Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G223200.1
Synonym Sb06g029260
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YGI1
Pfam PF14764
Panther DB PTHR12181 PTHR12181:SF29
NCBI CDD -
KEGG Orthology K19025; AP5Z1, AP-5 complex subunit zeta-1
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G15160 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g53530.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009693
Brachypodium KQJ84754 , KQJ84755 , KQJ84791
Barley HORVU2Hr1G106960.14 , HORVU2Hr1G106960.15 , HORVU2Hr1G106960.10 , HORVU2Hr1G106960.11 , HORVU2Hr1G106960.12 , HORVU2Hr1G106960.13 , HORVU2Hr1G106960.6 , HORVU2Hr1G106960.7 , HORVU2Hr1G106960.4 , HORVU2Hr1G106960.5 , HORVU2Hr1G106960.2 , HORVU2Hr1G106960.3 , HORVU2Hr1G106960.1 , HORVU2Hr1G106960.8 , HORVU2Hr1G106960.9
Wheat TraesCS2A02G473900 , TraesCS2A02G473900 , TraesCS2D02G473600 , TraesCS2D02G473600 , TraesCS2D02G473600 , TraesCS2B02G497400
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cDNA sequences
Sobic.006G223200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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16 Sobic.003G001400 expressed protein -
17 Sobic.009G149700 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G010151 - -
19 Sobic.002G320001 - -
20 Sobic.003G174475 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G223200 Sobic006G223200 Sobic009G037000 Sobic009G037000 Sobic006G223200--Sobic009G037000 Sobic009G038600 Sobic009G038600 Sobic006G223200--Sobic009G038600 Sobic005G028600 Sobic005G028600 Sobic006G223200--Sobic005G028600 Sobic008G038400 Sobic008G038400 Sobic006G223200--Sobic008G038400 Sobic004G024700 Sobic004G024700 Sobic006G223200--Sobic004G024700 Sobic004G319900 Sobic004G319900 Sobic006G223200--Sobic004G319900 Sobic001G332700 Sobic001G332700 Sobic006G223200--Sobic001G332700 Sobic006G279200 Sobic006G279200 Sobic006G223200--Sobic006G279200 Sobic006G138600 Sobic006G138600 Sobic006G223200--Sobic006G138600 Sobic009G037000--Sobic008G038400 Sobic009G037000--Sobic004G024700 Sobic009G037000--Sobic006G223200 Sobic007G029600 Sobic007G029600 Sobic009G037000--Sobic007G029600 Sobic006G186400 Sobic006G186400 Sobic009G037000--Sobic006G186400 Sobic010G063300 Sobic010G063300 Sobic009G037000--Sobic010G063300 Sobic003G001400 Sobic003G001400 Sobic009G037000--Sobic003G001400 Sobic007G147400 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Octagon: transcription factors


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