Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G026500.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PJQ4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g11050.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G234900 expressed protein -
2 Sobic.006G101300 expressed protein -
3 Sobic.002G044600 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G422300 ethylene-insensitive 3, putative, expressed K14514: ethylene-insensitive protein 3
5 Sobic.001G188800 cysteine-rich repeat secretory protein 55 precursor, putative, expressed -
6 Sobic.002G010900 expressed protein -
7 Sobic.001G062132 - -
8 Sobic.002G012300 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.008G140900 expressed protein -
10 Sobic.008G022000 Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative, expressed K05928: tocopherol O-methyltransferase
11 Sobic.008G066200 expressed protein -
12 Sobic.006G227750 - -
13 Sobic.003G418500 OsGrx_C6 - glutaredoxin subgroup III, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3
14 Sobic.006G268500 transporter family protein, putative, expressed -
15 Sobic.006G101100 expressed protein -
16 Sobic.008G036800 alkylresorcinol synthase gene preferentially expressed in root hair (PubMedID : 20348430)@Chalcone and stilbene synthase family("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@chalcone synthase, putative, expressed -
17 Sobic.005G108601 - -
18 Sobic.001G162233 - -
19 Sobic.009G157450 - -
20 Sobic.006G008000 O-methyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G026500 Sobic006G026500 Sobic006G234900 Sobic006G234900 Sobic006G026500--Sobic006G234900 Sobic006G101300 Sobic006G101300 Sobic006G026500--Sobic006G101300 Sobic002G044600 Sobic002G044600 Sobic006G026500--Sobic002G044600 Sobic002G422300 Sobic002G422300 Sobic006G026500--Sobic002G422300 Sobic001G188800 Sobic001G188800 Sobic006G026500--Sobic001G188800 Sobic002G010900 Sobic002G010900 Sobic006G026500--Sobic002G010900 Sobic001G062132 Sobic001G062132 Sobic006G026500--Sobic001G062132 Sobic002G012300 Sobic002G012300 Sobic006G026500--Sobic002G012300 Sobic008G140900 Sobic008G140900 Sobic006G026500--Sobic008G140900 Sobic005G108601 Sobic005G108601 Sobic006G234900--Sobic005G108601 Sobic006G234900--Sobic006G101300 Sobic002G115025 Sobic002G115025 Sobic006G234900--Sobic002G115025 Sobic006G234900--Sobic006G026500 Sobic003G418500 Sobic003G418500 Sobic006G234900--Sobic003G418500 Sobic001G256200 Sobic001G256200 Sobic006G234900--Sobic001G256200 Sobic002G042000 Sobic002G042000 Sobic006G234900--Sobic002G042000 Sobic002G093700 Sobic002G093700 Sobic006G234900--Sobic002G093700 Sobic006G227750 Sobic006G227750 Sobic006G234900--Sobic006G227750 Sobic006G101300--Sobic006G234900 Sobic006G101100 Sobic006G101100 Sobic006G101300--Sobic006G101100 Sobic006G101300--Sobic002G042000 Sobic006G101300--Sobic006G026500 Sobic008G066200 Sobic008G066200 Sobic006G101300--Sobic008G066200 Sobic004G169300 Sobic004G169300 Sobic006G101300--Sobic004G169300 Sobic007G008000 Sobic007G008000 Sobic006G101300--Sobic007G008000 Sobic008G022000 Sobic008G022000 Sobic006G101300--Sobic008G022000 Sobic006G101300--Sobic003G418500 Sobic008G036800 Sobic008G036800 Sobic002G044600--Sobic008G036800 Sobic002G044600--Sobic006G026500 Sobic002G044600--Sobic001G062132 Sobic002G044600--Sobic002G012300 Sobic002G044600--Sobic006G234900 Sobic002G044600--Sobic006G101300 Sobic008G158501 Sobic008G158501 Sobic002G044600--Sobic008G158501 Sobic008G158600 Sobic008G158600 Sobic002G044600--Sobic008G158600 Sobic002G044600--Sobic008G022000 Sobic010G043900 Sobic010G043900 Sobic002G422300--Sobic010G043900 Sobic008G158332 Sobic008G158332 Sobic002G422300--Sobic008G158332 Sobic002G422300--Sobic002G010900 Sobic001G114900 Sobic001G114900 Sobic002G422300--Sobic001G114900 Sobic006G268500 Sobic006G268500 Sobic002G422300--Sobic006G268500 Sobic009G071000 Sobic009G071000 Sobic002G422300--Sobic009G071000 Sobic008G027600 Sobic008G027600 Sobic002G422300--Sobic008G027600 Sobic002G422300--Sobic006G101300 Sobic003G026400 Sobic003G026400 Sobic002G422300--Sobic003G026400 Sobic006G008000 Sobic006G008000 Sobic001G188800--Sobic006G008000 Sobic001G188800--Sobic008G066200 Sobic005G086600 Sobic005G086600 Sobic001G188800--Sobic005G086600 Sobic003G079200 Sobic003G079200 Sobic001G188800--Sobic003G079200 Sobic001G188800--Sobic002G012300 Sobic001G188800--Sobic008G022000 Sobic004G161751 Sobic004G161751 Sobic001G188800--Sobic004G161751 Sobic002G012500 Sobic002G012500 Sobic001G188800--Sobic002G012500 Sobic001G188800--Sobic001G114900 Sobic002G010900--Sobic001G114900 Sobic005G110454 Sobic005G110454 Sobic002G010900--Sobic005G110454 Sobic002G010900--Sobic002G422300 Sobic005G110451 Sobic005G110451 Sobic002G010900--Sobic005G110451 Sobic002G010900--Sobic008G022000 Sobic002G010900--Sobic006G101300 Sobic005G177600 Sobic005G177600 Sobic002G010900--Sobic005G177600 Sobic002G010900--Sobic009G071000 Sobic002G010900--Sobic008G158332 Sobic001G062132--Sobic002G044600 Sobic001G062132--Sobic006G026500 Sobic001G062132--Sobic006G101300 Sobic001G062132--Sobic006G234900 Sobic008G026000 Sobic008G026000 Sobic001G062132--Sobic008G026000 Sobic006G198000 Sobic006G198000 Sobic001G062132--Sobic006G198000 Sobic001G062132--Sobic008G036800 Sobic001G062132--Sobic006G101100 Sobic001G162233 Sobic001G162233 Sobic001G062132--Sobic001G162233 Sobic002G012300--Sobic008G158600 Sobic002G012300--Sobic008G158501 Sobic002G012300--Sobic008G022000 Sobic002G012300--Sobic003G079200 Sobic002G012300--Sobic006G008000 Sobic002G012300--Sobic002G012500 Sobic002G012300--Sobic008G066200 Sobic002G012300--Sobic008G036800 Sobic002G063800 Sobic002G063800 Sobic002G012300--Sobic002G063800 Sobic008G140900--Sobic006G268500 Sobic009G157450 Sobic009G157450 Sobic008G140900--Sobic009G157450 Sobic008G140900--Sobic009G071000 Sobic008G140900--Sobic008G158332 Sobic008G140900--Sobic006G227750 Sobic008G140900--Sobic002G422300 Sobic008G140900--Sobic001G162233 Sobic008G140900--Sobic006G026500 Sobic008G140900--Sobic002G010900
Octagon: transcription factors


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