Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G181600.1
Synonym Sb05g024010
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PTA2
Pfam -
Panther DB PTHR35166 PTHR35166:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g10420.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G050550 - -
2 Sobic.007G101000 - -
3 Sobic.005G110487 - -
4 Sobic.006G034650 - -
5 Sobic.006G199700 ara54-like RING finger protein, putative, expressed K11971: RNF14, E3 ubiquitin-protein ligase RNF14
6 Sobic.008G016850 - -
7 Sobic.010G117000 anthocyanin 3-O-beta-glucosyltransferase, putative, expressed -
8 Sobic.009G253950 - -
9 Sobic.001G147800 - -
10 Sobic.002G182900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
11 Sobic.002G019750 - -
12 Sobic.003G141600 - -
13 Sobic.009G159300 expressed protein -
14 Sobic.008G041600 expressed protein -
15 Sobic.007G070500 OsFBL41 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
16 Sobic.005G043100 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed K12619: XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2
17 Sobic.003G429500 - -
18 Sobic.010G116900 anthocyanin 3-O-beta-glucosyltransferase, putative, expressed -
19 Sobic.005G170700 OsFBDUF64 - F-box and DUF domain containing protein -
20 Sobic.008G041450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G181600 Sobic005G181600 Sobic006G050550 Sobic006G050550 Sobic005G181600--Sobic006G050550 Sobic007G101000 Sobic007G101000 Sobic005G181600--Sobic007G101000 Sobic005G110487 Sobic005G110487 Sobic005G181600--Sobic005G110487 Sobic006G034650 Sobic006G034650 Sobic005G181600--Sobic006G034650 Sobic006G199700 Sobic006G199700 Sobic005G181600--Sobic006G199700 Sobic008G016850 Sobic008G016850 Sobic005G181600--Sobic008G016850 Sobic010G117000 Sobic010G117000 Sobic005G181600--Sobic010G117000 Sobic009G253950 Sobic009G253950 Sobic005G181600--Sobic009G253950 Sobic001G147800 Sobic001G147800 Sobic005G181600--Sobic001G147800 Sobic006G050550--Sobic005G181600 Sobic002G182900 Sobic002G182900 Sobic006G050550--Sobic002G182900 Sobic005G230100 Sobic005G230100 Sobic006G050550--Sobic005G230100 Sobic010G245900 Sobic010G245900 Sobic006G050550--Sobic010G245900 Sobic003G267300 Sobic003G267300 Sobic006G050550--Sobic003G267300 Sobic006G050550--Sobic009G253950 Sobic006G050550--Sobic008G016850 Sobic001G134000 Sobic001G134000 Sobic006G050550--Sobic001G134000 Sobic003G334500 Sobic003G334500 Sobic006G050550--Sobic003G334500 Sobic007G101000--Sobic005G110487 Sobic007G101000--Sobic006G034650 Sobic008G041600 Sobic008G041600 Sobic007G101000--Sobic008G041600 Sobic007G101000--Sobic005G181600 Sobic008G041450 Sobic008G041450 Sobic007G101000--Sobic008G041450 Sobic005G071500 Sobic005G071500 Sobic007G101000--Sobic005G071500 Sobic001G216900 Sobic001G216900 Sobic007G101000--Sobic001G216900 Sobic001G509400 Sobic001G509400 Sobic007G101000--Sobic001G509400 Sobic008G044750 Sobic008G044750 Sobic007G101000--Sobic008G044750 Sobic005G110487--Sobic006G034650 Sobic005G110487--Sobic007G101000 Sobic004G045800 Sobic004G045800 Sobic005G110487--Sobic004G045800 Sobic002G342100 Sobic002G342100 Sobic005G110487--Sobic002G342100 Sobic009G128300 Sobic009G128300 Sobic005G110487--Sobic009G128300 Sobic006G069200 Sobic006G069200 