Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G135300.1
Synonym Sb08g018680
Functional annotation thaumatin family domain containing protein, expressed
UniProt C5YPY2
Pfam PF00314
Panther DB PTHR31048 PTHR31048:SF22
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G28790 : Pathogenesis-related thaumatin superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g38120.1 : thaumatin family domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025407 , Zm00025a025409 , Zm00025a004227
Brachypodium KQJ87103 , KQJ86239
Barley HORVU5Hr1G021390.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G183300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
2 Sobic.001G455100 expressed protein -
3 Sobic.008G099100 expressed protein -
4 Sobic.003G121000 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
5 Sobic.006G201000 WRKY37, expressed -
6 Sobic.001G522700 no apical meristem protein, putative, expressed -
7 Sobic.007G154200 aspartic proteinase nepenthesin-1 precursor, putative, expressed -
8 Sobic.006G003100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@DUF1295 domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.008G102800 expressed protein -
10 Sobic.004G271800 WRKY66, expressed -
11 Sobic.006G135300 expressed protein -
12 Sobic.010G152400 glycosyltransferase, putative, expressed -
13 Sobic.001G261460 - -
14 Sobic.010G138300 DUF617 domain containing protein, expressed -
15 Sobic.004G322100 hypro1, putative, expressed -
16 Sobic.001G514300 Glutathione S-transferase("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
17 Sobic.009G221500 lipid phosphatase protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G000100 STIGL1 - Stigma-specific Stig1 family protein precursor, expressed -
19 Sobic.003G236600 expressed protein -
20 Sobic.006G092700 MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein


Gene co-expression network
sample Sobic008G135300 Sobic008G135300 Sobic003G183300 Sobic003G183300 Sobic008G135300--Sobic003G183300 Sobic001G455100 Sobic001G455100 Sobic008G135300--Sobic001G455100 Sobic008G099100 Sobic008G099100 Sobic008G135300--Sobic008G099100 Sobic003G121000 Sobic003G121000 Sobic008G135300--Sobic003G121000 Sobic006G201000 Sobic006G201000 Sobic008G135300--Sobic006G201000 Sobic001G522700 Sobic001G522700 Sobic008G135300--Sobic001G522700 Sobic007G154200 Sobic007G154200 Sobic008G135300--Sobic007G154200 Sobic006G003100 Sobic006G003100 Sobic008G135300--Sobic006G003100 Sobic008G102800 Sobic008G102800 Sobic008G135300--Sobic008G102800 Sobic004G271800 Sobic004G271800 Sobic003G183300--Sobic004G271800 Sobic002G146000 Sobic002G146000 Sobic003G183300--Sobic002G146000 Sobic003G000100 Sobic003G000100 Sobic003G183300--Sobic003G000100 Sobic010G028100 Sobic010G028100 Sobic003G183300--Sobic010G028100 Sobic003G183300--Sobic006G003100 Sobic006G092700 Sobic006G092700 Sobic003G183300--Sobic006G092700 Sobic006G135300 Sobic006G135300 Sobic003G183300--Sobic006G135300 Sobic003G183300--Sobic008G135300 Sobic010G070400 Sobic010G070400 Sobic003G183300--Sobic010G070400 Sobic001G455100--Sobic007G154200 Sobic001G455100--Sobic008G099100 Sobic001G455100--Sobic008G135300 Sobic010G148800 Sobic010G148800 Sobic001G455100--Sobic010G148800 Sobic001G455100--Sobic001G522700 Sobic003G322100 Sobic003G322100 Sobic001G455100--Sobic003G322100 Sobic002G365550 Sobic002G365550 Sobic001G455100--Sobic002G365550 Sobic010G096400 