Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G127600.1
Synonym ATBPM3, Sb08g017890, BPM3
Functional annotation MBTB45 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
UniProt C5YPR7
Pfam PF00917 PF00651
Panther DB PTHR26379 PTHR26379:SF178
NCBI CDD -
KEGG Orthology K10523; speckle-type POZ protein
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G39760 : BTB/POZ/MATH-domains containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g35370.1 : MBTB5 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004124
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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19 Sobic.003G245700 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.006G090201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G127600 Sobic008G127600 Sobic003G357000 Sobic003G357000 Sobic008G127600--Sobic003G357000 Sobic004G325766 Sobic004G325766 Sobic008G127600--Sobic004G325766 Sobic003G045800 Sobic003G045800 Sobic008G127600--Sobic003G045800 Sobic004G098200 Sobic004G098200 Sobic008G127600--Sobic004G098200 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic008G127600--Sobic008G023500 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic008G127600--Sobic009G164200 Sobic003G299400 Sobic003G299400 Sobic008G127600--Sobic003G299400 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic008G127600--Sobic007G152200 Sobic005G106800 Sobic005G106800 Sobic008G127600--Sobic005G106800 Sobic003G357000--Sobic008G023500 Sobic004G351866 Sobic004G351866 Sobic003G357000--Sobic004G351866 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic003G357000--Sobic006G185400 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic003G357000--Sobic004G330500 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic003G357000--Sobic005G189400 Sobic003G357000--Sobic009G164200 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic003G357000--Sobic002G205201 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic003G357000--Sobic001G361500 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic003G357000--Sobic006G209100 Sobic004G325766--Sobic007G152200 Sobic004G325766--Sobic005G189400 Sobic004G325766--Sobic004G330500 Sobic010G014600 Sobic010G014600 Sobic004G325766--Sobic010G014600 Sobic004G325766--Sobic006G185400 Sobic010G231400 Sobic010G231400 Sobic004G325766--Sobic010G231400 Sobic004G325766--Sobic009G164200 Sobic004G325766--Sobic006G209100 Sobic004G325766--Sobic002G205201 Sobic003G045800--Sobic008G023500 Sobic007G072901 Sobic007G072901 Sobic003G045800--Sobic007G072901 Sobic003G045800--Sobic007G152200 Sobic003G045800--Sobic005G189400 Sobic003G045800--Sobic009G164200 Sobic003G045800--Sobic004G351866 Sobic003G045800--Sobic004G330500 Sobic003G045800--Sobic010G014600 Sobic003G045800--Sobic006G185400 Sobic004G098200--Sobic003G357000 Sobic002G037000 Sobic002G037000 Sobic004G098200--Sobic002G037000 Sobic004G098200--Sobic008G023500 Sobic001G019100 Sobic001G019100 Sobic004G098200--Sobic001G019100 Sobic004G098200--Sobic003G045800 Sobic001G172900 Sobic001G172900 Sobic004G098200--Sobic001G172900 Sobic004G098200--Sobic009G164200 Sobic009G010800 Sobic009G010800 Sobic004G098200--Sobic009G010800 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic004G098200--Sobic005G037500 Sobic008G023500--Sobic006G185400 Sobic008G023500--Sobic004G330500 Sobic008G023500--Sobic005G189400 Sobic008G023500--Sobic009G164200 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic008G023500--Sobic003G245700 Sobic008G023500--Sobic002G205201 Sobic008G023500--Sobic007G152200 Sobic008G023500--Sobic006G209100 Sobic008G023500--Sobic001G361500 Sobic009G164200--Sobic004G330500 Sobic009G164200--Sobic006G185400 Sobic009G164200--Sobic008G023500 Sobic009G164200--Sobic005G189400 Sobic009G164200--Sobic001G361500 Sobic009G164200--Sobic006G209100 Sobic009G164200--Sobic007G152200 Sobic009G164200--Sobic002G205201 Sobic009G164200--Sobic005G037500 Sobic003G299400--Sobic005G106800 Sobic003G299400--Sobic003G357000 Sobic003G299400--Sobic004G351866 Sobic009G165050 Sobic009G165050 Sobic003G299400--Sobic009G165050 Sobic003G299400--Sobic002G205201 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic003G299400--Sobic010G275550 Sobic003G299400--Sobic003G045800 Sobic003G299400--Sobic008G023500 Sobic003G299400--Sobic004G325766 Sobic007G152200--Sobic004G330500 Sobic007G152200--Sobic005G189400 Sobic007G152200--Sobic006G185400 Sobic007G152200--Sobic002G205201 Sobic007G152200--Sobic001G361500 Sobic007G152200--Sobic006G209100 Sobic007G152200--Sobic008G023500 Sobic007G152200--Sobic009G164200 Sobic007G152200--Sobic005G037500 Sobic005G106800--Sobic003G299400 Sobic005G106800--Sobic009G165050 Sobic005G106800--Sobic004G351866 Sobic005G106800--Sobic004G325766 Sobic005G106800--Sobic003G357000 Sobic005G106800--Sobic003G045800 Sobic005G106800--Sobic010G275550 Sobic005G106800--Sobic010G014600 Sobic006G214101 Sobic006G214101 Sobic005G106800--Sobic006G214101
Octagon: transcription factors


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