Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G099100.1,Sobic.008G099100.2
Synonym Sb08g015131
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R5T3 , A0A1B6PCN7
Pfam -
Panther DB PTHR33699 PTHR33699:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G18310 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g22800.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054250 , Zm00025a024830
Brachypodium KQK11164
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G514300 Glutathione S-transferase("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
2 Sobic.001G455100 expressed protein -
3 Sobic.005G231300 thaumatin, putative, expressed -
4 Sobic.007G154200 aspartic proteinase nepenthesin-1 precursor, putative, expressed -
5 Sobic.008G135300 thaumatin family domain containing protein, expressed -
6 Sobic.003G083600 DNA binding protein, putative, expressed -
7 Sobic.006G201000 WRKY37, expressed -
8 Sobic.010G082000 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
9 Sobic.003G322100 polyphenol oxidase, putative, expressed K00422: polyphenol oxidase
10 Sobic.007G073000 - -
11 Sobic.003G240400 leaf senescence related protein, putative, expressed -
12 Sobic.008G035800 glycosyltransferase, putative, expressed K08238: xyloglucan 6-xylosyltransferase
13 Sobic.002G158900 AMP-binding domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G360500 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
15 Sobic.004G322000 hypro1, putative, expressed -
16 Sobic.001G503000 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf and root, expression induced by IAA treatment"(PubMedID : 20499123)@DUF260 domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.009G079900 endoglucanase precursor, putative, expressed -
18 Sobic.001G506600 exostosin family domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G271800 WRKY66, expressed -
20 Sobic.010G096700 leaf senescence related protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G099100 Sobic008G099100 Sobic001G514300 Sobic001G514300 Sobic008G099100--Sobic001G514300 Sobic001G455100 Sobic001G455100 Sobic008G099100--Sobic001G455100 Sobic005G231300 Sobic005G231300 Sobic008G099100--Sobic005G231300 Sobic007G154200 Sobic007G154200 Sobic008G099100--Sobic007G154200 Sobic008G135300 Sobic008G135300 Sobic008G099100--Sobic008G135300 Sobic003G083600 Sobic003G083600 Sobic008G099100--Sobic003G083600 Sobic006G201000 Sobic006G201000 Sobic008G099100--Sobic006G201000 Sobic010G082000 Sobic010G082000 Sobic008G099100--Sobic010G082000 Sobic003G322100 Sobic003G322100 Sobic008G099100--Sobic003G322100 Sobic001G514300--Sobic005G231300 Sobic001G514300--Sobic008G099100 Sobic001G514300--Sobic003G083600 Sobic001G314000 Sobic001G314000 Sobic001G514300--Sobic001G314000 Sobic009G079900 Sobic009G079900 Sobic001G514300--Sobic009G079900 Sobic008G077300 Sobic008G077300 Sobic001G514300--Sobic008G077300 Sobic001G514300--Sobic008G135300 Sobic003G151900 Sobic003G151900 Sobic001G514300--Sobic003G151900 Sobic003G269100 Sobic003G269100 Sobic001G514300--Sobic003G269100 Sobic001G455100--Sobic007G154200 Sobic001G455100--Sobic008G099100 Sobic001G455100--Sobic008G135300 Sobic010G148800 Sobic010G148800 Sobic001G455100--Sobic010G148800 Sobic001G522700 Sobic001G522700 Sobic001G455100--Sobic001G522700 Sobic001G455100--Sobic003G322100 