Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G182700.1
Synonym
Functional annotation protein phosphatase 2C containing protein, expressed
UniProt A0A1B6Q474
Pfam PF00481
Panther DB PTHR13832
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003824; catalytic activity GO:0006470protein dephosphorylation GO:0004722protein serine/threonine phosphatase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G40860 : protein kinase family protein / protein phosphatase 2C ( PP2C) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g36080.1 : protein phosphatase 2C containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036432
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G162200 serine/threonine-protein kinase 19, putative, expressed K08880: serine/threonine kinase 19
2 Sobic.003G182501 - -
3 Sobic.005G008500 expressed protein -
4 Sobic.003G290800 starch binding domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G197700 expressed protein -
6 Sobic.001G176700 CBS domain containing protein, expressed -
7 Sobic.003G182600 protein phosphatase 2C containing protein, expressed -
8 Sobic.006G138600 DIE2/ALG10 family, putative, expressed K03850: alpha-1,2-glucosyltransferase
9 Sobic.007G080780 - -
10 Sobic.001G204601 - -
11 Sobic.006G229800 receptor-like kinase, putative, expressed -
12 Sobic.003G434800 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.003G446100 PWWP domain containing protein, expressed -
14 Sobic.010G220700 aluminum-activated malate transporter, putative, expressed -
15 Sobic.001G193800 - -
16 Sobic.003G081500 expressed protein -
17 Sobic.002G025600 - -
18 Sobic.003G080500 Ser/Thr protein kinase, putative, expressed -
19 Sobic.001G451600 cytochrome P450 protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G043100 serine esterase family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G182700 Sobic003G182700 Sobic010G162200 Sobic010G162200 Sobic003G182700--Sobic010G162200 Sobic003G182501 Sobic003G182501 Sobic003G182700--Sobic003G182501 Sobic005G008500 Sobic005G008500 Sobic003G182700--Sobic005G008500 Sobic003G290800 Sobic003G290800 Sobic003G182700--Sobic003G290800 Sobic004G197700 Sobic004G197700 Sobic003G182700--Sobic004G197700 Sobic001G176700 Sobic001G176700 Sobic003G182700--Sobic001G176700 Sobic003G182600 Sobic003G182600 Sobic003G182700--Sobic003G182600 Sobic006G138600 Sobic006G138600 Sobic003G182700--Sobic006G138600 Sobic007G080780 Sobic007G080780 Sobic003G182700--Sobic007G080780 Sobic010G162200--Sobic001G176700 Sobic003G285600 Sobic003G285600 Sobic010G162200--Sobic003G285600 Sobic003G097701 Sobic003G097701 Sobic010G162200--Sobic003G097701 Sobic007G004750 Sobic007G004750 Sobic010G162200--Sobic007G004750 Sobic007G092000 Sobic007G092000 Sobic010G162200--Sobic007G092000 Sobic003G288500 Sobic003G288500 Sobic010G162200--Sobic003G288500 Sobic010G162500 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Octagon: transcription factors


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