Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G073380.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VW45
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g05210.1 : hypothetical protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G269000 STE_MEKK_ste11_MAP3K.7 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed -
2 Sobic.005G086600 O-methyltransferase, putative, expressed -
3 Sobic.004G161751 - -
4 Sobic.009G145500 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
5 Sobic.003G268600 - -
6 Sobic.003G043600 BAHD acyl transferase(PubMedID : 28944535)@transferase family protein, putative, expressed -
7 Sobic.001G330400 ZOS3-11 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
8 Sobic.003G050300 peroxidases (PubMedID : 28944535)@peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
9 Sobic.003G079200 - -
10 Sobic.002G063800 transferase family protein, putative, expressed -
11 Sobic.006G235000 expressed protein -
12 Sobic.006G240600 - -
13 Sobic.009G186800 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G401100 pathogenesis-related Bet v I family protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G243000 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
16 Sobic.006G008000 O-methyltransferase, putative, expressed -
17 Sobic.003G442100 "Phylogenetic analysis of canonical DREB1 and DREB2 genes in sorghum with those genes in maize, rice, and Arabidopsis. "(PubMedID : 24086146)@Not investigated(PubMedID : 23766026)@dehydration-responsive element-binding protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G267600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@thaumatin, putative, expressed -
19 Sobic.009G145600 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
20 Sobic.006G154500 GEM, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G073380 Sobic003G073380 Sobic003G269000 Sobic003G269000 Sobic003G073380--Sobic003G269000 Sobic005G086600 Sobic005G086600 Sobic003G073380--Sobic005G086600 Sobic004G161751 Sobic004G161751 Sobic003G073380--Sobic004G161751 Sobic009G145500 Sobic009G145500 Sobic003G073380--Sobic009G145500 Sobic003G268600 Sobic003G268600 Sobic003G073380--Sobic003G268600 Sobic003G043600 Sobic003G043600 Sobic003G073380--Sobic003G043600 Sobic001G330400 Sobic001G330400 Sobic003G073380--Sobic001G330400 Sobic003G050300 Sobic003G050300 Sobic003G073380--Sobic003G050300 Sobic003G079200 Sobic003G079200 Sobic003G073380--Sobic003G079200 Sobic003G269000--Sobic003G073380 Sobic003G269000--Sobic005G086600 Sobic003G269000--Sobic003G268600 Sobic009G186800 Sobic009G186800 Sobic003G269000--Sobic009G186800 Sobic006G235000 Sobic006G235000 Sobic003G269000--Sobic006G235000 Sobic003G269000--Sobic001G330400 Sobic004G064500 Sobic004G064500 Sobic003G269000--Sobic004G064500 Sobic004G315200 Sobic004G315200 Sobic003G269000--Sobic004G315200 Sobic002G063800 Sobic002G063800 Sobic003G269000--Sobic002G063800 Sobic006G008000 Sobic006G008000 Sobic005G086600--Sobic006G008000 Sobic005G086600--Sobic003G268600 Sobic005G086600--Sobic003G073380 Sobic005G086600--Sobic003G079200 Sobic006G235100 Sobic006G235100 Sobic005G086600--Sobic006G235100 Sobic006G007900 Sobic006G007900 Sobic005G086600--Sobic006G007900 Sobic003G442100 Sobic003G442100 Sobic005G086600--Sobic003G442100 Sobic005G086600--Sobic004G161751 Sobic001G259400 Sobic001G259400 Sobic005G086600--Sobic001G259400 Sobic004G161751--Sobic003G079200 Sobic004G161751--Sobic003G073380 Sobic004G161751--Sobic005G086600 Sobic004G161751--Sobic006G008000 Sobic004G161751--Sobic009G145500 Sobic009G145600 Sobic009G145600 Sobic004G161751--Sobic009G145600 Sobic004G161751--Sobic002G063800 Sobic004G161751--Sobic006G235000 Sobic004G161751--Sobic003G043600 Sobic009G145500--Sobic003G043600 Sobic009G145500--Sobic003G073380 Sobic004G148200 Sobic004G148200 Sobic009G145500--Sobic004G148200 Sobic001G231400 Sobic001G231400 Sobic009G145500--Sobic001G231400 Sobic009G145500--Sobic003G268600 Sobic002G338500 Sobic002G338500 Sobic009G145500--Sobic002G338500 Sobic009G145500--Sobic006G235000 Sobic009G145500--Sobic009G145600 Sobic006G268800 Sobic006G268800 Sobic009G145500--Sobic006G268800 Sobic003G268600--Sobic003G442100 Sobic003G268600--Sobic001G330400 Sobic003G268600--Sobic003G043600 Sobic006G075400 Sobic006G075400 Sobic003G268600--Sobic006G075400 Sobic003G268600--Sobic005G086600 Sobic007G017500 Sobic007G017500 Sobic003G268600--Sobic007G017500 Sobic008G066401 Sobic008G066401 Sobic003G268600--Sobic008G066401 Sobic003G064200 Sobic003G064200 Sobic003G268600--Sobic003G064200 Sobic003G268600--Sobic009G145500 Sobic003G043600--Sobic002G338500 Sobic003G043600--Sobic009G145500 Sobic003G043600--Sobic003G268600 Sobic003G043600--Sobic006G075400 Sobic003G043600--Sobic003G442100 Sobic001G310600 Sobic001G310600 Sobic003G043600--Sobic001G310600 Sobic009G184000 Sobic009G184000 Sobic003G043600--Sobic009G184000 Sobic009G145700 Sobic009G145700 Sobic003G043600--Sobic009G145700 Sobic001G318700 Sobic001G318700 Sobic003G043600--Sobic001G318700 Sobic001G330400--Sobic003G268600 Sobic001G330400--Sobic006G075400 Sobic004G219800 Sobic004G219800 Sobic001G330400--Sobic004G219800 Sobic001G330400--Sobic007G017500 Sobic009G122400 Sobic009G122400 Sobic001G330400--Sobic009G122400 Sobic004G294400 Sobic004G294400 Sobic001G330400--Sobic004G294400 Sobic001G330400--Sobic001G318700 Sobic002G220000 Sobic002G220000 Sobic001G330400--Sobic002G220000 Sobic001G330100 Sobic001G330100 Sobic001G330400--Sobic001G330100 Sobic003G050300--Sobic003G073380 Sobic001G247300 Sobic001G247300 Sobic003G050300--Sobic001G247300 Sobic003G050300--Sobic003G268600 Sobic003G050300--Sobic003G043600 Sobic001G267600 Sobic001G267600 Sobic003G050300--Sobic001G267600 Sobic003G093000 Sobic003G093000 Sobic003G050300--Sobic003G093000 Sobic003G050300--Sobic009G145500 Sobic006G183400 Sobic006G183400 Sobic003G050300--Sobic006G183400 Sobic003G050300--Sobic003G442100 Sobic003G079200--Sobic006G008000 Sobic008G066200 Sobic008G066200 Sobic003G079200--Sobic008G066200 Sobic002G012300 Sobic002G012300 Sobic003G079200--Sobic002G012300 Sobic003G079200--Sobic009G145600 Sobic008G158600 Sobic008G158600 Sobic003G079200--Sobic008G158600 Sobic002G012500 Sobic002G012500 Sobic003G079200--Sobic002G012500 Sobic003G079200--Sobic002G063800 Sobic003G079200--Sobic004G161751 Sobic003G079200--Sobic005G086600
Octagon: transcription factors


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