Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G318700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QEJ5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G372700 expressed protein -
2 Sobic.004G007100 - -
3 Sobic.008G084700 - -
4 Sobic.002G243900 - -
5 Sobic.006G032500 - -
6 Sobic.001G214300 expressed protein -
7 Sobic.002G180666 - -
8 Sobic.002G145101 - -
9 Sobic.006G048500 - -
10 Sobic.007G096600 - -
11 Sobic.002G006900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
12 Sobic.003G148000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
13 Sobic.003G332800 GTPase-activating protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G176500 - -
15 Sobic.006G216800 AAA family ATPase, putative, expressed K13339: PEX6, peroxin-6
16 Sobic.007G161300 VHS and GAT domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G119000 XRN 5\'-3\' exonuclease N-terminus domain containing protein, expressed K12619: XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2
18 Sobic.002G191800 - -
19 Sobic.008G028700 SET domain containing protein, expressed -
20 Sobic.007G116200 expressed protein K13217: PRPF39, pre-mRNA-processing factor 39


Gene co-expression network
sample Sobic002G318700 Sobic002G318700 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic002G318700--Sobic003G372700 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic002G318700--Sobic004G007100 Sobic008G084700 Sobic008G084700 Sobic002G318700--Sobic008G084700 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic002G318700--Sobic002G243900 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic002G318700--Sobic006G032500 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic002G318700--Sobic001G214300 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic002G318700--Sobic002G180666 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic002G318700--Sobic002G145101 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic002G318700--Sobic006G048500 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic003G372700--Sobic002G006900 Sobic003G119000 Sobic003G119000 Sobic003G372700--Sobic003G119000 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic003G372700--Sobic007G065400 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic003G372700--Sobic005G112300 Sobic002G191800 Sobic002G191800 Sobic003G372700--Sobic002G191800 Sobic009G040600 Sobic009G040600 Sobic003G372700--Sobic009G040600 Sobic002G309600 Sobic002G309600 Sobic003G372700--Sobic002G309600 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic003G372700--Sobic003G280800 Sobic001G474600 Sobic001G474600 Sobic003G372700--Sobic001G474600 Sobic004G007100--Sobic006G048500 Sobic004G007100--Sobic002G243900 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic004G007100--Sobic005G144400 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic004G007100--Sobic006G048600 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic004G007100--Sobic007G178700 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic004G007100--Sobic009G104201 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic004G007100--Sobic003G087400 Sobic004G007100--Sobic002G006900 Sobic004G007100--Sobic002G180666 Sobic008G084700--Sobic009G104201 Sobic008G084700--Sobic003G372700 Sobic005G118600 Sobic005G118600 Sobic008G084700--Sobic005G118600 Sobic008G084700--Sobic004G007100 Sobic009G086900 Sobic009G086900 Sobic008G084700--Sobic009G086900 Sobic008G084700--Sobic002G180666 Sobic008G084700--Sobic006G032500 Sobic008G084700--Sobic002G243900 Sobic003G225700 Sobic003G225700 Sobic008G084700--Sobic003G225700 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic002G243900--Sobic007G096600 Sobic002G243900--Sobic004G007100 Sobic002G243900--Sobic005G144400 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic002G243900--Sobic003G148000 Sobic002G243900--Sobic006G048500 Sobic002G243900--Sobic007G178700 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic002G243900--Sobic003G268300 Sobic002G243900--Sobic002G145101 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic002G243900--Sobic003G176500 Sobic006G032500--Sobic002G180666 Sobic006G032500--Sobic003G372700 Sobic006G032500--Sobic003G148000 Sobic003G059750 Sobic003G059750 Sobic006G032500--Sobic003G059750 Sobic006G032500--Sobic002G145101 Sobic007G161300 Sobic007G161300 Sobic006G032500--Sobic007G161300 Sobic006G032500--Sobic005G112300 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic006G032500--Sobic010G139000 Sobic006G032500--Sobic008G084700 Sobic004G341900 Sobic004G341900 Sobic001G214300--Sobic004G341900 Sobic001G214300--Sobic003G148000 Sobic001G214300--Sobic002G006900 Sobic001G214300--Sobic005G144400 Sobic001G214300--Sobic003G176500 Sobic003G029700 Sobic003G029700 Sobic001G214300--Sobic003G029700 Sobic001G214300--Sobic002G243900 Sobic001G214300--Sobic006G048500 Sobic001G214300--Sobic007G096600 Sobic002G180666--Sobic003G148000 Sobic002G180666--Sobic006G032500 Sobic002G180666--Sobic002G145101 Sobic002G180666--Sobic006G048500 Sobic002G343901 Sobic002G343901 Sobic002G180666--Sobic002G343901 Sobic002G180666--Sobic003G372700 Sobic002G180666--Sobic004G007100 Sobic002G180666--Sobic007G161300 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic002G180666--Sobic001G456900 Sobic002G145101--Sobic003G148000 Sobic002G145101--Sobic006G048500 Sobic002G145101--Sobic002G180666 Sobic002G145101--Sobic002G243900 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic002G145101--Sobic008G028700 Sobic002G145101--Sobic004G007100 Sobic006G079400 Sobic006G079400 Sobic002G145101--Sobic006G079400 Sobic002G145101--Sobic006G032500 Sobic002G145101--Sobic005G144400 Sobic006G048500--Sobic004G007100 Sobic006G048500--Sobic005G144400 Sobic006G048500--Sobic002G145101 Sobic006G048500--Sobic003G148000 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic006G048500--Sobic003G429650 Sobic006G048500--Sobic002G243900 Sobic006G048500--Sobic006G048600 Sobic006G048500--Sobic002G006900 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic006G048500--Sobic006G182900
Octagon: transcription factors


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