Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G227750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RF68
Pfam -
Panther DB PTHR10366 PTHR10366:SF288
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g53810.1 : leucoanthocyanidin reductase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G268500 transporter family protein, putative, expressed -
2 Sobic.009G157450 - -
3 Sobic.006G234900 expressed protein -
4 Sobic.008G140900 expressed protein -
5 Sobic.009G071000 HAD superfamily phosphatase, putative, expressed -
6 Sobic.002G422300 ethylene-insensitive 3, putative, expressed K14514: ethylene-insensitive protein 3
7 Sobic.005G108601 - -
8 Sobic.008G158332 - -
9 Sobic.006G026500 expressed protein -
10 Sobic.006G101300 expressed protein -
11 Sobic.006G214600 - -
12 Sobic.002G010900 expressed protein -
13 Sobic.001G062132 - -
14 Sobic.003G364950 - -
15 Sobic.002G115025 - -
16 Sobic.004G278400 DUF581 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.010G043900 expressed protein -
18 Sobic.010G036800 expressed protein -
19 Sobic.001G114900 - -
20 Sobic.007G063700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G227750 Sobic006G227750 Sobic006G268500 Sobic006G268500 Sobic006G227750--Sobic006G268500 Sobic009G157450 Sobic009G157450 Sobic006G227750--Sobic009G157450 Sobic006G234900 Sobic006G234900 Sobic006G227750--Sobic006G234900 Sobic008G140900 Sobic008G140900 Sobic006G227750--Sobic008G140900 Sobic009G071000 Sobic009G071000 Sobic006G227750--Sobic009G071000 Sobic002G422300 Sobic002G422300 Sobic006G227750--Sobic002G422300 Sobic005G108601 Sobic005G108601 Sobic006G227750--Sobic005G108601 Sobic008G158332 Sobic008G158332 Sobic006G227750--Sobic008G158332 Sobic006G026500 Sobic006G026500 Sobic006G227750--Sobic006G026500 Sobic006G268500--Sobic009G071000 Sobic006G268500--Sobic008G140900 Sobic006G268500--Sobic009G157450 Sobic006G268500--Sobic006G227750 Sobic006G268500--Sobic008G158332 Sobic006G268500--Sobic002G422300 Sobic002G010900 Sobic002G010900 Sobic006G268500--Sobic002G010900 Sobic006G268500--Sobic006G234900 Sobic006G268500--Sobic006G026500 Sobic009G157450--Sobic008G140900 Sobic009G157450--Sobic006G268500 Sobic009G157450--Sobic006G227750 Sobic009G157450--Sobic009G071000 Sobic009G157450--Sobic008G158332 Sobic009G157450--Sobic002G422300 Sobic009G157450--Sobic006G026500 Sobic009G157450--Sobic006G234900 Sobic009G157450--Sobic002G010900 Sobic006G234900--Sobic005G108601 Sobic006G101300 Sobic006G101300 Sobic006G234900--Sobic006G101300 Sobic002G115025 Sobic002G115025 Sobic006G234900--Sobic002G115025 Sobic006G234900--Sobic006G026500 Sobic003G418500 Sobic003G418500 Sobic006G234900--Sobic003G418500 Sobic001G256200 Sobic001G256200 Sobic006G234900--Sobic001G256200 Sobic002G042000 Sobic002G042000 Sobic006G234900--Sobic002G042000 Sobic002G093700 Sobic002G093700 Sobic006G234900--Sobic002G093700 Sobic006G234900--Sobic006G227750 Sobic008G140900--Sobic006G268500 Sobic008G140900--Sobic009G157450 Sobic008G140900--Sobic009G071000 Sobic008G140900--Sobic008G158332 Sobic008G140900--Sobic006G227750 Sobic008G140900--Sobic002G422300 Sobic001G162233 Sobic001G162233 Sobic008G140900--Sobic001G162233 Sobic008G140900--Sobic006G026500 Sobic008G140900--Sobic002G010900 Sobic009G071000--Sobic006G268500 Sobic009G071000--Sobic008G140900 Sobic009G071000--Sobic002G422300 Sobic009G071000--Sobic002G010900 Sobic009G071000--Sobic006G227750 Sobic009G071000--Sobic009G157450 Sobic009G071000--Sobic008G158332 Sobic009G071100 Sobic009G071100 Sobic009G071000--Sobic009G071100 Sobic009G071000--Sobic006G234900 Sobic010G043900 Sobic010G043900 Sobic002G422300--Sobic010G043900 Sobic002G422300--Sobic008G158332 Sobic002G422300--Sobic002G010900 Sobic001G114900 Sobic001G114900 Sobic002G422300--Sobic001G114900 Sobic002G422300--Sobic006G268500 Sobic002G422300--Sobic009G071000 Sobic008G027600 Sobic008G027600 Sobic002G422300--Sobic008G027600 Sobic002G422300--Sobic006G101300 Sobic003G026400 Sobic003G026400 Sobic002G422300--Sobic003G026400 Sobic005G108601--Sobic002G115025 Sobic005G108601--Sobic006G234900 Sobic005G108601--Sobic001G256200 Sobic005G108601--Sobic006G227750 Sobic005G108601--Sobic006G101300 Sobic006G217900 Sobic006G217900 Sobic005G108601--Sobic006G217900 Sobic005G108601--Sobic002G093700 Sobic001G054500 Sobic001G054500 Sobic005G108601--Sobic001G054500 Sobic005G108601--Sobic002G042000 Sobic008G158332--Sobic002G422300 Sobic008G158332--Sobic006G268500 Sobic008G158332--Sobic001G114900 Sobic008G158332--Sobic008G140900 Sobic008G158332--Sobic002G010900 Sobic008G158332--Sobic008G027600 Sobic008G158332--Sobic009G071000 Sobic008G158332--Sobic010G043900 Sobic003G073460 Sobic003G073460 Sobic008G158332--Sobic003G073460 Sobic006G026500--Sobic006G234900 Sobic006G026500--Sobic006G101300 Sobic002G044600 Sobic002G044600 Sobic006G026500--Sobic002G044600 Sobic006G026500--Sobic002G422300 Sobic001G188800 Sobic001G188800 Sobic006G026500--Sobic001G188800 Sobic006G026500--Sobic002G010900 Sobic001G062132 Sobic001G062132 Sobic006G026500--Sobic001G062132 Sobic002G012300 Sobic002G012300 Sobic006G026500--Sobic002G012300 Sobic006G026500--Sobic008G140900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.