Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G231300.1
Synonym Sb05g027850
Functional annotation thaumatin, putative, expressed
UniProt C5Y1T3 , C6JS70
Pfam PF00314
Panther DB PTHR31048 PTHR31048:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G02140 : Pathogenesis-related thaumatin superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g47944.1 : thaumatin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029072
Brachypodium KQJ87038
Barley -
Wheat TraesCS4A02G177300 , TraesCS4B02G140500 , TraesCS4D02G135200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G514300 Glutathione S-transferase("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
2 Sobic.003G083600 DNA binding protein, putative, expressed -
3 Sobic.009G079900 endoglucanase precursor, putative, expressed -
4 Sobic.008G099100 expressed protein -
5 Sobic.007G208100 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
6 Sobic.006G030200 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
7 Sobic.001G314000 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
8 Sobic.008G077300 expressed protein -
9 Sobic.003G151900 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
10 Sobic.008G113900 AGAP002737-PA, putative, expressed -
11 Sobic.002G158900 AMP-binding domain containing protein, expressed -
12 Sobic.003G296500 leucine rich repeat family protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G034301 - -
14 Sobic.006G149300 possible lysine decarboxylase domain containing protein, expressed K06966: pyrimidine/purine-5'-nucleotide nucleosidase
15 Sobic.006G201000 WRKY37, expressed -
16 Sobic.002G016400 monocopper oxidase, putative, expressed -
17 Sobic.003G052100 receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
18 Sobic.007G041600 - -
19 Sobic.001G173700 universal stress protein domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.008G135300 thaumatin family domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G231300 Sobic005G231300 Sobic001G514300 Sobic001G514300 Sobic005G231300--Sobic001G514300 Sobic003G083600 Sobic003G083600 Sobic005G231300--Sobic003G083600 Sobic009G079900 Sobic009G079900 Sobic005G231300--Sobic009G079900 Sobic008G099100 Sobic008G099100 Sobic005G231300--Sobic008G099100 Sobic007G208100 Sobic007G208100 Sobic005G231300--Sobic007G208100 Sobic006G030200 Sobic006G030200 Sobic005G231300--Sobic006G030200 Sobic001G314000 Sobic001G314000 Sobic005G231300--Sobic001G314000 Sobic008G077300 Sobic008G077300 Sobic005G231300--Sobic008G077300 Sobic003G151900 Sobic003G151900 Sobic005G231300--Sobic003G151900 Sobic001G514300--Sobic005G231300 Sobic001G514300--Sobic008G099100 Sobic001G514300--Sobic003G083600 Sobic001G514300--Sobic001G314000 Sobic001G514300--Sobic009G079900 Sobic001G514300--Sobic008G077300 Sobic008G135300 Sobic008G135300 Sobic001G514300--Sobic008G135300 Sobic001G514300--Sobic003G151900 Sobic003G269100 Sobic003G269100 Sobic001G514300--Sobic003G269100 Sobic003G083600--Sobic005G231300 Sobic003G083600--Sobic001G514300 Sobic003G083600--Sobic009G079900 Sobic003G083600--Sobic008G099100 Sobic002G029600 Sobic002G029600 Sobic003G083600--Sobic002G029600 Sobic001G169400 Sobic001G169400 Sobic003G083600--Sobic001G169400 Sobic003G382200 Sobic003G382200 Sobic003G083600--Sobic003G382200 Sobic001G274400 Sobic001G274400 Sobic003G083600--Sobic001G274400 