Sobic010G096400 Sobic001G455100--Sobic010G096400 Sobic009G221500 Sobic009G221500 Sobic001G455100--Sobic009G221500 Sobic001G514300 Sobic001G514300 Sobic008G099100--Sobic001G514300 Sobic008G099100--Sobic001G455100 Sobic005G231300 Sobic005G231300 Sobic008G099100--Sobic005G231300 Sobic008G099100--Sobic007G154200 Sobic008G099100--Sobic008G135300 Sobic003G083600 Sobic003G083600 Sobic008G099100--Sobic003G083600 Sobic008G099100--Sobic006G201000 Sobic010G082000 Sobic010G082000 Sobic008G099100--Sobic010G082000 Sobic008G099100--Sobic003G322100 Sobic002G154600 Sobic002G154600 Sobic003G121000--Sobic002G154600 Sobic001G514200 Sobic001G514200 Sobic003G121000--Sobic001G514200 Sobic003G121000--Sobic008G135300 Sobic003G121100 Sobic003G121100 Sobic003G121000--Sobic003G121100 Sobic003G121000--Sobic003G183300 Sobic003G408900 Sobic003G408900 Sobic003G121000--Sobic003G408900 Sobic010G047600 Sobic010G047600 Sobic003G121000--Sobic010G047600 Sobic001G261460 Sobic001G261460 Sobic003G121000--Sobic001G261460 Sobic007G090460 Sobic007G090460 Sobic003G121000--Sobic007G090460 Sobic006G201000--Sobic004G271800 Sobic006G201000--Sobic003G183300 Sobic008G035800 Sobic008G035800 Sobic006G201000--Sobic008G035800 Sobic006G201000--Sobic010G082000 Sobic006G201000--Sobic006G092700 Sobic006G201000--Sobic006G135300 Sobic004G322000 Sobic004G322000 Sobic006G201000--Sobic004G322000 Sobic007G090600 Sobic007G090600 Sobic006G201000--Sobic007G090600 Sobic003G240400 Sobic003G240400 Sobic006G201000--Sobic003G240400 Sobic001G522700--Sobic001G455100 Sobic001G522700--Sobic008G135300 Sobic001G522700--Sobic009G221500 Sobic001G522700--Sobic007G154200 Sobic010G152400 Sobic010G152400 Sobic001G522700--Sobic010G152400 Sobic010G138300 Sobic010G138300 Sobic001G522700--Sobic010G138300 Sobic008G019800 Sobic008G019800 Sobic001G522700--Sobic008G019800 Sobic001G522700--Sobic010G148800 Sobic001G522700--Sobic006G201000 Sobic007G154200--Sobic001G455100 Sobic007G154200--Sobic006G003100 Sobic007G154200--Sobic008G099100 Sobic007G154200--Sobic003G322100 Sobic009G074500 Sobic009G074500 Sobic007G154200--Sobic009G074500 Sobic010G031700 Sobic010G031700 Sobic007G154200--Sobic010G031700 Sobic007G154200--Sobic008G135300 Sobic006G079300 Sobic006G079300 Sobic007G154200--Sobic006G079300 Sobic003G020200 Sobic003G020200 Sobic007G154200--Sobic003G020200 Sobic006G003100--Sobic003G000100 Sobic006G003100--Sobic010G152400 Sobic006G003100--Sobic010G031700 Sobic004G106100 Sobic004G106100 Sobic006G003100--Sobic004G106100 Sobic007G086300 Sobic007G086300 Sobic006G003100--Sobic007G086300 Sobic002G233200 Sobic002G233200 Sobic006G003100--Sobic002G233200 Sobic004G322100 Sobic004G322100 Sobic006G003100--Sobic004G322100 Sobic004G306900 Sobic004G306900 Sobic006G003100--Sobic004G306900 Sobic007G158800 Sobic007G158800 Sobic006G003100--Sobic007G158800 Sobic006G256900 Sobic006G256900 Sobic008G102800--Sobic006G256900 Sobic003G236600 Sobic003G236600 Sobic008G102800--Sobic003G236600 Sobic002G001700 Sobic002G001700 Sobic008G102800--Sobic002G001700 Sobic001G430100 Sobic001G430100 Sobic008G102800--Sobic001G430100 Sobic008G102800--Sobic009G221500 Sobic006G197100 Sobic006G197100 Sobic008G102800--Sobic006G197100 Sobic008G102800--Sobic010G138300 Sobic009G199001 Sobic009G199001 Sobic008G102800--Sobic009G199001 Sobic001G264000 Sobic001G264000 Sobic008G102800--Sobic001G264000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.