Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G108601.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RI34
Pfam PF00098
Panther DB PTHR23002 PTHR23002:SF63
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0003676nucleic acid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G55340 : phragmoplastin interacting protein 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g45890.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G115025 - -
2 Sobic.006G234900 expressed protein -
3 Sobic.001G256200 expressed protein -
4 Sobic.006G227750 - -
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10 Sobic.006G214600 - -
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12 Sobic.006G268500 transporter family protein, putative, expressed -
13 Sobic.003G418500 OsGrx_C6 - glutaredoxin subgroup III, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3
14 Sobic.002G422300 ethylene-insensitive 3, putative, expressed K14514: ethylene-insensitive protein 3
15 Sobic.007G144501 - -
16 Sobic.004G045400 60S ribosomal protein L37a, putative, expressed K02921: RP-L37Ae, large subunit ribosomal protein L37Ae
17 Sobic.010G043900 expressed protein -
18 Sobic.003G364950 - -
19 Sobic.008G158332 - -
20 Sobic.010G156500 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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