G094266 Sobic005G094266 Sobic001G216900--Sobic005G094266 Sobic010G170800 Sobic010G170800 Sobic001G216900--Sobic010G170800 Sobic003G389601 Sobic003G389601 Sobic001G216900--Sobic003G389601 Sobic004G179100 Sobic004G179100 Sobic001G216900--Sobic004G179100 Sobic003G417500 Sobic003G417500 Sobic001G216900--Sobic003G417500 Sobic009G260800--Sobic001G216900 Sobic009G260800--Sobic005G039350 Sobic009G260800--Sobic006G055100 Sobic008G052450 Sobic008G052450 Sobic009G260800--Sobic008G052450 Sobic005G149000 Sobic005G149000 Sobic009G260800--Sobic005G149000 Sobic009G260800--Sobic003G429500 Sobic009G260800--Sobic008G145400 Sobic010G104200 Sobic010G104200 Sobic009G260800--Sobic010G104200 Sobic009G159500 Sobic009G159500 Sobic009G260800--Sobic009G159500 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic005G043100--Sobic002G171400 Sobic005G043100--Sobic003G429500 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic005G043100--Sobic008G065400 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic005G043100--Sobic002G431200 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic005G043100--Sobic008G106400 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic005G043100--Sobic003G366850 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic005G043100--Sobic009G121750 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic005G043100--Sobic001G278600 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G043100--Sobic008G045600 Sobic003G429500--Sobic003G366850 Sobic003G429500--Sobic008G065400 Sobic003G429500--Sobic002G171400 Sobic003G429500--Sobic002G431200 Sobic003G429500--Sobic005G043100 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic003G429500--Sobic001G261480 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic003G429500--Sobic003G266700 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic003G429500--Sobic007G005000 Sobic003G429500--Sobic008G045600 Sobic006G055100--Sobic010G104200 Sobic006G055100--Sobic005G149000 Sobic008G117900 Sobic008G117900 Sobic006G055100--Sobic008G117900 Sobic006G055100--Sobic008G052450 Sobic010G063433 Sobic010G063433 Sobic006G055100--Sobic010G063433 SobicK024000 SobicK024000 Sobic006G055100--SobicK024000 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic006G055100--Sobic002G060500 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic006G055100--Sobic009G113600 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic006G055100--Sobic009G026400 Sobic006G060400 Sobic006G060400 Sobic001G324200--Sobic006G060400 Sobic001G324200--Sobic003G163801 Sobic001G324200--Sobic010G117000 Sobic001G324200--Sobic005G039350 Sobic006G113301 Sobic006G113301 Sobic001G324200--Sobic006G113301 Sobic008G174850 Sobic008G174850 Sobic001G324200--Sobic008G174850 Sobic005G049100 Sobic005G049100 Sobic001G324200--Sobic005G049100 Sobic001G112550 Sobic001G112550 Sobic001G324200--Sobic001G112550 Sobic001G324200--Sobic001G216900 Sobic006G183301 Sobic006G183301 Sobic010G117000--Sobic006G183301 Sobic001G147800 Sobic001G147800 Sobic010G117000--Sobic001G147800 Sobic009G085001 Sobic009G085001 Sobic010G117000--Sobic009G085001 Sobic010G117000--Sobic003G163801 Sobic001G377900 Sobic001G377900 Sobic010G117000--Sobic001G377900 Sobic010G117000--Sobic001G324200 Sobic010G117000--Sobic008G174850 Sobic005G181600 Sobic005G181600 Sobic010G117000--Sobic005G181600 Sobic010G117000--Sobic005G039350 Sobic003G163801--Sobic009G085001 Sobic003G163801--Sobic010G117000 Sobic001G530000 Sobic001G530000 Sobic003G163801--Sobic001G530000 Sobic006G222901 Sobic006G222901 Sobic003G163801--Sobic006G222901 Sobic003G163801--Sobic001G324200 Sobic003G163801--Sobic001G147800 Sobic003G276901 Sobic003G276901 Sobic003G163801--Sobic003G276901 Sobic003G163801--Sobic005G039350 Sobic003G327300 Sobic003G327300 Sobic003G163801--Sobic003G327300 Sobic005G110487 Sobic005G110487 Sobic007G101000--Sobic005G110487 Sobic006G034650 Sobic006G034650 Sobic007G101000--Sobic006G034650 Sobic008G041600 Sobic008G041600 Sobic007G101000--Sobic008G041600 Sobic007G101000--Sobic005G181600 Sobic008G041450 Sobic008G041450 Sobic007G101000--Sobic008G041450 Sobic005G071500 Sobic005G071500 Sobic007G101000--Sobic005G071500 Sobic007G101000--Sobic001G216900 Sobic001G509400 Sobic001G509400 Sobic007G101000--Sobic001G509400 Sobic008G044750 Sobic008G044750 Sobic007G101000--Sobic008G044750
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.