Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G245700.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YRI3
Pfam -
Panther DB PTHR35547 PTHR35547:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g50400.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G145600 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
2 Sobic.009G145700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
3 Sobic.008G066401 - -
4 Sobic.003G043500 - -
5 Sobic.009G184100 - -
6 Sobic.009G200566 - -
7 Sobic.009G145500 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
8 Sobic.006G054800 "glycerophosphodiester phosphodiesterase, up-regulated under drought stress, involved in the final step of the choline biosynthesis pathway, mapped into a QTL involved in stay green (QSTG1_6) "(PubMedID : 24655390)@Glycerophosphodiester phosphodiesterase ( At)(PubMedID : 27208977)@glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein, putative, expressed -
9 Sobic.001G318700 glutathione S-transferase GSTU6, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
10 Sobic.006G235000 expressed protein -
11 Sobic.008G139600 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
12 Sobic.004G141100 Inositol 1, 3, 4-trisphosphate 5/6-kinase, putative, expressed K00913: inositol-1,3,4-trisphosphate 5/6-kinase / inositol-tetrakisphosphate 1-kinase
13 Sobic.003G268600 - -
14 Sobic.003G043600 BAHD acyl transferase(PubMedID : 28944535)@transferase family protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G259300 transferase family protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G426400 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
17 Sobic.004G041900 apoptosis-inducing factor 2, putative, expressed -
18 Sobic.009G184000 ICE-like protease p20 domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G112200 LTPL118 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
20 Sobic.010G210100 "GW6(Ortholog in rice:Song et al., 2015)"(PubMedID : 31659936)@HLS, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G245700 Sobic004G245700 Sobic009G145600 Sobic009G145600 Sobic004G245700--Sobic009G145600 Sobic009G145700 Sobic009G145700 Sobic004G245700--Sobic009G145700 Sobic008G066401 Sobic008G066401 Sobic004G245700--Sobic008G066401 Sobic003G043500 Sobic003G043500 Sobic004G245700--Sobic003G043500 Sobic009G184100 Sobic009G184100 Sobic004G245700--Sobic009G184100 Sobic009G200566 Sobic009G200566 Sobic004G245700--Sobic009G200566 Sobic009G145500 Sobic009G145500 Sobic004G245700--Sobic009G145500 Sobic006G054800 Sobic006G054800 Sobic004G245700--Sobic006G054800 Sobic001G318700 Sobic001G318700 Sobic004G245700--Sobic001G318700 Sobic009G145600--Sobic009G145700 Sobic009G145600--Sobic008G066401 Sobic008G066200 Sobic008G066200 Sobic009G145600--Sobic008G066200 Sobic003G079200 Sobic003G079200 Sobic009G145600--Sobic003G079200 Sobic006G008000 Sobic006G008000 Sobic009G145600--Sobic006G008000 Sobic009G145600--Sobic003G043500 Sobic009G145600--Sobic004G245700 Sobic002G012500 Sobic002G012500 Sobic009G145600--Sobic002G012500 Sobic009G145600--Sobic009G200566 Sobic009G145700--Sobic009G145600 Sobic009G145700--Sobic008G066401 Sobic009G145700--Sobic008G066200 Sobic009G145700--Sobic006G008000 Sobic001G112200 Sobic001G112200 Sobic009G145700--Sobic001G112200 Sobic003G043600 Sobic003G043600 Sobic009G145700--Sobic003G043600 Sobic009G145700--Sobic003G043500 Sobic009G184000 Sobic009G184000 Sobic009G145700--Sobic009G184000 Sobic009G145700--Sobic003G079200 Sobic008G066401--Sobic009G145700 Sobic008G066401--Sobic009G145600 Sobic008G066401--Sobic008G066200 Sobic008G066401--Sobic002G012500 Sobic007G169700 Sobic007G169700 Sobic008G066401--Sobic007G169700 Sobic008G066401--Sobic009G184000 Sobic008G066401--Sobic006G008000 Sobic008G066401--Sobic003G043500 Sobic003G362700 Sobic003G362700 Sobic008G066401--Sobic003G362700 Sobic003G043500--Sobic009G145600 Sobic003G043500--Sobic008G066401 Sobic003G043500--Sobic009G145700 Sobic003G043500--Sobic006G054800 Sobic003G043500--Sobic007G169700 Sobic008G139600 Sobic008G139600 Sobic003G043500--Sobic008G139600 Sobic003G043500--Sobic004G245700 Sobic003G043500--Sobic001G112200 Sobic003G043500--Sobic009G184000 Sobic009G184100--Sobic009G145700 Sobic009G184100--Sobic008G066401 Sobic009G184100--Sobic001G318700 Sobic009G184100--Sobic001G112200 Sobic003G064200 Sobic003G064200 Sobic009G184100--Sobic003G064200 Sobic006G235000 Sobic006G235000 Sobic009G184100--Sobic006G235000 Sobic009G184100--Sobic009G145600 Sobic009G184100--Sobic009G184000 Sobic003G268600 Sobic003G268600 Sobic009G184100--Sobic003G268600 Sobic009G200566--Sobic009G145700 Sobic009G200566--Sobic009G145600 Sobic009G200566--Sobic001G112200 Sobic008G158800 Sobic008G158800 Sobic009G200566--Sobic008G158800 Sobic009G200566--Sobic008G066401 Sobic009G200566--Sobic009G184100 Sobic009G200566--Sobic004G245700 Sobic009G200566--Sobic008G066200 Sobic002G055700 Sobic002G055700 Sobic009G200566--Sobic002G055700 Sobic009G145500--Sobic003G043600 Sobic003G073380 Sobic003G073380 Sobic009G145500--Sobic003G073380 Sobic004G148200 Sobic004G148200 Sobic009G145500--Sobic004G148200 Sobic001G231400 Sobic001G231400 Sobic009G145500--Sobic001G231400 Sobic009G145500--Sobic003G268600 Sobic002G338500 Sobic002G338500 Sobic009G145500--Sobic002G338500 Sobic009G145500--Sobic006G235000 Sobic009G145500--Sobic009G145600 Sobic006G268800 Sobic006G268800 Sobic009G145500--Sobic006G268800 Sobic006G054800--Sobic008G139600 Sobic006G054800--Sobic003G043500 Sobic006G054800--Sobic009G145700 Sobic006G054800--Sobic007G169700 Sobic004G141100 Sobic004G141100 Sobic006G054800--Sobic004G141100 Sobic006G054800--Sobic009G145600 Sobic006G054800--Sobic001G112200 Sobic006G054800--Sobic008G066401 Sobic006G054800--Sobic009G184000 Sobic001G318700--Sobic001G112200 Sobic001G018300 Sobic001G018300 Sobic001G318700--Sobic001G018300 Sobic004G243100 Sobic004G243100 Sobic001G318700--Sobic004G243100 Sobic002G192000 Sobic002G192000 Sobic001G318700--Sobic002G192000 Sobic003G303100 Sobic003G303100 Sobic001G318700--Sobic003G303100 Sobic002G251000 Sobic002G251000 Sobic001G318700--Sobic002G251000 Sobic001G140900 Sobic001G140900 Sobic001G318700--Sobic001G140900 Sobic006G075400 Sobic006G075400 Sobic001G318700--Sobic006G075400 Sobic001G481100 Sobic001G481100 Sobic001G318700--Sobic001G481100
Octagon: transcription factors


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