Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G260800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PAS6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.009G260800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G216900 - -
2 Sobic.005G039350 - -
3 Sobic.006G055100 - -
4 Sobic.008G052450 - -
5 Sobic.005G149000 astaxanthin synthase KC28, putative, expressed -
6 Sobic.003G429500 - -
7 Sobic.008G145400 expressed protein -
8 Sobic.010G104200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
9 Sobic.009G159500 PSF1 - Putative GINS complex subunit, expressed -
10 Sobic.010G022350 - -
11 Sobic.005G130500 terpene synthase, putative, expressed -
12 Sobic.001G204800 - -
13 Sobic.006G157400 syntaxin-18, putative, expressed K08492: syntaxin 18
14 Sobic.003G265701 - -
15 Sobic.007G101000 - -
16 Sobic.006G167250 - -
17 Sobic.001G278600 - -
18 Sobic.010G101700 - -
19 Sobic.002G050450 - -
20 Sobic.003G351150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G260800 Sobic009G260800 Sobic001G216900 Sobic001G216900 Sobic009G260800--Sobic001G216900 Sobic005G039350 Sobic005G039350 Sobic009G260800--Sobic005G039350 Sobic006G055100 Sobic006G055100 Sobic009G260800--Sobic006G055100 Sobic008G052450 Sobic008G052450 Sobic009G260800--Sobic008G052450 Sobic005G149000 Sobic005G149000 Sobic009G260800--Sobic005G149000 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic009G260800--Sobic003G429500 Sobic008G145400 Sobic008G145400 Sobic009G260800--Sobic008G145400 Sobic010G104200 Sobic010G104200 Sobic009G260800--Sobic010G104200 Sobic009G159500 Sobic009G159500 Sobic009G260800--Sobic009G159500 Sobic001G216900--Sobic009G260800 Sobic001G216900--Sobic005G039350 Sobic010G022350 Sobic010G022350 Sobic001G216900--Sobic010G022350 Sobic001G216900--Sobic008G145400 Sobic005G094266 Sobic005G094266 Sobic001G216900--Sobic005G094266 Sobic010G170800 Sobic010G170800 Sobic001G216900--Sobic010G170800 Sobic003G389601 Sobic003G389601 Sobic001G216900--Sobic003G389601 Sobic004G179100 Sobic004G179100 Sobic001G216900--Sobic004G179100 Sobic003G417500 Sobic003G417500 Sobic001G216900--Sobic003G417500 Sobic005G039350--Sobic001G216900 Sobic005G039350--Sobic009G260800 Sobic005G043100 Sobic005G043100 Sobic005G039350--Sobic005G043100 Sobic005G039350--Sobic003G429500 Sobic005G039350--Sobic006G055100 Sobic001G324200 Sobic001G324200 Sobic005G039350--Sobic001G324200 Sobic010G117000 Sobic010G117000 Sobic005G039350--Sobic010G117000 Sobic003G163801 Sobic003G163801 Sobic005G039350--Sobic003G163801 Sobic007G101000 Sobic007G101000 Sobic005G039350--Sobic007G101000 Sobic006G055100--Sobic010G104200 Sobic006G055100--Sobic005G149000 Sobic008G117900 Sobic008G117900 Sobic006G055100--Sobic008G117900 Sobic006G055100--Sobic008G052450 Sobic010G063433 Sobic010G063433 Sobic006G055100--Sobic010G063433 SobicK024000 SobicK024000 Sobic006G055100--SobicK024000 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic006G055100--Sobic002G060500 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic006G055100--Sobic009G113600 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic006G055100--Sobic009G026400 Sobic008G052450--Sobic005G149000 Sobic008G052450--Sobic006G055100 Sobic008G052450--Sobic010G104200 Sobic005G054300 Sobic005G054300 Sobic008G052450--Sobic005G054300 Sobic005G054600 Sobic005G054600 Sobic008G052450--Sobic005G054600 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic008G052450--Sobic004G317600 Sobic003G121900 Sobic003G121900 Sobic008G052450--Sobic003G121900 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic008G052450--Sobic004G121000 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic008G052450--Sobic001G305400 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic005G149000--Sobic005G221425 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic005G149000--Sobic001G253100 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic005G149000--Sobic004G076732 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic005G149000--Sobic008G079100 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic005G149000--Sobic008G009500 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic005G149000--Sobic005G110430 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic005G149000--Sobic009G209800 Sobic005G149000--Sobic008G052450 Sobic005G149000--SobicK024000 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic003G429500--Sobic003G366850 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic003G429500--Sobic008G065400 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic003G429500--Sobic002G171400 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic003G429500--Sobic002G431200 Sobic003G429500--Sobic005G043100 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic003G429500--Sobic001G261480 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic003G429500--Sobic003G266700 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic003G429500--Sobic007G005000 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic003G429500--Sobic008G045600 Sobic008G145400--Sobic010G170800 Sobic008G082600 Sobic008G082600 Sobic008G145400--Sobic008G082600 Sobic007G111901 Sobic007G111901 Sobic008G145400--Sobic007G111901 Sobic004G080700 Sobic004G080700 Sobic008G145400--Sobic004G080700 Sobic005G130500 Sobic005G130500 Sobic008G145400--Sobic005G130500 Sobic008G145400--Sobic004G179100 Sobic009G072066 Sobic009G072066 Sobic008G145400--Sobic009G072066 Sobic004G075301 Sobic004G075301 Sobic008G145400--Sobic004G075301 Sobic010G180750 Sobic010G180750 Sobic008G145400--Sobic010G180750 Sobic010G104200--Sobic006G055100 Sobic010G104200--Sobic005G149000 Sobic010G104200--Sobic010G063433 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic010G104200--Sobic002G007250 Sobic010G104200--Sobic008G009500 Sobic010G104200--SobicK024000 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic010G104200--Sobic008G031350 Sobic005G203400 Sobic005G203400 Sobic010G104200--Sobic005G203400 Sobic010G104200--Sobic009G113600 Sobic009G159500--Sobic007G005000 Sobic009G159500--Sobic008G045600 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic009G159500--Sobic002G221200 Sobic009G159500--Sobic001G261480 Sobic008G036500 Sobic008G036500 Sobic009G159500--Sobic008G036500 Sobic009G159500--Sobic001G305400 Sobic008G150200 Sobic008G150200 Sobic009G159500--Sobic008G150200 Sobic005G043800 Sobic005G043800 Sobic009G159500--Sobic005G043800 Sobic005G061100 Sobic005G061100 Sobic009G159500--Sobic005G061100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.