Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G150066.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S605
Pfam -
Panther DB PTHR33087 PTHR33087:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g09890.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G202700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
2 Sobic.010G061300 receptor protein kinase, putative, expressed -
3 Sobic.003G373700 - -
4 Sobic.007G043750 - -
5 Sobic.006G034650 - -
6 Sobic.002G146200 arginyl-tRNA synthetase, putative, expressed -
7 Sobic.008G017600 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@no apical meristem protein, putative, expressed -
8 Sobic.008G104350 - -
9 Sobic.002G367000 glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein, putative, expressed K01126: E3.1.4.46, glpQ, glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
10 Sobic.009G258000 S-locus lectin protein kinase family protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G088000 expressed protein -
12 Sobic.006G183301 - -
13 Sobic.008G186300 receptor-like protein kinase HAIKU2 precursor, putative, expressed -
14 Sobic.003G032301 - -
15 Sobic.005G110487 - -
16 Sobic.006G123650 - -
17 Sobic.007G013200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
18 Sobic.009G188100 serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed -
19 Sobic.002G359500 - -
20 Sobic.004G312000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tetratricopeptide-like helical, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G150066 Sobic001G150066 Sobic003G202700 Sobic003G202700 Sobic001G150066--Sobic003G202700 Sobic010G061300 Sobic010G061300 Sobic001G150066--Sobic010G061300 Sobic003G373700 Sobic003G373700 Sobic001G150066--Sobic003G373700 Sobic007G043750 Sobic007G043750 Sobic001G150066--Sobic007G043750 Sobic006G034650 Sobic006G034650 Sobic001G150066--Sobic006G034650 Sobic002G146200 Sobic002G146200 Sobic001G150066--Sobic002G146200 Sobic008G017600 Sobic008G017600 Sobic001G150066--Sobic008G017600 Sobic008G104350 Sobic008G104350 Sobic001G150066--Sobic008G104350 Sobic002G367000 Sobic002G367000 Sobic001G150066--Sobic002G367000 Sobic001G491500 Sobic001G491500 Sobic003G202700--Sobic001G491500 Sobic007G028766 Sobic007G028766 Sobic003G202700--Sobic007G028766 Sobic008G167900 Sobic008G167900 Sobic003G202700--Sobic008G167900 Sobic001G072100 Sobic001G072100 Sobic003G202700--Sobic001G072100 Sobic003G032301 Sobic003G032301 Sobic003G202700--Sobic003G032301 Sobic005G110350 Sobic005G110350 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Octagon: transcription factors


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