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Transcriptome id Sobic.001G114900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QII0
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NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G026400 aquaporin protein, putative, expressed K09874: aquaporin NIP
2 Sobic.008G027600 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G010900 expressed protein -
4 Sobic.002G369400 Sulfotransferase family protein (At)(PubMedID : 27208977)@sulfotransferase domain containing protein, expressed -
5 Sobic.008G022000 Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative, expressed K05928: tocopherol O-methyltransferase
6 Sobic.006G008000 O-methyltransferase, putative, expressed -
7 Sobic.002G422300 ethylene-insensitive 3, putative, expressed K14514: ethylene-insensitive protein 3
8 Sobic.008G158332 - -
9 Sobic.008G066200 expressed protein -
10 Sobic.001G188800 cysteine-rich repeat secretory protein 55 precursor, putative, expressed -
11 Sobic.002G012300 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.010G062300 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
13 Sobic.003G079200 - -
14 Sobic.010G043900 expressed protein -
15 Sobic.004G161751 - -
16 Sobic.005G110454 - -
17 Sobic.008G158501 - -
18 Sobic.009G144800 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
19 Sobic.005G177600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
20 Sobic.005G110451 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G114900 Sobic001G114900 Sobic003G026400 Sobic003G026400 Sobic001G114900--Sobic003G026400 Sobic008G027600 Sobic008G027600 Sobic001G114900--Sobic008G027600 Sobic002G010900 Sobic002G010900 Sobic001G114900--Sobic002G010900 Sobic002G369400 Sobic002G369400 Sobic001G114900--Sobic002G369400 Sobic008G022000 Sobic008G022000 Sobic001G114900--Sobic008G022000 Sobic006G008000 Sobic006G008000 Sobic001G114900--Sobic006G008000 Sobic002G422300 Sobic002G422300 Sobic001G114900--Sobic002G422300 Sobic008G158332 Sobic008G158332 Sobic001G114900--Sobic008G158332 Sobic008G066200 Sobic008G066200 Sobic001G114900--Sobic008G066200 Sobic003G026400--Sobic001G114900 Sobic010G043900 Sobic010G043900 Sobic003G026400--Sobic010G043900 Sobic002G338500 Sobic002G338500 Sobic003G026400--Sobic002G338500 Sobic006G158400 Sobic006G158400 Sobic003G026400--Sobic006G158400 Sobic003G026400--Sobic006G008000 Sobic003G026400--Sobic008G027600 Sobic010G082600 Sobic010G082600 Sobic003G026400--Sobic010G082600 Sobic006G141700 Sobic006G141700 Sobic003G026400--Sobic006G141700 Sobic003G264600 Sobic003G264600 Sobic003G026400--Sobic003G264600 Sobic008G027600--Sobic006G158400 Sobic008G027600--Sobic002G369400 Sobic008G158100 Sobic008G158100 Sobic008G027600--Sobic008G158100 Sobic008G027600--Sobic010G043900 Sobic001G318500 Sobic001G318500 Sobic008G027600--Sobic001G318500 Sobic008G027600--Sobic001G114900 Sobic003G007600 Sobic003G007600 Sobic008G027600--Sobic003G007600 Sobic009G145500 Sobic009G145500 Sobic008G027600--Sobic009G145500 Sobic002G243000 Sobic002G243000 Sobic008G027600--Sobic002G243000 Sobic002G010900--Sobic001G114900 Sobic005G110454 Sobic005G110454 Sobic002G010900--Sobic005G110454 Sobic002G010900--Sobic002G422300 Sobic005G110451 Sobic005G110451 Sobic002G010900--Sobic005G110451 Sobic002G010900--Sobic008G022000 Sobic006G101300 Sobic006G101300 Sobic002G010900--Sobic006G101300 Sobic005G177600 Sobic005G177600 Sobic002G010900--Sobic005G177600 Sobic009G071000 Sobic009G071000 Sobic002G010900--Sobic009G071000 Sobic002G010900--Sobic008G158332 Sobic002G369400--Sobic008G027600 Sobic001G242000 Sobic001G242000 Sobic002G369400--Sobic001G242000 Sobic002G369400--Sobic001G114900 Sobic010G062300 Sobic010G062300 Sobic002G369400--Sobic010G062300 Sobic002G012300 Sobic002G012300 Sobic002G369400--Sobic002G012300 Sobic003G079200 Sobic003G079200 Sobic002G369400--Sobic003G079200 Sobic002G369400--Sobic008G022000 Sobic002G063800 Sobic002G063800 Sobic002G369400--Sobic002G063800 Sobic008G158501 Sobic008G158501 Sobic002G369400--Sobic008G158501 Sobic008G022000--Sobic002G012300 Sobic008G022000--Sobic006G008000 Sobic008G022000--Sobic008G066200 Sobic002G012500 Sobic002G012500 Sobic008G022000--Sobic002G012500 Sobic008G022000--Sobic008G158501 Sobic008G022000--Sobic003G079200 Sobic008G158600 Sobic008G158600 Sobic008G022000--Sobic008G158600 Sobic008G036800 Sobic008G036800 Sobic008G022000--Sobic008G036800 Sobic003G426600 Sobic003G426600 Sobic008G022000--Sobic003G426600 Sobic006G008000--Sobic008G066200 Sobic006G008000--Sobic002G012500 Sobic006G008000--Sobic003G079200 Sobic005G086600 Sobic005G086600 Sobic006G008000--Sobic005G086600 Sobic006G008000--Sobic002G012300 Sobic009G145600 Sobic009G145600 Sobic006G008000--Sobic009G145600 Sobic009G145700 Sobic009G145700 Sobic006G008000--Sobic009G145700 Sobic006G008000--Sobic008G022000 Sobic008G066401 Sobic008G066401 Sobic006G008000--Sobic008G066401 Sobic002G422300--Sobic010G043900 Sobic002G422300--Sobic008G158332 Sobic002G422300--Sobic002G010900 Sobic002G422300--Sobic001G114900 Sobic006G268500 Sobic006G268500 Sobic002G422300--Sobic006G268500 Sobic002G422300--Sobic009G071000 Sobic002G422300--Sobic008G027600 Sobic002G422300--Sobic006G101300 Sobic002G422300--Sobic003G026400 Sobic008G158332--Sobic002G422300 Sobic008G158332--Sobic006G268500 Sobic008G158332--Sobic001G114900 Sobic008G140900 Sobic008G140900 Sobic008G158332--Sobic008G140900 Sobic008G158332--Sobic002G010900 Sobic008G158332--Sobic008G027600 Sobic008G158332--Sobic009G071000 Sobic008G158332--Sobic010G043900 Sobic003G073460 Sobic003G073460 Sobic008G158332--Sobic003G073460 Sobic008G066200--Sobic006G008000 Sobic008G066200--Sobic002G012500 Sobic008G066200--Sobic009G145700 Sobic008G066200--Sobic003G079200 Sobic008G066200--Sobic009G145600 Sobic008G066200--Sobic008G066401 Sobic008G066200--Sobic008G022000 Sobic008G066200--Sobic002G012300 Sobic001G188800 Sobic001G188800 Sobic008G066200--Sobic001G188800
Octagon: transcription factors


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