Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G232200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5Z867
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g46540.1 : condensin complex subunit 1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G232200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G079400 - -
2 Sobic.004G258700 PHD-finger family protein, expressed -
3 Sobic.002G318700 - -
4 Sobic.008G028700 SET domain containing protein, expressed -
5 Sobic.007G161000 RecF/RecN/SMC N terminal domain containing protein, expressed K06636: structural maintenance of chromosome 1
6 Sobic.004G040350 - -
7 Sobic.002G145101 - -
8 Sobic.007G074600 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K15201: GTP3C3, general transcription factor 3C polypeptide 3 (transcription factor C subunit 4)
9 Sobic.004G208900 RNA-binding protein Luc7-like, putative, expressed -
10 Sobic.003G101500 dnaJ domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G243900 - -
12 Sobic.007G116200 expressed protein K13217: PRPF39, pre-mRNA-processing factor 39
13 Sobic.004G007100 - -
14 Sobic.010G277500 expressed protein -
15 Sobic.001G374100 jmjC domain containing protein, expressed K15601: [histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase
16 Sobic.002G402600 pleckstrin homology domain-containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G359900 expressed protein -
18 Sobic.003G372700 expressed protein -
19 Sobic.006G048500 - -
20 Sobic.003G148000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5


Gene co-expression network
sample Sobic010G232200 Sobic010G232200 Sobic006G079400 Sobic006G079400 Sobic010G232200--Sobic006G079400 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic010G232200--Sobic004G258700 Sobic002G318700 Sobic002G318700 Sobic010G232200--Sobic002G318700 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic010G232200--Sobic008G028700 Sobic007G161000 Sobic007G161000 Sobic010G232200--Sobic007G161000 Sobic004G040350 Sobic004G040350 Sobic010G232200--Sobic004G040350 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic010G232200--Sobic002G145101 Sobic007G074600 Sobic007G074600 Sobic010G232200--Sobic007G074600 Sobic004G208900 Sobic004G208900 Sobic010G232200--Sobic004G208900 Sobic006G079400--Sobic002G145101 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic006G079400--Sobic003G148000 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic006G079400--Sobic003G429650 Sobic007G113800 Sobic007G113800 Sobic006G079400--Sobic007G113800 Sobic006G079400--Sobic004G258700 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic006G079400--Sobic002G243900 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic006G079400--Sobic006G048500 Sobic006G079400--Sobic008G028700 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic006G079400--Sobic002G180666 Sobic008G113100 Sobic008G113100 Sobic004G258700--Sobic008G113100 Sobic004G258700--Sobic008G028700 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic004G258700--Sobic001G456900 Sobic004G258700--Sobic003G148000 Sobic003G101500 Sobic003G101500 Sobic004G258700--Sobic003G101500 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic004G258700--Sobic010G277500 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic004G258700--Sobic007G065400 Sobic004G258700--Sobic007G161000 Sobic009G040600 Sobic009G040600 Sobic004G258700--Sobic009G040600 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic002G318700--Sobic003G372700 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic002G318700--Sobic004G007100 Sobic008G084700 Sobic008G084700 Sobic002G318700--Sobic008G084700 Sobic002G318700--Sobic002G243900 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic002G318700--Sobic006G032500 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic002G318700--Sobic001G214300 Sobic002G318700--Sobic002G180666 Sobic002G318700--Sobic002G145101 Sobic002G318700--Sobic006G048500 Sobic010G279450 Sobic010G279450 Sobic008G028700--Sobic010G279450 Sobic008G028700--Sobic009G040600 Sobic004G009600 Sobic004G009600 Sobic008G028700--Sobic004G009600 Sobic008G028700--Sobic004G258700 Sobic008G028700--Sobic007G065400 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic008G028700--Sobic010G139000 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic008G028700--Sobic002G006900 Sobic008G028700--Sobic002G145101 Sobic008G028700--Sobic008G113100 Sobic004G039200 Sobic004G039200 Sobic007G161000--Sobic004G039200 Sobic007G117400 Sobic007G117400 Sobic007G161000--Sobic007G117400 Sobic009G024000 Sobic009G024000 Sobic007G161000--Sobic009G024000 Sobic007G161000--Sobic010G139000 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic007G161000--Sobic006G182900 Sobic002G309600 Sobic002G309600 Sobic007G161000--Sobic002G309600 Sobic004G314000 Sobic004G314000 Sobic007G161000--Sobic004G314000 Sobic002G134200 Sobic002G134200 Sobic007G161000--Sobic002G134200 Sobic007G161000--Sobic008G028700 Sobic004G040350--Sobic001G456900 Sobic007G161300 Sobic007G161300 Sobic004G040350--Sobic007G161300 Sobic007G146100 Sobic007G146100 Sobic004G040350--Sobic007G146100 Sobic004G040350--Sobic010G139000 Sobic004G040350--Sobic002G180666 Sobic004G040350--Sobic008G028700 Sobic003G241100 Sobic003G241100 Sobic004G040350--Sobic003G241100 Sobic004G040350--Sobic002G145101 Sobic002G151300 Sobic002G151300 Sobic004G040350--Sobic002G151300 Sobic002G145101--Sobic003G148000 Sobic002G145101--Sobic006G048500 Sobic002G145101--Sobic002G180666 Sobic002G145101--Sobic002G243900 Sobic002G145101--Sobic008G028700 Sobic002G145101--Sobic004G007100 Sobic002G145101--Sobic006G079400 Sobic002G145101--Sobic006G032500 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic002G145101--Sobic005G144400 Sobic007G074600--Sobic008G028700 Sobic009G260500 Sobic009G260500 Sobic007G074600--Sobic009G260500 Sobic007G074600--Sobic010G139000 Sobic007G074600--Sobic007G161000 Sobic004G209600 Sobic004G209600 Sobic007G074600--Sobic004G209600 Sobic007G074600--Sobic004G314000 Sobic007G074600--Sobic010G279450 Sobic007G074600--Sobic004G009600 Sobic002G042800 Sobic002G042800 Sobic007G074600--Sobic002G042800 Sobic004G208900--Sobic009G040600 Sobic004G208900--Sobic010G277500 Sobic003G052200 Sobic003G052200 Sobic004G208900--Sobic003G052200 Sobic004G208900--Sobic010G139000 Sobic004G208900--Sobic008G113100 Sobic004G208900--Sobic002G006900 Sobic004G208900--Sobic008G028700 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic004G208900--Sobic003G280800 Sobic009G126400 Sobic009G126400 Sobic004G208900--Sobic009G126400
Octagon: transcription factors


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