Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G079200.1,Sobic.003G079200.2
Synonym Sb03g006680
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q1X9 , A0A1B6Q1Y1
Pfam PF00117
Panther DB PTHR11922 PTHR11922:SF38
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G38200 : Class I glutamine amidotransferase-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g04620.3,LOC_Os01g04620.1 : transposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a005402 , Zm00025a005403 , Zm00025a005400 , Zm00025a005401 , Zm00025a035587
Brachypodium KQK02594
Barley HORVU3Hr1G007960.2 , HORVU3Hr1G007960.1 , HORVU3Hr1G007940.1 , HORVU3Hr1G007970.4 , HORVU3Hr1G007970.5 , HORVU3Hr1G007970.1 , HORVU3Hr1G007970.2 , HORVU3Hr1G007970.3
Wheat TraesCS3D02G050200 , TraesCS3A02G050500 , TraesCS3A02G050700 , TraesCS3B02G059300 , TraesCS3B02G059500 , TraesCS3D02G050100
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G008000 O-methyltransferase, putative, expressed -
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20 Sobic.001G188800 cysteine-rich repeat secretory protein 55 precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G079200 Sobic003G079200 Sobic006G008000 Sobic006G008000 Sobic003G079200--Sobic006G008000 Sobic008G066200 Sobic008G066200 Sobic003G079200--Sobic008G066200 Sobic002G012300 Sobic002G012300 Sobic003G079200--Sobic002G012300 Sobic009G145600 Sobic009G145600 Sobic003G079200--Sobic009G145600 Sobic008G158600 Sobic008G158600 Sobic003G079200--Sobic008G158600 Sobic002G012500 Sobic002G012500 Sobic003G079200--Sobic002G012500 Sobic002G063800 Sobic002G063800 Sobic003G079200--Sobic002G063800 Sobic004G161751 Sobic004G161751 Sobic003G079200--Sobic004G161751 Sobic005G086600 Sobic005G086600 Sobic003G079200--Sobic005G086600 Sobic006G008000--Sobic008G066200 Sobic006G008000--Sobic002G012500 Sobic006G008000--Sobic003G079200 Sobic006G008000--Sobic005G086600 Sobic006G008000--Sobic002G012300 Sobic006G008000--Sobic009G145600 Sobic009G145700 Sobic009G145700 Sobic006G008000--Sobic009G145700 Sobic008G022000 Sobic008G022000 Sobic006G008000--Sobic008G022000 Sobic008G066401 Sobic008G066401 Sobic006G008000--Sobic008G066401 Sobic008G066200--Sobic006G008000 Sobic008G066200--Sobic002G012500 Sobic008G066200--Sobic009G145700 Sobic008G066200--Sobic003G079200 Sobic008G066200--Sobic009G145600 Sobic008G066200--Sobic008G066401 Sobic008G066200--Sobic008G022000 Sobic008G066200--Sobic002G012300 Sobic001G188800 Sobic001G188800 Sobic008G066200--Sobic001G188800 Sobic002G012300--Sobic008G158600 Sobic008G158501 Sobic008G158501 Sobic002G012300--Sobic008G158501 Sobic002G012300--Sobic008G022000 Sobic002G012300--Sobic003G079200 Sobic002G012300--Sobic006G008000 Sobic002G012300--Sobic002G012500 Sobic002G012300--Sobic008G066200 Sobic008G036800 Sobic008G036800 Sobic002G012300--Sobic008G036800 Sobic002G012300--Sobic002G063800 Sobic009G145600--Sobic009G145700 Sobic009G145600--Sobic008G066401 Sobic009G145600--Sobic008G066200 Sobic009G145600--Sobic003G079200 Sobic009G145600--Sobic006G008000 Sobic003G043500 Sobic003G043500 Sobic009G145600--Sobic003G043500 Sobic004G245700 Sobic004G245700 Sobic009G145600--Sobic004G245700 Sobic009G145600--Sobic002G012500 Sobic009G200566 Sobic009G200566 Sobic009G145600--Sobic009G200566 Sobic008G158600--Sobic002G012300 Sobic008G158600--Sobic003G079200 Sobic008G158600--Sobic008G158501 Sobic008G158600--Sobic002G012500 Sobic008G158600--Sobic002G063800 Sobic008G158600--Sobic008G022000 Sobic008G158600--Sobic008G036800 Sobic008G158600--Sobic006G008000 Sobic001G259400 Sobic001G259400 Sobic008G158600--Sobic001G259400 Sobic002G012500--Sobic006G008000 Sobic002G012500--Sobic001G259400 Sobic002G012500--Sobic008G066200 Sobic002G012500--Sobic002G012300 Sobic002G012500--Sobic008G066401 Sobic002G012500--Sobic003G079200 Sobic002G012500--Sobic008G022000 Sobic002G012500--Sobic008G158600 Sobic002G012500--Sobic009G145600 Sobic002G063800--Sobic003G079200 Sobic006G235000 Sobic006G235000 Sobic002G063800--Sobic006G235000 Sobic010G062300 Sobic010G062300 Sobic002G063800--Sobic010G062300 Sobic002G063800--Sobic006G008000 Sobic002G063800--Sobic002G012300 Sobic002G063800--Sobic008G158600 Sobic002G063800--Sobic009G145600 Sobic002G063800--Sobic005G086600 Sobic002G063800--Sobic002G012500 Sobic004G161751--Sobic003G079200 Sobic003G073380 Sobic003G073380 Sobic004G161751--Sobic003G073380 Sobic004G161751--Sobic005G086600 Sobic004G161751--Sobic006G008000 Sobic009G145500 Sobic009G145500 Sobic004G161751--Sobic009G145500 Sobic004G161751--Sobic009G145600 Sobic004G161751--Sobic002G063800 Sobic004G161751--Sobic006G235000 Sobic003G043600 Sobic003G043600 Sobic004G161751--Sobic003G043600 Sobic005G086600--Sobic006G008000 Sobic003G268600 Sobic003G268600 Sobic005G086600--Sobic003G268600 Sobic005G086600--Sobic003G073380 Sobic005G086600--Sobic003G079200 Sobic006G235100 Sobic006G235100 Sobic005G086600--Sobic006G235100 Sobic006G007900 Sobic006G007900 Sobic005G086600--Sobic006G007900 Sobic003G442100 Sobic003G442100 Sobic005G086600--Sobic003G442100 Sobic005G086600--Sobic004G161751 Sobic005G086600--Sobic001G259400
Octagon: transcription factors


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