Sobic005G110487--Sobic006G069200 Sobic002G182800 Sobic002G182800 Sobic005G110487--Sobic002G182800 Sobic003G083000 Sobic003G083000 Sobic005G110487--Sobic003G083000 Sobic005G110487--Sobic001G509400 Sobic006G034650--Sobic005G110487 Sobic006G034650--Sobic007G101000 Sobic006G034650--Sobic004G045800 Sobic006G034650--Sobic009G253950 Sobic003G040800 Sobic003G040800 Sobic006G034650--Sobic003G040800 Sobic003G233900 Sobic003G233900 Sobic006G034650--Sobic003G233900 Sobic006G034650--Sobic009G128300 Sobic007G006000 Sobic007G006000 Sobic006G034650--Sobic007G006000 Sobic001G106000 Sobic001G106000 Sobic006G034650--Sobic001G106000 Sobic003G435400 Sobic003G435400 Sobic006G199700--Sobic003G435400 Sobic002G373600 Sobic002G373600 Sobic006G199700--Sobic002G373600 Sobic003G385000 Sobic003G385000 Sobic006G199700--Sobic003G385000 Sobic001G284425 Sobic001G284425 Sobic006G199700--Sobic001G284425 Sobic006G199700--Sobic006G069200 Sobic003G223800 Sobic003G223800 Sobic006G199700--Sobic003G223800 Sobic008G010900 Sobic008G010900 Sobic006G199700--Sobic008G010900 Sobic004G098800 Sobic004G098800 Sobic006G199700--Sobic004G098800 Sobic002G019750 Sobic002G019750 Sobic006G199700--Sobic002G019750 Sobic008G016850--Sobic005G181600 Sobic008G016850--Sobic002G182900 Sobic010G061300 Sobic010G061300 Sobic008G016850--Sobic010G061300 Sobic004G055300 Sobic004G055300 Sobic008G016850--Sobic004G055300 Sobic008G016850--Sobic003G267300 Sobic008G016850--Sobic006G050550 Sobic008G016850--Sobic001G147800 Sobic007G170200 Sobic007G170200 Sobic008G016850--Sobic007G170200 Sobic008G016850--Sobic009G253950 Sobic006G183301 Sobic006G183301 Sobic010G117000--Sobic006G183301 Sobic010G117000--Sobic001G147800 Sobic009G085001 Sobic009G085001 Sobic010G117000--Sobic009G085001 Sobic003G163801 Sobic003G163801 Sobic010G117000--Sobic003G163801 Sobic001G377900 Sobic001G377900 Sobic010G117000--Sobic001G377900 Sobic001G324200 Sobic001G324200 Sobic010G117000--Sobic001G324200 Sobic008G174850 Sobic008G174850 Sobic010G117000--Sobic008G174850 Sobic010G117000--Sobic005G181600 Sobic005G039350 Sobic005G039350 Sobic010G117000--Sobic005G039350 Sobic009G253950--Sobic003G233900 Sobic009G253950--Sobic003G040800 Sobic003G079800 Sobic003G079800 Sobic009G253950--Sobic003G079800 Sobic009G216900 Sobic009G216900 Sobic009G253950--Sobic009G216900 Sobic009G253950--Sobic009G128300 Sobic009G253950--Sobic002G182800 Sobic009G000700 Sobic009G000700 Sobic009G253950--Sobic009G000700 Sobic004G285100 Sobic004G285100 Sobic009G253950--Sobic004G285100 Sobic009G253950--Sobic008G044750 Sobic005G076700 Sobic005G076700 Sobic001G147800--Sobic005G076700 Sobic001G147800--Sobic010G117000 Sobic007G059150 Sobic007G059150 Sobic001G147800--Sobic007G059150 Sobic004G166600 Sobic004G166600 Sobic001G147800--Sobic004G166600 Sobic005G075700 Sobic005G075700 Sobic001G147800--Sobic005G075700 Sobic007G079901 Sobic007G079901 Sobic001G147800--Sobic007G079901 Sobic005G210400 Sobic005G210400 Sobic001G147800--Sobic005G210400 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic001G147800--Sobic001G527550 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic001G147800--Sobic002G018200
Octagon: transcription factors


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