Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G157600.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YQ19
Pfam PF12452
Panther DB PTHR36807 PTHR36807:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G48830 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g31070.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020430
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G031120.9 , HORVU4Hr1G031120.8 , HORVU4Hr1G031120.14 , HORVU4Hr1G031120.1 , HORVU4Hr1G031120.3 , HORVU4Hr1G031120.2 , HORVU4Hr1G031120.5 , HORVU4Hr1G031120.4 , HORVU4Hr1G031120.7 , HORVU4Hr1G031120.6 , HORVU4Hr1G031120.11 , HORVU4Hr1G031120.10 , HORVU4Hr1G031120.13
Wheat TraesCS1D02G073800 , TraesCS4A02G164500
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G157600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G225600 - -
2 Sobic.002G296100 mTERF domain containing protein, expressed K15032: mTERF domain-containing protein, mitochondrial
3 Sobic.004G190900 mTERF domain containing protein, expressed K15032: mTERF domain-containing protein, mitochondrial
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Gene co-expression network
sample Sobic004G157600 Sobic004G157600 Sobic004G225600 Sobic004G225600 Sobic004G157600--Sobic004G225600 Sobic002G296100 Sobic002G296100 Sobic004G157600--Sobic002G296100 Sobic004G190900 Sobic004G190900 Sobic004G157600--Sobic004G190900 Sobic003G434700 Sobic003G434700 Sobic004G157600--Sobic003G434700 Sobic002G042500 Sobic002G042500 Sobic004G157600--Sobic002G042500 Sobic003G045300 Sobic003G045300 Sobic004G157600--Sobic003G045300 Sobic009G170000 Sobic009G170000 Sobic004G157600--Sobic009G170000 Sobic001G261573 Sobic001G261573 Sobic004G157600--Sobic001G261573 Sobic009G129100 Sobic009G129100 Sobic004G157600--Sobic009G129100 Sobic001G022500 Sobic001G022500 Sobic004G225600--Sobic001G022500 Sobic004G208600 Sobic004G208600 Sobic004G225600--Sobic004G208600 Sobic003G162800 Sobic003G162800 Sobic004G225600--Sobic003G162800 Sobic001G099000 Sobic001G099000 Sobic004G225600--Sobic001G099000 Sobic007G095500 Sobic007G095500 Sobic004G225600--Sobic007G095500 Sobic006G058100 Sobic006G058100 Sobic004G225600--Sobic006G058100 Sobic001G375000 Sobic001G375000 Sobic004G225600--Sobic001G375000 Sobic004G225600--Sobic003G434700 Sobic005G184300 Sobic005G184300 Sobic004G225600--Sobic005G184300 Sobic002G296100--Sobic002G042500 Sobic001G037500 Sobic001G037500 Sobic002G296100--Sobic001G037500 Sobic002G347600 Sobic002G347600 Sobic002G296100--Sobic002G347600 Sobic004G020800 Sobic004G020800 Sobic002G296100--Sobic004G020800 Sobic002G296100--Sobic003G434700 Sobic004G206200 Sobic004G206200 Sobic002G296100--Sobic004G206200 Sobic006G128300 Sobic006G128300 Sobic002G296100--Sobic006G128300 Sobic002G081500 Sobic002G081500 Sobic002G296100--Sobic002G081500 Sobic002G296100--Sobic001G022500 Sobic004G190900--Sobic003G434700 Sobic004G190900--Sobic003G162800 Sobic004G190900--Sobic004G206200 Sobic007G069400 Sobic007G069400 Sobic004G190900--Sobic007G069400 Sobic004G190900--Sobic004G225600 Sobic004G190900--Sobic001G022500 Sobic006G110200 Sobic006G110200 