Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G125400.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PDG3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g23360.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G409250 - -
2 Sobic.003G091400 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed -
3 Sobic.006G015750 - -
4 Sobic.002G078800 LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
5 Sobic.001G253400 AP2 domain containing protein, expressed -
6 Sobic.009G040000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
7 Sobic.005G193700 - -
8 Sobic.001G158600 MYB family transcription factor, putative, expressed -
9 Sobic.001G200900 LTPL160 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
10 Sobic.004G256400 glycosyltransferase, putative, expressed -
11 Sobic.002G192600 no apical meristem protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G135000 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
13 Sobic.006G080500 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
14 Sobic.006G178400 monocopper oxidase, putative, expressed -
15 Sobic.009G052400 inorganic H+ pyrophosphatase, putative, expressed K01507: inorganic pyrophosphatase
16 Sobic.010G085700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
17 Sobic.005G186300 - -
18 Sobic.006G051750 - -
19 Sobic.007G205400 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G129900 indole-3-acetate beta-glucosyltransferase, putative, expressed K13692: UDP-glucose:(indol-3-yl)acetate beta-D-glucosyltransferase


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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