Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G161751.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RMX9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g33070.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G079200 - -
2 Sobic.003G073380 - -
3 Sobic.005G086600 O-methyltransferase, putative, expressed -
4 Sobic.006G008000 O-methyltransferase, putative, expressed -
5 Sobic.009G145500 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
6 Sobic.009G145600 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
7 Sobic.002G063800 transferase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.006G235000 expressed protein -
9 Sobic.003G043600 BAHD acyl transferase(PubMedID : 28944535)@transferase family protein, putative, expressed -
10 Sobic.003G268600 - -
11 Sobic.009G145700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
12 Sobic.008G066200 expressed protein -
13 Sobic.006G154500 GEM, putative, expressed -
14 Sobic.010G062300 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
15 Sobic.002G012300 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.008G066401 - -
17 Sobic.006G240600 - -
18 Sobic.002G369400 Sulfotransferase family protein (At)(PubMedID : 27208977)@sulfotransferase domain containing protein, expressed -
19 Sobic.003G050300 peroxidases (PubMedID : 28944535)@peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
20 Sobic.002G338500 sugar transporter 1(PubMedID : 26465154)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@transporter family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G161751 Sobic004G161751 Sobic003G079200 Sobic003G079200 Sobic004G161751--Sobic003G079200 Sobic003G073380 Sobic003G073380 Sobic004G161751--Sobic003G073380 Sobic005G086600 Sobic005G086600 Sobic004G161751--Sobic005G086600 Sobic006G008000 Sobic006G008000 Sobic004G161751--Sobic006G008000 Sobic009G145500 Sobic009G145500 Sobic004G161751--Sobic009G145500 Sobic009G145600 Sobic009G145600 Sobic004G161751--Sobic009G145600 Sobic002G063800 Sobic002G063800 Sobic004G161751--Sobic002G063800 Sobic006G235000 Sobic006G235000 Sobic004G161751--Sobic006G235000 Sobic003G043600 Sobic003G043600 Sobic004G161751--Sobic003G043600 Sobic003G079200--Sobic006G008000 Sobic008G066200 Sobic008G066200 Sobic003G079200--Sobic008G066200 Sobic002G012300 Sobic002G012300 Sobic003G079200--Sobic002G012300 Sobic003G079200--Sobic009G145600 Sobic008G158600 Sobic008G158600 Sobic003G079200--Sobic008G158600 Sobic002G012500 Sobic002G012500 Sobic003G079200--Sobic002G012500 Sobic003G079200--Sobic002G063800 Sobic003G079200--Sobic004G161751 Sobic003G079200--Sobic005G086600 Sobic003G269000 Sobic003G269000 Sobic003G073380--Sobic003G269000 Sobic003G073380--Sobic005G086600 Sobic003G073380--Sobic004G161751 Sobic003G073380--Sobic009G145500 Sobic003G268600 Sobic003G268600 Sobic003G073380--Sobic003G268600 Sobic003G073380--Sobic003G043600 Sobic001G330400 Sobic001G330400 Sobic003G073380--Sobic001G330400 Sobic003G050300 Sobic003G050300 Sobic003G073380--Sobic003G050300 Sobic003G073380--Sobic003G079200 Sobic005G086600--Sobic006G008000 Sobic005G086600--Sobic003G268600 Sobic005G086600--Sobic003G073380 Sobic005G086600--Sobic003G079200 Sobic006G235100 Sobic006G235100 Sobic005G086600--Sobic006G235100 Sobic006G007900 Sobic006G007900 Sobic005G086600--Sobic006G007900 Sobic003G442100 Sobic003G442100 Sobic005G086600--Sobic003G442100 Sobic005G086600--Sobic004G161751 Sobic001G259400 Sobic001G259400 Sobic005G086600--Sobic001G259400 Sobic006G008000--Sobic008G066200 Sobic006G008000--Sobic002G012500 Sobic006G008000--Sobic003G079200 Sobic006G008000--Sobic005G086600 Sobic006G008000--Sobic002G012300 Sobic006G008000--Sobic009G145600 Sobic009G145700 Sobic009G145700 Sobic006G008000--Sobic009G145700 Sobic008G022000 Sobic008G022000 Sobic006G008000--Sobic008G022000 Sobic008G066401 Sobic008G066401 Sobic006G008000--Sobic008G066401 Sobic009G145500--Sobic003G043600 Sobic009G145500--Sobic003G073380 Sobic004G148200 Sobic004G148200 Sobic009G145500--Sobic004G148200 Sobic001G231400 Sobic001G231400 Sobic009G145500--Sobic001G231400 Sobic009G145500--Sobic003G268600 Sobic002G338500 Sobic002G338500 Sobic009G145500--Sobic002G338500 Sobic009G145500--Sobic006G235000 Sobic009G145500--Sobic009G145600 Sobic006G268800 Sobic006G268800 Sobic009G145500--Sobic006G268800 Sobic009G145600--Sobic009G145700 Sobic009G145600--Sobic008G066401 Sobic009G145600--Sobic008G066200 Sobic009G145600--Sobic003G079200 Sobic009G145600--Sobic006G008000 Sobic003G043500 Sobic003G043500 Sobic009G145600--Sobic003G043500 Sobic004G245700 Sobic004G245700 Sobic009G145600--Sobic004G245700 Sobic009G145600--Sobic002G012500 Sobic009G200566 Sobic009G200566 Sobic009G145600--Sobic009G200566 Sobic002G063800--Sobic003G079200 Sobic002G063800--Sobic006G235000 Sobic010G062300 Sobic010G062300 Sobic002G063800--Sobic010G062300 Sobic002G063800--Sobic006G008000 Sobic002G063800--Sobic002G012300 Sobic002G063800--Sobic008G158600 Sobic002G063800--Sobic009G145600 Sobic002G063800--Sobic005G086600 Sobic002G063800--Sobic002G012500 Sobic006G235000--Sobic002G063800 Sobic006G235000--Sobic009G145500 Sobic006G235000--Sobic009G145600 Sobic006G235000--Sobic003G268600 Sobic006G235000--Sobic010G062300 Sobic009G184100 Sobic009G184100 Sobic006G235000--Sobic009G184100 Sobic006G235000--Sobic005G086600 Sobic006G235000--Sobic003G079200 Sobic006G235000--Sobic006G008000 Sobic003G043600--Sobic002G338500 Sobic003G043600--Sobic009G145500 Sobic003G043600--Sobic003G268600 Sobic006G075400 Sobic006G075400 Sobic003G043600--Sobic006G075400 Sobic003G043600--Sobic003G442100 Sobic001G310600 Sobic001G310600 Sobic003G043600--Sobic001G310600 Sobic009G184000 Sobic009G184000 Sobic003G043600--Sobic009G184000 Sobic003G043600--Sobic009G145700 Sobic001G318700 Sobic001G318700 Sobic003G043600--Sobic001G318700
Octagon: transcription factors


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