Sobic002G365550 Sobic002G365550 Sobic001G455100--Sobic002G365550 Sobic010G096400 Sobic010G096400 Sobic001G455100--Sobic010G096400 Sobic009G221500 Sobic009G221500 Sobic001G455100--Sobic009G221500 Sobic005G231300--Sobic001G514300 Sobic005G231300--Sobic003G083600 Sobic005G231300--Sobic009G079900 Sobic005G231300--Sobic008G099100 Sobic007G208100 Sobic007G208100 Sobic005G231300--Sobic007G208100 Sobic006G030200 Sobic006G030200 Sobic005G231300--Sobic006G030200 Sobic005G231300--Sobic001G314000 Sobic005G231300--Sobic008G077300 Sobic005G231300--Sobic003G151900 Sobic007G154200--Sobic001G455100 Sobic006G003100 Sobic006G003100 Sobic007G154200--Sobic006G003100 Sobic007G154200--Sobic008G099100 Sobic007G154200--Sobic003G322100 Sobic009G074500 Sobic009G074500 Sobic007G154200--Sobic009G074500 Sobic010G031700 Sobic010G031700 Sobic007G154200--Sobic010G031700 Sobic007G154200--Sobic008G135300 Sobic006G079300 Sobic006G079300 Sobic007G154200--Sobic006G079300 Sobic003G020200 Sobic003G020200 Sobic007G154200--Sobic003G020200 Sobic003G183300 Sobic003G183300 Sobic008G135300--Sobic003G183300 Sobic008G135300--Sobic001G455100 Sobic008G135300--Sobic008G099100 Sobic003G121000 Sobic003G121000 Sobic008G135300--Sobic003G121000 Sobic008G135300--Sobic006G201000 Sobic008G135300--Sobic001G522700 Sobic008G135300--Sobic007G154200 Sobic008G135300--Sobic006G003100 Sobic008G102800 Sobic008G102800 Sobic008G135300--Sobic008G102800 Sobic003G083600--Sobic005G231300 Sobic003G083600--Sobic001G514300 Sobic003G083600--Sobic009G079900 Sobic003G083600--Sobic008G099100 Sobic002G029600 Sobic002G029600 Sobic003G083600--Sobic002G029600 Sobic001G169400 Sobic001G169400 Sobic003G083600--Sobic001G169400 Sobic003G382200 Sobic003G382200 Sobic003G083600--Sobic003G382200 Sobic001G274400 Sobic001G274400 Sobic003G083600--Sobic001G274400 Sobic008G014700 Sobic008G014700 Sobic003G083600--Sobic008G014700 Sobic004G271800 Sobic004G271800 Sobic006G201000--Sobic004G271800 Sobic006G201000--Sobic003G183300 Sobic008G035800 Sobic008G035800 Sobic006G201000--Sobic008G035800 Sobic006G201000--Sobic010G082000 Sobic006G092700 Sobic006G092700 Sobic006G201000--Sobic006G092700 Sobic006G135300 Sobic006G135300 Sobic006G201000--Sobic006G135300 Sobic004G322000 Sobic004G322000 Sobic006G201000--Sobic004G322000 Sobic007G090600 Sobic007G090600 Sobic006G201000--Sobic007G090600 Sobic003G240400 Sobic003G240400 Sobic006G201000--Sobic003G240400 Sobic010G082000--Sobic006G092700 Sobic010G082000--Sobic003G240400 Sobic010G082000--Sobic006G135300 Sobic010G152400 Sobic010G152400 Sobic010G082000--Sobic010G152400 Sobic006G028500 Sobic006G028500 Sobic010G082000--Sobic006G028500 Sobic003G215300 Sobic003G215300 Sobic010G082000--Sobic003G215300 Sobic006G019700 Sobic006G019700 Sobic010G082000--Sobic006G019700 Sobic007G073000 Sobic007G073000 Sobic010G082000--Sobic007G073000 Sobic006G196400 Sobic006G196400 Sobic010G082000--Sobic006G196400 Sobic003G322100--Sobic007G073000 Sobic003G322100--Sobic010G152400 Sobic003G322100--Sobic010G082000 Sobic005G177400 Sobic005G177400 Sobic003G322100--Sobic005G177400 Sobic003G322100--Sobic006G092700 Sobic003G322100--Sobic006G135300 Sobic003G322100--Sobic003G240400 Sobic003G322100--Sobic003G215300 Sobic003G322100--Sobic004G322000
Octagon: transcription factors


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