Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G130500.1
Synonym Sb05g019230
Functional annotation terpene synthase, putative, expressed
UniProt C5Y373
Pfam PF03936
Panther DB PTHR31225 PTHR31225:SF20
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016829; lyase activity GO:0010333terpene synthase activity GO:0000287magnesium ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G20210 : Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g27720.1 : terpene synthase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G145400 expressed protein -
2 Sobic.003G174601 - -
3 Sobic.004G120866 - -
4 Sobic.006G167250 - -
5 Sobic.010G104200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
6 Sobic.007G111901 - -
7 Sobic.006G045800 cytochrome P450, putative, expressed -
8 Sobic.004G080700 - -
9 Sobic.001G216900 - -
10 Sobic.004G179100 protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1, putative, expressed K10956: protein transport protein SEC61 subunit alpha
11 Sobic.006G055100 - -
12 Sobic.010G170800 - -
13 Sobic.004G075301 - -
14 Sobic.008G083600 nodulation protein-related, putative, expressed -
15 Sobic.010G180750 - -
16 Sobic.010G063433 - -
17 Sobic.002G011500 expressed protein -
18 Sobic.005G000400 RNase P subunit p30, putative, expressed -
19 Sobic.009G072066 - -
20 Sobic.009G172300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G130500 Sobic005G130500 Sobic008G145400 Sobic008G145400 Sobic005G130500--Sobic008G145400 Sobic003G174601 Sobic003G174601 Sobic005G130500--Sobic003G174601 Sobic004G120866 Sobic004G120866 Sobic005G130500--Sobic004G120866 Sobic006G167250 Sobic006G167250 Sobic005G130500--Sobic006G167250 Sobic010G104200 Sobic010G104200 Sobic005G130500--Sobic010G104200 Sobic007G111901 Sobic007G111901 Sobic005G130500--Sobic007G111901 Sobic006G045800 Sobic006G045800 Sobic005G130500--Sobic006G045800 Sobic004G080700 Sobic004G080700 Sobic005G130500--Sobic004G080700 Sobic001G216900 Sobic001G216900 Sobic005G130500--Sobic001G216900 Sobic010G170800 Sobic010G170800 Sobic008G145400--Sobic010G170800 Sobic008G082600 Sobic008G082600 Sobic008G145400--Sobic008G082600 Sobic008G145400--Sobic007G111901 Sobic008G145400--Sobic004G080700 Sobic008G145400--Sobic005G130500 Sobic004G179100 Sobic004G179100 Sobic008G145400--Sobic004G179100 Sobic009G072066 Sobic009G072066 Sobic008G145400--Sobic009G072066 Sobic004G075301 Sobic004G075301 Sobic008G145400--Sobic004G075301 Sobic010G180750 Sobic010G180750 Sobic008G145400--Sobic010G180750 Sobic003G174601--Sobic005G130500 Sobic009G102200 Sobic009G102200 Sobic003G174601--Sobic009G102200 Sobic003G174601--Sobic004G080700 Sobic003G174601--Sobic008G145400 Sobic003G174601--Sobic004G120866 Sobic003G311250 Sobic003G311250 Sobic003G174601--Sobic003G311250 Sobic003G174601--Sobic010G104200 Sobic006G141100 Sobic006G141100 Sobic003G174601--Sobic006G141100 Sobic005G117901 Sobic005G117901 Sobic003G174601--Sobic005G117901 Sobic004G120866--Sobic005G130500 Sobic004G120866--Sobic008G145400 Sobic004G120866--Sobic007G111901 Sobic004G120866--Sobic006G045800 Sobic004G120866--Sobic006G167250 Sobic003G324900 Sobic003G324900 Sobic004G120866--Sobic003G324900 Sobic004G120866--Sobic003G174601 Sobic005G052900 Sobic005G052900 Sobic004G120866--Sobic005G052900 Sobic009G005000 Sobic009G005000 Sobic004G120866--Sobic009G005000 Sobic006G167250--Sobic005G130500 Sobic006G167250--Sobic010G104200 Sobic006G167250--Sobic008G145400 Sobic008G083600 Sobic008G083600 Sobic006G167250--Sobic008G083600 Sobic006G167250--Sobic004G120866 Sobic006G167250--Sobic006G045800 Sobic006G055100 Sobic006G055100 Sobic006G167250--Sobic006G055100 Sobic005G000400 Sobic005G000400 Sobic006G167250--Sobic005G000400 Sobic006G167250--Sobic007G111901 Sobic010G104200--Sobic006G055100 Sobic005G149000 Sobic005G149000 Sobic010G104200--Sobic005G149000 Sobic010G063433 Sobic010G063433 Sobic010G104200--Sobic010G063433 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic010G104200--Sobic002G007250 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic010G104200--Sobic008G009500 SobicK024000 SobicK024000 Sobic010G104200--SobicK024000 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic010G104200--Sobic008G031350 Sobic005G203400 Sobic005G203400 Sobic010G104200--Sobic005G203400 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic010G104200--Sobic009G113600 Sobic007G111901--Sobic004G179100 Sobic007G111901--Sobic004G075301 Sobic007G111901--Sobic009G072066 Sobic002G397001 Sobic002G397001 Sobic007G111901--Sobic002G397001 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic007G111901--Sobic004G123801 Sobic007G111901--Sobic010G180750 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic007G111901--Sobic009G219601 Sobic002G218350 Sobic002G218350 Sobic007G111901--Sobic002G218350 Sobic010G158300 Sobic010G158300 Sobic007G111901--Sobic010G158300 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic006G045800--Sobic007G003250 Sobic003G188700 Sobic003G188700 Sobic006G045800--Sobic003G188700 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic006G045800--Sobic010G165925 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic006G045800--Sobic005G107250 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic006G045800--Sobic001G369701 Sobic002G142550 Sobic002G142550 Sobic006G045800--Sobic002G142550 Sobic003G193400 Sobic003G193400 Sobic006G045800--Sobic003G193400 Sobic010G180300 Sobic010G180300 Sobic006G045800--Sobic010G180300 Sobic006G196800 Sobic006G196800 Sobic006G045800--Sobic006G196800 Sobic004G080700--Sobic008G145400 Sobic001G204800 Sobic001G204800 Sobic004G080700--Sobic001G204800 Sobic004G080700--Sobic005G130500 Sobic004G080700--Sobic003G174601 Sobic010G175700 Sobic010G175700 Sobic004G080700--Sobic010G175700 Sobic007G045100 Sobic007G045100 Sobic004G080700--Sobic007G045100 Sobic007G038432 Sobic007G038432 Sobic004G080700--Sobic007G038432 Sobic004G080700--Sobic010G104200 Sobic005G195700 Sobic005G195700 Sobic004G080700--Sobic005G195700 Sobic009G260800 Sobic009G260800 Sobic001G216900--Sobic009G260800 Sobic005G039350 Sobic005G039350 Sobic001G216900--Sobic005G039350 Sobic010G022350 Sobic010G022350 Sobic001G216900--Sobic010G022350 Sobic001G216900--Sobic008G145400 Sobic005G094266 Sobic005G094266 Sobic001G216900--Sobic005G094266 Sobic001G216900--Sobic010G170800 Sobic003G389601 Sobic003G389601 Sobic001G216900--Sobic003G389601 Sobic001G216900--Sobic004G179100 Sobic003G417500 Sobic003G417500 Sobic001G216900--Sobic003G417500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.