Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G145400.2
Synonym Sb08g019570
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R7L8
Pfam -
Panther DB PTHR34666 PTHR34666:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g09150.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056096 , Zm00025a015619 , Zm00025a025663 , Zm00025a029603
Brachypodium KQJ91985 , PNT63994
Barley HORVU5Hr1G037890.1
Wheat TraesCS5D02G126400
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G145400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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17 Sobic.005G151100 sphingolipid C4-hydroxylase SUR2, putative, expressed K04713: sphinganine C4-monooxygenase
18 Sobic.007G146800 late embryogenesis abundant protein, putative, expressed -
19 Sobic.009G172300 - -
20 Sobic.002G039301 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G145400 Sobic008G145400 Sobic010G170800 Sobic010G170800 Sobic008G145400--Sobic010G170800 Sobic008G082600 Sobic008G082600 Sobic008G145400--Sobic008G082600 Sobic007G111901 Sobic007G111901 Sobic008G145400--Sobic007G111901 Sobic004G080700 Sobic004G080700 Sobic008G145400--Sobic004G080700 Sobic005G130500 Sobic005G130500 Sobic008G145400--Sobic005G130500 Sobic004G179100 Sobic004G179100 Sobic008G145400--Sobic004G179100 Sobic009G072066 Sobic009G072066 Sobic008G145400--Sobic009G072066 Sobic004G075301 Sobic004G075301 Sobic008G145400--Sobic004G075301 Sobic010G180750 Sobic010G180750 Sobic008G145400--Sobic010G180750 Sobic003G434500 Sobic003G434500 Sobic010G170800--Sobic003G434500 Sobic010G170800--Sobic004G179100 Sobic010G170800--Sobic009G072066 Sobic009G248700 Sobic009G248700 Sobic010G170800--Sobic009G248700 Sobic005G167600 Sobic005G167600 Sobic010G170800--Sobic005G167600 Sobic009G037400 Sobic009G037400 Sobic010G170800--Sobic009G037400 Sobic002G397001 Sobic002G397001 Sobic010G170800--Sobic002G397001 Sobic002G064450 Sobic002G064450 Sobic010G170800--Sobic002G064450 Sobic004G098650 Sobic004G098650 Sobic010G170800--Sobic004G098650 Sobic005G151100 Sobic005G151100 Sobic008G082600--Sobic005G151100 Sobic001G167701 Sobic001G167701 Sobic008G082600--Sobic001G167701 Sobic001G211750 Sobic001G211750 Sobic008G082600--Sobic001G211750 Sobic002G039301 Sobic002G039301 Sobic008G082600--Sobic002G039301 Sobic008G082600--Sobic002G397001 Sobic007G104201 Sobic007G104201 Sobic008G082600--Sobic007G104201 Sobic008G082600--Sobic004G179100 Sobic008G082600--Sobic010G170800 Sobic007G146800 Sobic007G146800 Sobic008G082600--Sobic007G146800 Sobic007G111901--Sobic004G179100 Sobic007G111901--Sobic004G075301 Sobic007G111901--Sobic009G072066 Sobic007G111901--Sobic002G397001 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic007G111901--Sobic004G123801 Sobic007G111901--Sobic010G180750 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic007G111901--Sobic009G219601 Sobic002G218350 Sobic002G218350 Sobic007G111901--Sobic002G218350 Sobic010G158300 Sobic010G158300 Sobic007G111901--Sobic010G158300 Sobic004G080700--Sobic008G145400 Sobic001G204800 Sobic001G204800 Sobic004G080700--Sobic001G204800 Sobic004G080700--Sobic005G130500 Sobic003G174601 Sobic003G174601 Sobic004G080700--Sobic003G174601 Sobic010G175700 Sobic010G175700 Sobic004G080700--Sobic010G175700 Sobic007G045100 Sobic007G045100 Sobic004G080700--Sobic007G045100 Sobic007G038432 Sobic007G038432 Sobic004G080700--Sobic007G038432 Sobic010G104200 Sobic010G104200 Sobic004G080700--Sobic010G104200 Sobic005G195700 Sobic005G195700 Sobic004G080700--Sobic005G195700 Sobic005G130500--Sobic008G145400 Sobic005G130500--Sobic003G174601 Sobic004G120866 Sobic004G120866 Sobic005G130500--Sobic004G120866 Sobic006G167250 Sobic006G167250 Sobic005G130500--Sobic006G167250 Sobic005G130500--Sobic010G104200 Sobic005G130500--Sobic007G111901 Sobic006G045800 Sobic006G045800 Sobic005G130500--Sobic006G045800 Sobic005G130500--Sobic004G080700 Sobic001G216900 Sobic001G216900 Sobic005G130500--Sobic001G216900 Sobic004G179100--Sobic004G075301 Sobic004G179100--Sobic009G072066 Sobic004G179100--Sobic002G397001 Sobic001G273600 Sobic001G273600 Sobic004G179100--Sobic001G273600 Sobic004G179100--Sobic009G248700 Sobic004G179100--Sobic007G146800 Sobic004G179100--Sobic003G434500 Sobic006G089200 Sobic006G089200 Sobic004G179100--Sobic006G089200 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic004G179100--Sobic001G018700 Sobic009G072066--Sobic004G075301 Sobic009G072066--Sobic001G018700 Sobic004G075301--Sobic009G072066 Sobic004G075301--Sobic001G018700 Sobic004G224350 Sobic004G224350 Sobic010G180750--Sobic004G224350 Sobic010G180750--Sobic001G167701 Sobic003G268650 Sobic003G268650 Sobic010G180750--Sobic003G268650 Sobic002G032033 Sobic002G032033 Sobic010G180750--Sobic002G032033 Sobic003G373200 Sobic003G373200 Sobic010G180750--Sobic003G373200 Sobic005G216866 Sobic005G216866 Sobic010G180750--Sobic005G216866 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic010G180750--Sobic001G183900 Sobic010G180750--Sobic002G397001 Sobic010G180750--Sobic004G179100
Octagon: transcription factors


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