Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G188800.1
Synonym Sb01g016580
Functional annotation cysteine-rich repeat secretory protein 55 precursor, putative, expressed
UniProt C5WV83
Pfam PF01657
Panther DB PTHR32099 PTHR32099:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G22060 : Receptor-like protein kinase-related family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g36650.1 : cysteine-rich repeat secretory protein 55 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a006242
Brachypodium KQK14300
Barley HORVU3Hr1G052170.1 , HORVU5Hr1G018110.1 , HORVU2Hr1G108130.1 , HORVU4Hr1G085990.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G008000 O-methyltransferase, putative, expressed -
2 Sobic.008G066200 expressed protein -
3 Sobic.005G086600 O-methyltransferase, putative, expressed -
4 Sobic.003G079200 - -
5 Sobic.002G012300 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.008G022000 Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative, expressed K05928: tocopherol O-methyltransferase
7 Sobic.004G161751 - -
8 Sobic.002G012500 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.001G114900 - -
10 Sobic.008G158501 - -
11 Sobic.002G294000 purine permease, putative, expressed -
12 Sobic.006G235000 expressed protein -
13 Sobic.003G313100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G064200 MYB family transcription factor, putative, expressed -
15 Sobic.009G145700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
16 Sobic.009G145600 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
17 Sobic.010G082600 EF hand family protein, putative, expressed -
18 Sobic.008G066401 - -
19 Sobic.001G259400 tran- scriptional repressor JASMONATE ZIM-DOMAIN(PubMedID : 25711704)@ZIM domain containing protein, putative, expressed K13464: jasmonate ZIM domain-containing protein
20 Sobic.008G158600 LTPL112 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G188800 Sobic001G188800 Sobic006G008000 Sobic006G008000 Sobic001G188800--Sobic006G008000 Sobic008G066200 Sobic008G066200 Sobic001G188800--Sobic008G066200 Sobic005G086600 Sobic005G086600 Sobic001G188800--Sobic005G086600 Sobic003G079200 Sobic003G079200 Sobic001G188800--Sobic003G079200 Sobic002G012300 Sobic002G012300 Sobic001G188800--Sobic002G012300 Sobic008G022000 Sobic008G022000 Sobic001G188800--Sobic008G022000 Sobic004G161751 Sobic004G161751 Sobic001G188800--Sobic004G161751 Sobic002G012500 Sobic002G012500 Sobic001G188800--Sobic002G012500 Sobic001G114900 Sobic001G114900 Sobic001G188800--Sobic001G114900 Sobic006G008000--Sobic008G066200 Sobic006G008000--Sobic002G012500 Sobic006G008000--Sobic003G079200 Sobic006G008000--Sobic005G086600 Sobic006G008000--Sobic002G012300 Sobic009G145600 Sobic009G145600 Sobic006G008000--Sobic009G145600 Sobic009G145700 Sobic009G145700 Sobic006G008000--Sobic009G145700 Sobic006G008000--Sobic008G022000 Sobic008G066401 Sobic008G066401 Sobic006G008000--Sobic008G066401 Sobic008G066200--Sobic006G008000 Sobic008G066200--Sobic002G012500 Sobic008G066200--Sobic009G145700 Sobic008G066200--Sobic003G079200 Sobic008G066200--Sobic009G145600 Sobic008G066200--Sobic008G066401 Sobic008G066200--Sobic008G022000 Sobic008G066200--Sobic002G012300 Sobic008G066200--Sobic001G188800 Sobic005G086600--Sobic006G008000 Sobic003G268600 Sobic003G268600 Sobic005G086600--Sobic003G268600 Sobic003G073380 Sobic003G073380 Sobic005G086600--Sobic003G073380 Sobic005G086600--Sobic003G079200 Sobic006G235100 Sobic006G235100 Sobic005G086600--Sobic006G235100 Sobic006G007900 Sobic006G007900 Sobic005G086600--Sobic006G007900 Sobic003G442100 Sobic003G442100 Sobic005G086600--Sobic003G442100 Sobic005G086600--Sobic004G161751 Sobic001G259400 Sobic001G259400 Sobic005G086600--Sobic001G259400 Sobic003G079200--Sobic006G008000 Sobic003G079200--Sobic008G066200 Sobic003G079200--Sobic002G012300 Sobic003G079200--Sobic009G145600 Sobic008G158600 Sobic008G158600 Sobic003G079200--Sobic008G158600 Sobic003G079200--Sobic002G012500 Sobic002G063800 Sobic002G063800 Sobic003G079200--Sobic002G063800 Sobic003G079200--Sobic004G161751 Sobic003G079200--Sobic005G086600 Sobic002G012300--Sobic008G158600 Sobic008G158501 Sobic008G158501 Sobic002G012300--Sobic008G158501 Sobic002G012300--Sobic008G022000 Sobic002G012300--Sobic003G079200 Sobic002G012300--Sobic006G008000 Sobic002G012300--Sobic002G012500 Sobic002G012300--Sobic008G066200 Sobic008G036800 Sobic008G036800 Sobic002G012300--Sobic008G036800 Sobic002G012300--Sobic002G063800 Sobic008G022000--Sobic002G012300 Sobic008G022000--Sobic006G008000 Sobic008G022000--Sobic008G066200 Sobic008G022000--Sobic002G012500 Sobic008G022000--Sobic008G158501 Sobic008G022000--Sobic003G079200 Sobic008G022000--Sobic008G158600 Sobic008G022000--Sobic008G036800 Sobic003G426600 Sobic003G426600 Sobic008G022000--Sobic003G426600 Sobic004G161751--Sobic003G079200 Sobic004G161751--Sobic003G073380 Sobic004G161751--Sobic005G086600 Sobic004G161751--Sobic006G008000 Sobic009G145500 Sobic009G145500 Sobic004G161751--Sobic009G145500 Sobic004G161751--Sobic009G145600 Sobic004G161751--Sobic002G063800 Sobic006G235000 Sobic006G235000 Sobic004G161751--Sobic006G235000 Sobic003G043600 Sobic003G043600 Sobic004G161751--Sobic003G043600 Sobic002G012500--Sobic006G008000 Sobic002G012500--Sobic001G259400 Sobic002G012500--Sobic008G066200 Sobic002G012500--Sobic002G012300 Sobic002G012500--Sobic008G066401 Sobic002G012500--Sobic003G079200 Sobic002G012500--Sobic008G022000 Sobic002G012500--Sobic008G158600 Sobic002G012500--Sobic009G145600 Sobic003G026400 Sobic003G026400 Sobic001G114900--Sobic003G026400 Sobic008G027600 Sobic008G027600 Sobic001G114900--Sobic008G027600 Sobic002G010900 Sobic002G010900 Sobic001G114900--Sobic002G010900 Sobic002G369400 Sobic002G369400 Sobic001G114900--Sobic002G369400 Sobic001G114900--Sobic008G022000 Sobic001G114900--Sobic006G008000 Sobic002G422300 Sobic002G422300 Sobic001G114900--Sobic002G422300 Sobic008G158332 Sobic008G158332 Sobic001G114900--Sobic008G158332 Sobic001G114900--Sobic008G066200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.