Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G350400.3
Synonym TTL, Sb01g033540
Functional annotation steroid binding protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5S965
Pfam PF00576 PF09349
Panther DB PTHR10395 PTHR10395:SF7
NCBI CDD KOG3006; Transthyretin and related proteins
KEGG Orthology K13484; 5-hydroxyisourate hydrolase / 2-oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G58220 : transthyretin-like protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g27320.1 : steroid binding protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052112
Brachypodium KQK21430
Barley -
Wheat TraesCS4D02G200200 , TraesCS4D02G200200 , TraesCS4D02G200200 , TraesCS4A02G104800 , TraesCS4B02G199200 , TraesCS4B02G199200 , TraesCS4B02G199200
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G350400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.006G124850 - K02948: RP-S11, MRPS11, small subunit ribosomal protein S11


Gene co-expression network
sample Sobic001G350400 Sobic001G350400 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic001G350400--Sobic006G020350 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic001G350400--Sobic003G128575 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic001G350400--Sobic006G017266 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic001G350400--Sobic005G093600 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic001G350400--Sobic005G183450 Sobic002G394433 Sobic002G394433 Sobic001G350400--Sobic002G394433 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic001G350400--Sobic001G365332 Sobic006G005550 Sobic006G005550 Sobic001G350400--Sobic006G005550 Sobic002G174000 Sobic002G174000 Sobic001G350400--Sobic002G174000 Sobic006G020350--Sobic003G128575 Sobic006G020350--Sobic006G017266 Sobic006G020350--Sobic005G183450 Sobic006G020350--Sobic005G093600 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic006G020350--Sobic010G173600 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic006G020350--Sobic006G124850 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic006G020350--Sobic006G147350 Sobic003G255850 Sobic003G255850 Sobic006G020350--Sobic003G255850 Sobic006G020350--Sobic001G365332 Sobic003G128575--Sobic006G017266 Sobic003G128575--Sobic005G183450 Sobic003G128575--Sobic006G020350 Sobic003G128575--Sobic005G093600 Sobic003G128575--Sobic010G173600 Sobic003G128575--Sobic006G124850 Sobic003G128575--Sobic006G147350 Sobic003G128575--Sobic003G255850 Sobic007G149750 Sobic007G149750 Sobic003G128575--Sobic007G149750 Sobic006G017266--Sobic003G128575 Sobic006G017266--Sobic005G183450 Sobic006G017266--Sobic006G020350 Sobic006G017266--Sobic005G093600 Sobic006G017266--Sobic010G173600 Sobic006G017266--Sobic006G124850 Sobic006G017266--Sobic006G147350 Sobic006G017266--Sobic003G255850 Sobic006G017266--Sobic001G365332 Sobic005G093600--Sobic003G128575 Sobic005G093600--Sobic010G173600 Sobic005G093600--Sobic006G017266 Sobic005G093600--Sobic006G020350 Sobic005G093600--Sobic005G183450 Sobic005G093600--Sobic006G147350 Sobic005G093600--Sobic006G124850 Sobic005G093600--Sobic003G255850 Sobic005G093600--Sobic007G149750 Sobic005G183450--Sobic003G128575 Sobic005G183450--Sobic006G017266 Sobic005G183450--Sobic006G020350 Sobic005G183450--Sobic005G093600 Sobic005G183450--Sobic010G173600 Sobic005G183450--Sobic006G124850 Sobic005G183450--Sobic006G147350 Sobic005G183450--Sobic001G365332 Sobic005G183450--Sobic006G005550 Sobic002G394433--Sobic006G020350 Sobic002G394433--Sobic005G183450 Sobic002G394433--Sobic003G128575 Sobic002G394433--Sobic006G017266 Sobic002G394433--Sobic001G365332 Sobic002G394433--Sobic006G005550 Sobic002G394433--Sobic005G093600 Sobic003G168350 Sobic003G168350 Sobic002G394433--Sobic003G168350 Sobic006G078450 Sobic006G078450 Sobic002G394433--Sobic006G078450 Sobic001G365332--Sobic003G168350 Sobic001G365332--Sobic006G078450 Sobic001G365332--Sobic006G005550 Sobic004G346700 Sobic004G346700 Sobic001G365332--Sobic004G346700 Sobic001G365332--Sobic005G183450 Sobic001G365332--Sobic006G017266 Sobic001G365332--Sobic006G020350 Sobic001G365332--Sobic003G128575 Sobic005G008400 Sobic005G008400 Sobic001G365332--Sobic005G008400 Sobic006G005550--Sobic003G168350 Sobic006G005550--Sobic001G365332 Sobic006G005550--Sobic005G183450 Sobic006G005550--Sobic006G020350 Sobic006G005550--Sobic003G128575 Sobic006G005550--Sobic006G017266 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic006G005550--Sobic008G157700 Sobic006G005550--Sobic005G093600 Sobic004G198701 Sobic004G198701 Sobic006G005550--Sobic004G198701 Sobic001G260900 Sobic001G260900 Sobic002G174000--Sobic001G260900 Sobic002G174000--Sobic004G346700 Sobic007G115050 Sobic007G115050 Sobic002G174000--Sobic007G115050 Sobic001G195550 Sobic001G195550 Sobic002G174000--Sobic001G195550 Sobic002G288800 Sobic002G288800 Sobic002G174000--Sobic002G288800 Sobic008G139100 Sobic008G139100 Sobic002G174000--Sobic008G139100 Sobic005G134301 Sobic005G134301 Sobic002G174000--Sobic005G134301 Sobic002G174000--Sobic004G198701 Sobic002G174000--Sobic003G168350
Octagon: transcription factors


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