Sobic008G014700 Sobic008G014700 Sobic003G083600--Sobic008G014700 Sobic009G060700 Sobic009G060700 Sobic009G079900--Sobic009G060700 Sobic007G020700 Sobic007G020700 Sobic009G079900--Sobic007G020700 Sobic005G052700 Sobic005G052700 Sobic009G079900--Sobic005G052700 Sobic009G079900--Sobic002G029600 Sobic003G079100 Sobic003G079100 Sobic009G079900--Sobic003G079100 Sobic010G213600 Sobic010G213600 Sobic009G079900--Sobic010G213600 Sobic004G008600 Sobic004G008600 Sobic009G079900--Sobic004G008600 Sobic009G079900--Sobic001G274400 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic009G079900--Sobic006G009700 Sobic008G099100--Sobic001G514300 Sobic001G455100 Sobic001G455100 Sobic008G099100--Sobic001G455100 Sobic008G099100--Sobic005G231300 Sobic007G154200 Sobic007G154200 Sobic008G099100--Sobic007G154200 Sobic008G099100--Sobic008G135300 Sobic008G099100--Sobic003G083600 Sobic006G201000 Sobic006G201000 Sobic008G099100--Sobic006G201000 Sobic010G082000 Sobic010G082000 Sobic008G099100--Sobic010G082000 Sobic003G322100 Sobic003G322100 Sobic008G099100--Sobic003G322100 Sobic007G208100--Sobic005G231300 Sobic002G016400 Sobic002G016400 Sobic007G208100--Sobic002G016400 Sobic003G296500 Sobic003G296500 Sobic007G208100--Sobic003G296500 Sobic006G149300 Sobic006G149300 Sobic007G208100--Sobic006G149300 Sobic002G034301 Sobic002G034301 Sobic007G208100--Sobic002G034301 Sobic003G420100 Sobic003G420100 Sobic007G208100--Sobic003G420100 Sobic010G104400 Sobic010G104400 Sobic007G208100--Sobic010G104400 Sobic003G247600 Sobic003G247600 Sobic007G208100--Sobic003G247600 Sobic007G208100--Sobic001G514300 Sobic006G119000 Sobic006G119000 Sobic006G030200--Sobic006G119000 Sobic002G226500 Sobic002G226500 Sobic006G030200--Sobic002G226500 Sobic006G030200--Sobic005G231300 Sobic008G113900 Sobic008G113900 Sobic006G030200--Sobic008G113900 Sobic006G030200--Sobic001G514300 Sobic006G030200--Sobic008G077300 Sobic001G264400 Sobic001G264400 Sobic006G030200--Sobic001G264400 Sobic009G210400 Sobic009G210400 Sobic006G030200--Sobic009G210400 Sobic006G030200--Sobic002G016400 Sobic003G183300 Sobic003G183300 Sobic001G314000--Sobic003G183300 Sobic001G314000--Sobic009G079900 Sobic001G314000--Sobic001G514300 Sobic003G426200 Sobic003G426200 Sobic001G314000--Sobic003G426200 Sobic007G206800 Sobic007G206800 Sobic001G314000--Sobic007G206800 Sobic002G391400 Sobic002G391400 Sobic001G314000--Sobic002G391400 Sobic001G314000--Sobic005G052700 Sobic002G334000 Sobic002G334000 Sobic001G314000--Sobic002G334000 Sobic006G205700 Sobic006G205700 Sobic001G314000--Sobic006G205700 Sobic008G077300--Sobic001G264400 Sobic008G077300--Sobic005G231300 Sobic008G077300--Sobic001G514300 Sobic005G121700 Sobic005G121700 Sobic008G077300--Sobic005G121700 Sobic008G077300--Sobic006G030200 Sobic008G077300--Sobic007G208100 Sobic008G077300--Sobic002G016400 Sobic004G297950 Sobic004G297950 Sobic008G077300--Sobic004G297950 Sobic004G156900 Sobic004G156900 Sobic008G077300--Sobic004G156900 Sobic003G151900--Sobic001G514300 Sobic003G151900--Sobic005G231300 Sobic003G151900--Sobic008G135300 Sobic003G151900--Sobic008G099100 Sobic003G151900--Sobic001G314000 Sobic003G151900--Sobic006G119000 Sobic003G151900--Sobic008G077300 Sobic003G151900--Sobic006G201000 Sobic003G151900--Sobic007G154200
Octagon: transcription factors


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