Sobic004G190900--Sobic006G110200 Sobic003G254000 Sobic003G254000 Sobic004G190900--Sobic003G254000 Sobic004G035000 Sobic004G035000 Sobic004G190900--Sobic004G035000 Sobic003G434700--Sobic001G022500 Sobic003G067100 Sobic003G067100 Sobic003G434700--Sobic003G067100 Sobic005G072100 Sobic005G072100 Sobic003G434700--Sobic005G072100 Sobic003G434700--Sobic002G042500 Sobic003G434700--Sobic003G162800 Sobic001G102500 Sobic001G102500 Sobic003G434700--Sobic001G102500 Sobic003G434700--Sobic004G225600 Sobic003G434700--Sobic001G375000 Sobic003G234900 Sobic003G234900 Sobic003G434700--Sobic003G234900 Sobic002G042500--Sobic001G037500 Sobic003G150800 Sobic003G150800 Sobic002G042500--Sobic003G150800 Sobic005G111550 Sobic005G111550 Sobic002G042500--Sobic005G111550 Sobic002G042500--Sobic004G206200 Sobic003G085100 Sobic003G085100 Sobic002G042500--Sobic003G085100 Sobic003G141100 Sobic003G141100 Sobic002G042500--Sobic003G141100 Sobic002G042500--Sobic002G296100 Sobic007G185700 Sobic007G185700 Sobic002G042500--Sobic007G185700 Sobic001G126300 Sobic001G126300 Sobic002G042500--Sobic001G126300 Sobic003G128400 Sobic003G128400 Sobic003G045300--Sobic003G128400 Sobic003G045300--Sobic001G375000 Sobic001G003900 Sobic001G003900 Sobic003G045300--Sobic001G003900 Sobic002G181132 Sobic002G181132 Sobic003G045300--Sobic002G181132 Sobic009G092900 Sobic009G092900 Sobic003G045300--Sobic009G092900 Sobic004G003900 Sobic004G003900 Sobic003G045300--Sobic004G003900 Sobic003G045300--Sobic005G184300 Sobic003G045300--Sobic003G162800 Sobic008G090900 Sobic008G090900 Sobic003G045300--Sobic008G090900 Sobic010G176550 Sobic010G176550 Sobic009G170000--Sobic010G176550 Sobic001G227200 Sobic001G227200 Sobic009G170000--Sobic001G227200 Sobic009G170000--Sobic001G261573 Sobic009G209300 Sobic009G209300 Sobic009G170000--Sobic009G209300 Sobic002G343901 Sobic002G343901 Sobic009G170000--Sobic002G343901 Sobic001G036050 Sobic001G036050 Sobic009G170000--Sobic001G036050 Sobic009G170000--Sobic003G254000 Sobic004G208900 Sobic004G208900 Sobic009G170000--Sobic004G208900 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic009G170000--Sobic010G139000 Sobic001G261573--Sobic003G254000 Sobic001G261573--Sobic007G185700 Sobic001G261573--Sobic010G176550 Sobic002G231200 Sobic002G231200 Sobic001G261573--Sobic002G231200 Sobic005G039500 Sobic005G039500 Sobic001G261573--Sobic005G039500 Sobic001G261573--Sobic006G058100 Sobic001G261573--Sobic003G234900 Sobic003G161000 Sobic003G161000 Sobic001G261573--Sobic003G161000 Sobic001G261573--Sobic009G209300 Sobic003G168100 Sobic003G168100 Sobic009G129100--Sobic003G168100 Sobic005G167700 Sobic005G167700 Sobic009G129100--Sobic005G167700 Sobic009G129100--Sobic003G067100 Sobic010G126000 Sobic010G126000 Sobic009G129100--Sobic010G126000 Sobic009G129100--Sobic003G234900 Sobic003G120300 Sobic003G120300 Sobic009G129100--Sobic003G120300 Sobic001G275300 Sobic001G275300 Sobic009G129100--Sobic001G275300 Sobic004G185800 Sobic004G185800 Sobic009G129100--Sobic004G185800 Sobic009G132700 Sobic009G132700 Sobic009G129100--Sobic009G132700
Octagon: transcription factors


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