Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G235000.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PNJ7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g54620.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G063800 transferase family protein, putative, expressed -
2 Sobic.009G145500 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
3 Sobic.009G145600 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
4 Sobic.003G268600 - -
5 Sobic.010G062300 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
6 Sobic.009G184100 - -
7 Sobic.005G086600 O-methyltransferase, putative, expressed -
8 Sobic.003G079200 - -
9 Sobic.006G008000 O-methyltransferase, putative, expressed -
10 Sobic.008G066401 - -
11 Sobic.004G161751 - -
12 Sobic.003G269000 STE_MEKK_ste11_MAP3K.7 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed -
13 Sobic.009G145700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
14 Sobic.003G073380 - -
15 Sobic.004G245700 expressed protein -
16 Sobic.001G330400 ZOS3-11 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
17 Sobic.003G064200 MYB family transcription factor, putative, expressed -
18 Sobic.008G066200 expressed protein -
19 Sobic.006G010100 terpene synthase, putative, expressed -
20 Sobic.003G043600 BAHD acyl transferase(PubMedID : 28944535)@transferase family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G235000 Sobic006G235000 Sobic002G063800 Sobic002G063800 Sobic006G235000--Sobic002G063800 Sobic009G145500 Sobic009G145500 Sobic006G235000--Sobic009G145500 Sobic009G145600 Sobic009G145600 Sobic006G235000--Sobic009G145600 Sobic003G268600 Sobic003G268600 Sobic006G235000--Sobic003G268600 Sobic010G062300 Sobic010G062300 Sobic006G235000--Sobic010G062300 Sobic009G184100 Sobic009G184100 Sobic006G235000--Sobic009G184100 Sobic005G086600 Sobic005G086600 Sobic006G235000--Sobic005G086600 Sobic003G079200 Sobic003G079200 Sobic006G235000--Sobic003G079200 Sobic006G008000 Sobic006G008000 Sobic006G235000--Sobic006G008000 Sobic002G063800--Sobic003G079200 Sobic002G063800--Sobic006G235000 Sobic002G063800--Sobic010G062300 Sobic002G063800--Sobic006G008000 Sobic002G012300 Sobic002G012300 Sobic002G063800--Sobic002G012300 Sobic008G158600 Sobic008G158600 Sobic002G063800--Sobic008G158600 Sobic002G063800--Sobic009G145600 Sobic002G063800--Sobic005G086600 Sobic002G012500 Sobic002G012500 Sobic002G063800--Sobic002G012500 Sobic003G043600 Sobic003G043600 Sobic009G145500--Sobic003G043600 Sobic003G073380 Sobic003G073380 Sobic009G145500--Sobic003G073380 Sobic004G148200 Sobic004G148200 Sobic009G145500--Sobic004G148200 Sobic001G231400 Sobic001G231400 Sobic009G145500--Sobic001G231400 Sobic009G145500--Sobic003G268600 Sobic002G338500 Sobic002G338500 Sobic009G145500--Sobic002G338500 Sobic009G145500--Sobic006G235000 Sobic009G145500--Sobic009G145600 Sobic006G268800 Sobic006G268800 Sobic009G145500--Sobic006G268800 Sobic009G145700 Sobic009G145700 Sobic009G145600--Sobic009G145700 Sobic008G066401 Sobic008G066401 Sobic009G145600--Sobic008G066401 Sobic008G066200 Sobic008G066200 Sobic009G145600--Sobic008G066200 Sobic009G145600--Sobic003G079200 Sobic009G145600--Sobic006G008000 Sobic003G043500 Sobic003G043500 Sobic009G145600--Sobic003G043500 Sobic004G245700 Sobic004G245700 Sobic009G145600--Sobic004G245700 Sobic009G145600--Sobic002G012500 Sobic009G200566 Sobic009G200566 Sobic009G145600--Sobic009G200566 Sobic003G442100 Sobic003G442100 Sobic003G268600--Sobic003G442100 Sobic001G330400 Sobic001G330400 Sobic003G268600--Sobic001G330400 Sobic003G268600--Sobic003G043600 Sobic006G075400 Sobic006G075400 Sobic003G268600--Sobic006G075400 Sobic003G268600--Sobic005G086600 Sobic007G017500 Sobic007G017500 Sobic003G268600--Sobic007G017500 Sobic003G268600--Sobic008G066401 Sobic003G064200 Sobic003G064200 Sobic003G268600--Sobic003G064200 Sobic003G268600--Sobic009G145500 Sobic010G062300--Sobic002G063800 Sobic010G062300--Sobic006G235000 Sobic010G062300--Sobic006G008000 Sobic010G062300--Sobic009G145600 Sobic010G062300--Sobic003G079200 Sobic002G369400 Sobic002G369400 Sobic010G062300--Sobic002G369400 Sobic010G062300--Sobic009G145500 Sobic004G161751 Sobic004G161751 Sobic010G062300--Sobic004G161751 Sobic010G062300--Sobic005G086600 Sobic009G184100--Sobic009G145700 Sobic009G184100--Sobic008G066401 Sobic001G318700 Sobic001G318700 Sobic009G184100--Sobic001G318700 Sobic001G112200 Sobic001G112200 Sobic009G184100--Sobic001G112200 Sobic009G184100--Sobic003G064200 Sobic009G184100--Sobic006G235000 Sobic009G184100--Sobic009G145600 Sobic009G184000 Sobic009G184000 Sobic009G184100--Sobic009G184000 Sobic009G184100--Sobic003G268600 Sobic005G086600--Sobic006G008000 Sobic005G086600--Sobic003G268600 Sobic005G086600--Sobic003G073380 Sobic005G086600--Sobic003G079200 Sobic006G235100 Sobic006G235100 Sobic005G086600--Sobic006G235100 Sobic006G007900 Sobic006G007900 Sobic005G086600--Sobic006G007900 Sobic005G086600--Sobic003G442100 Sobic005G086600--Sobic004G161751 Sobic001G259400 Sobic001G259400 Sobic005G086600--Sobic001G259400 Sobic003G079200--Sobic006G008000 Sobic003G079200--Sobic008G066200 Sobic003G079200--Sobic002G012300 Sobic003G079200--Sobic009G145600 Sobic003G079200--Sobic008G158600 Sobic003G079200--Sobic002G012500 Sobic003G079200--Sobic002G063800 Sobic003G079200--Sobic004G161751 Sobic003G079200--Sobic005G086600 Sobic006G008000--Sobic008G066200 Sobic006G008000--Sobic002G012500 Sobic006G008000--Sobic003G079200 Sobic006G008000--Sobic005G086600 Sobic006G008000--Sobic002G012300 Sobic006G008000--Sobic009G145600 Sobic006G008000--Sobic009G145700 Sobic008G022000 Sobic008G022000 Sobic006G008000--Sobic008G022000 Sobic006G008000--Sobic008G066401
Octagon: transcription factors


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