Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G010900.1
Synonym Sb02g001160
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X7B7
Pfam -
Panther DB PTHR33181 PTHR33181:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G43150 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02460.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G114900 - -
2 Sobic.005G110454 - -
3 Sobic.002G422300 ethylene-insensitive 3, putative, expressed K14514: ethylene-insensitive protein 3
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7 Sobic.005G177600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
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11 Sobic.003G418500 OsGrx_C6 - glutaredoxin subgroup III, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3
12 Sobic.002G369400 Sulfotransferase family protein (At)(PubMedID : 27208977)@sulfotransferase domain containing protein, expressed -
13 Sobic.006G234900 expressed protein -
14 Sobic.001G188800 cysteine-rich repeat secretory protein 55 precursor, putative, expressed -
15 Sobic.002G012300 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.008G066200 expressed protein -
17 Sobic.006G268500 transporter family protein, putative, expressed -
18 Sobic.006G026500 expressed protein -
19 Sobic.008G140900 expressed protein -
20 Sobic.003G026400 aquaporin protein, putative, expressed K09874: aquaporin NIP


Gene co-expression network
sample Sobic002G010900 Sobic002G010900 Sobic001G114900 Sobic001G114900 Sobic002G010900--Sobic001G114900 Sobic005G110454 Sobic005G110454 Sobic002G010900--Sobic005G110454 Sobic002G422300 Sobic002G422300 Sobic002G010900--Sobic002G422300 Sobic005G110451 Sobic005G110451 Sobic002G010900--Sobic005G110451 Sobic008G022000 Sobic008G022000 Sobic002G010900--Sobic008G022000 Sobic006G101300 Sobic006G101300 Sobic002G010900--Sobic006G101300 Sobic005G177600 Sobic005G177600 Sobic002G010900--Sobic005G177600 Sobic009G071000 Sobic009G071000 Sobic002G010900--Sobic009G071000 Sobic008G158332 Sobic008G158332 Sobic002G010900--Sobic008G158332 Sobic003G026400 Sobic003G026400 Sobic001G114900--Sobic003G026400 Sobic008G027600 Sobic008G027600 Sobic001G114900--Sobic008G027600 Sobic001G114900--Sobic002G010900 Sobic002G369400 Sobic002G369400 Sobic001G114900--Sobic002G369400 Sobic001G114900--Sobic008G022000 Sobic006G008000 Sobic006G008000 Sobic001G114900--Sobic006G008000 Sobic001G114900--Sobic002G422300 Sobic001G114900--Sobic008G158332 Sobic008G066200 Sobic008G066200 Sobic001G114900--Sobic008G066200 Sobic005G110454--Sobic005G110451 Sobic001G195300 Sobic001G195300 Sobic005G110454--Sobic001G195300 Sobic005G110454--Sobic002G010900 Sobic001G401000 Sobic001G401000 Sobic005G110454--Sobic001G401000 Sobic005G110454--Sobic001G114900 Sobic005G224000 Sobic005G224000 Sobic005G110454--Sobic005G224000 Sobic009G144800 Sobic009G144800 Sobic005G110454--Sobic009G144800 Sobic010G211600 Sobic010G211600 Sobic005G110454--Sobic010G211600 Sobic005G110454--Sobic008G158332 Sobic010G043900 Sobic010G043900 Sobic002G422300--Sobic010G043900 Sobic002G422300--Sobic008G158332 Sobic002G422300--Sobic002G010900 Sobic002G422300--Sobic001G114900 Sobic006G268500 Sobic006G268500 Sobic002G422300--Sobic006G268500 Sobic002G422300--Sobic009G071000 Sobic002G422300--Sobic008G027600 Sobic002G422300--Sobic006G101300 Sobic002G422300--Sobic003G026400 Sobic005G110451--Sobic005G110454 Sobic005G110451--Sobic001G195300 Sobic005G110451--Sobic002G010900 Sobic005G110451--Sobic001G401000 Sobic005G110451--Sobic001G114900 Sobic005G110451--Sobic005G224000 Sobic005G110451--Sobic010G211600 Sobic005G110451--Sobic009G144800 Sobic005G110451--Sobic008G158332 Sobic002G012300 Sobic002G012300 Sobic008G022000--Sobic002G012300 Sobic008G022000--Sobic006G008000 Sobic008G022000--Sobic008G066200 Sobic002G012500 Sobic002G012500 Sobic008G022000--Sobic002G012500 Sobic008G158501 Sobic008G158501 Sobic008G022000--Sobic008G158501 Sobic003G079200 Sobic003G079200 Sobic008G022000--Sobic003G079200 Sobic008G158600 Sobic008G158600 Sobic008G022000--Sobic008G158600 Sobic008G036800 Sobic008G036800 Sobic008G022000--Sobic008G036800 Sobic003G426600 Sobic003G426600 Sobic008G022000--Sobic003G426600 Sobic006G234900 Sobic006G234900 Sobic006G101300--Sobic006G234900 Sobic006G101100 Sobic006G101100 Sobic006G101300--Sobic006G101100 Sobic002G042000 Sobic002G042000 Sobic006G101300--Sobic002G042000 Sobic006G026500 Sobic006G026500 Sobic006G101300--Sobic006G026500 Sobic006G101300--Sobic008G066200 Sobic004G169300 Sobic004G169300 Sobic006G101300--Sobic004G169300 Sobic007G008000 Sobic007G008000 Sobic006G101300--Sobic007G008000 Sobic006G101300--Sobic008G022000 Sobic003G418500 Sobic003G418500 Sobic006G101300--Sobic003G418500 Sobic004G148100 Sobic004G148100 Sobic005G177600--Sobic004G148100 Sobic002G040900 Sobic002G040900 Sobic005G177600--Sobic002G040900 Sobic004G189500 Sobic004G189500 Sobic005G177600--Sobic004G189500 Sobic009G231000 Sobic009G231000 Sobic005G177600--Sobic009G231000 Sobic006G039100 Sobic006G039100 Sobic005G177600--Sobic006G039100 Sobic005G177600--Sobic004G169300 Sobic002G338500 Sobic002G338500 Sobic005G177600--Sobic002G338500 Sobic005G177600--Sobic002G042000 Sobic005G177600--Sobic003G418500 Sobic009G071000--Sobic006G268500 Sobic008G140900 Sobic008G140900 Sobic009G071000--Sobic008G140900 Sobic009G071000--Sobic002G422300 Sobic009G071000--Sobic002G010900 Sobic006G227750 Sobic006G227750 Sobic009G071000--Sobic006G227750 Sobic009G157450 Sobic009G157450 Sobic009G071000--Sobic009G157450 Sobic009G071000--Sobic008G158332 Sobic009G071100 Sobic009G071100 Sobic009G071000--Sobic009G071100 Sobic009G071000--Sobic006G234900 Sobic008G158332--Sobic002G422300 Sobic008G158332--Sobic006G268500 Sobic008G158332--Sobic001G114900 Sobic008G158332--Sobic008G140900 Sobic008G158332--Sobic002G010900 Sobic008G158332--Sobic008G027600 Sobic008G158332--Sobic009G071000 Sobic008G158332--Sobic010G043900 Sobic003G073460 Sobic003G073460 Sobic008G158332--Sobic003G073460
Octagon: transcription factors


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