Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G140900.1
Synonym Sb08g019160
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YQD4
Pfam PF12442
Panther DB PTHR33530 PTHR33530:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g53080.1 : hypothetical protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G268500 transporter family protein, putative, expressed -
2 Sobic.009G157450 - -
3 Sobic.009G071000 HAD superfamily phosphatase, putative, expressed -
4 Sobic.008G158332 - -
5 Sobic.006G227750 - -
6 Sobic.002G422300 ethylene-insensitive 3, putative, expressed K14514: ethylene-insensitive protein 3
7 Sobic.001G162233 - -
8 Sobic.006G026500 expressed protein -
9 Sobic.002G010900 expressed protein -
10 Sobic.005G011900 - -
11 Sobic.002G369600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@anthocyanidin 3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
12 Sobic.006G234900 expressed protein -
13 Sobic.001G539300 expressed protein -
14 Sobic.001G539300 expressed protein -
15 Sobic.001G539300 expressed protein -
16 Sobic.001G539300 expressed protein -
17 Sobic.001G539300 expressed protein -
18 Sobic.001G539300 expressed protein -
19 Sobic.002G044600 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G156400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G140900 Sobic008G140900 Sobic006G268500 Sobic006G268500 Sobic008G140900--Sobic006G268500 Sobic009G157450 Sobic009G157450 Sobic008G140900--Sobic009G157450 Sobic009G071000 Sobic009G071000 Sobic008G140900--Sobic009G071000 Sobic008G158332 Sobic008G158332 Sobic008G140900--Sobic008G158332 Sobic006G227750 Sobic006G227750 Sobic008G140900--Sobic006G227750 Sobic002G422300 Sobic002G422300 Sobic008G140900--Sobic002G422300 Sobic001G162233 Sobic001G162233 Sobic008G140900--Sobic001G162233 Sobic006G026500 Sobic006G026500 Sobic008G140900--Sobic006G026500 Sobic002G010900 Sobic002G010900 Sobic008G140900--Sobic002G010900 Sobic006G268500--Sobic009G071000 Sobic006G268500--Sobic008G140900 Sobic006G268500--Sobic009G157450 Sobic006G268500--Sobic006G227750 Sobic006G268500--Sobic008G158332 Sobic006G268500--Sobic002G422300 Sobic006G268500--Sobic002G010900 Sobic006G234900 Sobic006G234900 Sobic006G268500--Sobic006G234900 Sobic006G268500--Sobic006G026500 Sobic009G157450--Sobic008G140900 Sobic009G157450--Sobic006G268500 Sobic009G157450--Sobic006G227750 Sobic009G157450--Sobic009G071000 Sobic009G157450--Sobic008G158332 Sobic009G157450--Sobic002G422300 Sobic009G157450--Sobic006G026500 Sobic009G157450--Sobic006G234900 Sobic009G157450--Sobic002G010900 Sobic009G071000--Sobic006G268500 Sobic009G071000--Sobic008G140900 Sobic009G071000--Sobic002G422300 Sobic009G071000--Sobic002G010900 Sobic009G071000--Sobic006G227750 Sobic009G071000--Sobic009G157450 Sobic009G071000--Sobic008G158332 Sobic009G071100 Sobic009G071100 Sobic009G071000--Sobic009G071100 Sobic009G071000--Sobic006G234900 Sobic008G158332--Sobic002G422300 Sobic008G158332--Sobic006G268500 Sobic001G114900 Sobic001G114900 Sobic008G158332--Sobic001G114900 Sobic008G158332--Sobic008G140900 Sobic008G158332--Sobic002G010900 Sobic008G027600 Sobic008G027600 Sobic008G158332--Sobic008G027600 Sobic008G158332--Sobic009G071000 Sobic010G043900 Sobic010G043900 Sobic008G158332--Sobic010G043900 Sobic003G073460 Sobic003G073460 Sobic008G158332--Sobic003G073460 Sobic006G227750--Sobic006G268500 Sobic006G227750--Sobic009G157450 Sobic006G227750--Sobic006G234900 Sobic006G227750--Sobic008G140900 Sobic006G227750--Sobic009G071000 Sobic006G227750--Sobic002G422300 Sobic005G108601 Sobic005G108601 Sobic006G227750--Sobic005G108601 Sobic006G227750--Sobic008G158332 Sobic006G227750--Sobic006G026500 Sobic002G422300--Sobic010G043900 Sobic002G422300--Sobic008G158332 Sobic002G422300--Sobic002G010900 Sobic002G422300--Sobic001G114900 Sobic002G422300--Sobic006G268500 Sobic002G422300--Sobic009G071000 Sobic002G422300--Sobic008G027600 Sobic006G101300 Sobic006G101300 Sobic002G422300--Sobic006G101300 Sobic003G026400 Sobic003G026400 Sobic002G422300--Sobic003G026400 Sobic004G292600 Sobic004G292600 Sobic001G162233--Sobic004G292600 Sobic005G011900 Sobic005G011900 Sobic001G162233--Sobic005G011900 Sobic008G158600 Sobic008G158600 Sobic001G162233--Sobic008G158600 Sobic002G012300 Sobic002G012300 Sobic001G162233--Sobic002G012300 Sobic010G156400 Sobic010G156400 Sobic001G162233--Sobic010G156400 Sobic008G158501 Sobic008G158501 Sobic001G162233--Sobic008G158501 Sobic001G539300 Sobic001G539300 Sobic001G162233--Sobic001G539300 Sobic006G026500--Sobic006G234900 Sobic006G026500--Sobic006G101300 Sobic002G044600 Sobic002G044600 Sobic006G026500--Sobic002G044600 Sobic006G026500--Sobic002G422300 Sobic001G188800 Sobic001G188800 Sobic006G026500--Sobic001G188800 Sobic006G026500--Sobic002G010900 Sobic001G062132 Sobic001G062132 Sobic006G026500--Sobic001G062132 Sobic006G026500--Sobic002G012300 Sobic006G026500--Sobic008G140900 Sobic002G010900--Sobic001G114900 Sobic005G110454 Sobic005G110454 Sobic002G010900--Sobic005G110454 Sobic002G010900--Sobic002G422300 Sobic005G110451 Sobic005G110451 Sobic002G010900--Sobic005G110451 Sobic008G022000 Sobic008G022000 Sobic002G010900--Sobic008G022000 Sobic002G010900--Sobic006G101300 Sobic005G177600 Sobic005G177600 Sobic002G010900--Sobic005G177600 Sobic002G010900--Sobic009G071000 Sobic002G010900--Sobic008G158332
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.