Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G320001.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W6P7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G157600 expressed protein -
2 Sobic.008G092532 - -
3 Sobic.004G258700 PHD-finger family protein, expressed -
4 Sobic.001G251400 expressed protein -
5 Sobic.010G172000 - -
6 Sobic.004G253050 - -
7 Sobic.009G127700 ribosomal protein L7Ae, putative, expressed K02951: RP-S12e, small subunit ribosomal protein S12e
8 Sobic.010G232200 - -
9 Sobic.004G096600 - -
10 Sobic.009G024400 ZOS5-03 - C2H2 zinc finger protein, expressed K09191: general transcription factor IIIA
11 Sobic.004G208900 RNA-binding protein Luc7-like, putative, expressed -
12 Sobic.010G143100 - -
13 Sobic.001G359900 expressed protein -
14 Sobic.001G036050 - -
15 Sobic.010G176550 - -
16 Sobic.009G170000 - -
17 Sobic.002G318700 - -
18 Sobic.003G033200 F-box/LRR-repeat protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G099100 - -
20 Sobic.001G227200 haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 1A, putative, expressed K00861: RFK, riboflavin kinase


Gene co-expression network
sample Sobic002G320001 Sobic002G320001 Sobic004G157600 Sobic004G157600 Sobic002G320001--Sobic004G157600 Sobic008G092532 Sobic008G092532 Sobic002G320001--Sobic008G092532 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic002G320001--Sobic004G258700 Sobic001G251400 Sobic001G251400 Sobic002G320001--Sobic001G251400 Sobic010G172000 Sobic010G172000 Sobic002G320001--Sobic010G172000 Sobic004G253050 Sobic004G253050 Sobic002G320001--Sobic004G253050 Sobic009G127700 Sobic009G127700 Sobic002G320001--Sobic009G127700 Sobic010G232200 Sobic010G232200 Sobic002G320001--Sobic010G232200 Sobic004G096600 Sobic004G096600 Sobic002G320001--Sobic004G096600 Sobic004G225600 Sobic004G225600 Sobic004G157600--Sobic004G225600 Sobic002G296100 Sobic002G296100 Sobic004G157600--Sobic002G296100 Sobic004G190900 Sobic004G190900 Sobic004G157600--Sobic004G190900 Sobic003G434700 Sobic003G434700 Sobic004G157600--Sobic003G434700 Sobic002G042500 Sobic002G042500 Sobic004G157600--Sobic002G042500 Sobic003G045300 Sobic003G045300 Sobic004G157600--Sobic003G045300 Sobic009G170000 Sobic009G170000 Sobic004G157600--Sobic009G170000 Sobic001G261573 Sobic001G261573 Sobic004G157600--Sobic001G261573 Sobic009G129100 Sobic009G129100 Sobic004G157600--Sobic009G129100 Sobic001G227200 Sobic001G227200 Sobic008G092532--Sobic001G227200 Sobic008G092532--Sobic004G258700 Sobic007G054400 Sobic007G054400 Sobic008G092532--Sobic007G054400 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic008G092532--Sobic010G277500 Sobic003G101500 Sobic003G101500 Sobic008G092532--Sobic003G101500 Sobic008G092532--Sobic010G172000 Sobic007G225800 Sobic007G225800 Sobic008G092532--Sobic007G225800 Sobic007G210000 Sobic007G210000 Sobic008G092532--Sobic007G210000 Sobic004G107200 Sobic004G107200 Sobic008G092532--Sobic004G107200 Sobic008G113100 Sobic008G113100 Sobic004G258700--Sobic008G113100 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic004G258700--Sobic008G028700 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic004G258700--Sobic001G456900 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic004G258700--Sobic003G148000 Sobic004G258700--Sobic003G101500 Sobic004G258700--Sobic010G277500 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic004G258700--Sobic007G065400 Sobic007G161000 Sobic007G161000 Sobic004G258700--Sobic007G161000 Sobic009G040600 Sobic009G040600 Sobic004G258700--Sobic009G040600 Sobic002G317200 Sobic002G317200 Sobic001G251400--Sobic002G317200 Sobic003G032700 Sobic003G032700 Sobic001G251400--Sobic003G032700 Sobic002G318700 Sobic002G318700 Sobic001G251400--Sobic002G318700 Sobic007G220300 Sobic007G220300 Sobic001G251400--Sobic007G220300 Sobic009G247400 Sobic009G247400 Sobic001G251400--Sobic009G247400 Sobic001G363500 Sobic001G363500 Sobic001G251400--Sobic001G363500 Sobic002G103600 Sobic002G103600 Sobic001G251400--Sobic002G103600 Sobic002G275600 Sobic002G275600 Sobic001G251400--Sobic002G275600 Sobic004G208900 Sobic004G208900 Sobic001G251400--Sobic004G208900 Sobic010G172000--Sobic008G092532 Sobic002G431400 Sobic002G431400 Sobic010G172000--Sobic002G431400 Sobic010G172000--Sobic004G107200 Sobic008G047700 Sobic008G047700 Sobic010G172000--Sobic008G047700 Sobic010G172000--Sobic007G210000 Sobic010G172000--Sobic007G054400 Sobic010G172000--Sobic004G258700 Sobic001G253200 Sobic001G253200 Sobic010G172000--Sobic001G253200 Sobic010G172000--Sobic003G101500 Sobic006G092000 Sobic006G092000 Sobic004G253050--Sobic006G092000 Sobic003G262200 Sobic003G262200 Sobic004G253050--Sobic003G262200 Sobic008G115900 Sobic008G115900 Sobic004G253050--Sobic008G115900 Sobic001G270900 Sobic001G270900 Sobic004G253050--Sobic001G270900 Sobic003G229300 Sobic003G229300 Sobic004G253050--Sobic003G229300 Sobic006G050700 Sobic006G050700 Sobic004G253050--Sobic006G050700 Sobic003G138500 Sobic003G138500 Sobic004G253050--Sobic003G138500 Sobic003G247500 Sobic003G247500 Sobic004G253050--Sobic003G247500 Sobic007G123500 Sobic007G123500 Sobic004G253050--Sobic007G123500 Sobic009G185700 Sobic009G185700 Sobic009G127700--Sobic009G185700 Sobic003G294300 Sobic003G294300 Sobic009G127700--Sobic003G294300 Sobic003G077700 Sobic003G077700 Sobic009G127700--Sobic003G077700 Sobic009G127700--Sobic002G320001 Sobic001G283300 Sobic001G283300 Sobic009G127700--Sobic001G283300 Sobic009G127700--Sobic010G232200 Sobic001G455600 Sobic001G455600 Sobic009G127700--Sobic001G455600 Sobic010G038100 Sobic010G038100 Sobic009G127700--Sobic010G038100 Sobic006G167500 Sobic006G167500 Sobic009G127700--Sobic006G167500 Sobic006G079400 Sobic006G079400 Sobic010G232200--Sobic006G079400 Sobic010G232200--Sobic004G258700 Sobic010G232200--Sobic002G318700 Sobic010G232200--Sobic008G028700 Sobic010G232200--Sobic007G161000 Sobic004G040350 Sobic004G040350 Sobic010G232200--Sobic004G040350 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic010G232200--Sobic002G145101 Sobic007G074600 Sobic007G074600 Sobic010G232200--Sobic007G074600 Sobic010G232200--Sobic004G208900 Sobic001G036050 Sobic001G036050 Sobic004G096600--Sobic001G036050 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic004G096600--Sobic006G182900 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic004G096600--Sobic010G139000 Sobic004G096600--Sobic001G456900 Sobic010G279450 Sobic010G279450 Sobic004G096600--Sobic010G279450 Sobic004G209600 Sobic004G209600 Sobic004G096600--Sobic004G209600 Sobic007G116200 Sobic007G116200 Sobic004G096600--Sobic007G116200 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic004G096600--Sobic003G429650 Sobic006G216800 Sobic006G216800 Sobic004G096600--Sobic006G216800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.