Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G161201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R7W9
Pfam PF02902
Panther DB PTHR12606 PTHR12606:SF28
NCBI CDD KOG3246; Sentrin-specific cysteine protease (Ulp1 family)
KEGG Orthology K16287; ubiquitin-like-specific protease 1C/D
Gene Ontology GO:0008234; cysteine-type peptidase activity GO:0006508proteolysis


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G10570 : Cysteine proteinases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g41380.1 : ulp1 protease family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004641 , Zm00025a034941
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G029601 - -
2 Sobic.010G039600 - -
3 Sobic.005G064300 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
4 Sobic.008G135901 - K01051: pectinesterase
5 Sobic.008G181600 thaumatin, putative, expressed -
6 Sobic.002G096400 expressed protein -
7 Sobic.001G345700 zinc-binding protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G321500 expressed protein -
9 Sobic.003G404700 regulatory protein, putative, expressed -
10 Sobic.006G022900 cytochrome P450, putative, expressed -
11 Sobic.001G345600 zinc-binding protein, putative, expressed -
12 Sobic.009G019900 - -
13 Sobic.005G152400 - -
14 Sobic.001G312200 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
15 Sobic.008G188300 - -
16 Sobic.009G039200 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
17 Sobic.010G121900 expressed protein -
18 Sobic.008G122300 OsSub63 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
19 Sobic.005G131100 expressed protein -
20 Sobic.002G332000 CRP8 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G161201 Sobic008G161201 Sobic004G029601 Sobic004G029601 Sobic008G161201--Sobic004G029601 Sobic010G039600 Sobic010G039600 Sobic008G161201--Sobic010G039600 Sobic005G064300 Sobic005G064300 Sobic008G161201--Sobic005G064300 Sobic008G135901 Sobic008G135901 Sobic008G161201--Sobic008G135901 Sobic008G181600 Sobic008G181600 Sobic008G161201--Sobic008G181600 Sobic002G096400 Sobic002G096400 Sobic008G161201--Sobic002G096400 Sobic001G345700 Sobic001G345700 Sobic008G161201--Sobic001G345700 Sobic004G321500 Sobic004G321500 Sobic008G161201--Sobic004G321500 Sobic003G404700 Sobic003G404700 Sobic008G161201--Sobic003G404700 Sobic004G029601--Sobic008G161201 Sobic004G029601--Sobic010G039600 Sobic004G029601--Sobic008G135901 Sobic010G121900 Sobic010G121900 Sobic004G029601--Sobic010G121900 Sobic004G029601--Sobic005G064300 Sobic004G029601--Sobic004G321500 Sobic004G029601--Sobic008G181600 Sobic004G029601--Sobic001G345700 Sobic004G015150 Sobic004G015150 Sobic004G029601--Sobic004G015150 Sobic010G039600--Sobic005G064300 Sobic010G039600--Sobic008G181600 Sobic010G039600--Sobic008G161201 Sobic010G039600--Sobic001G345700 Sobic010G039600--Sobic002G096400 Sobic010G039600--Sobic004G029601 Sobic001G345600 Sobic001G345600 Sobic010G039600--Sobic001G345600 Sobic010G039600--Sobic008G135901 Sobic009G019900 Sobic009G019900 Sobic010G039600--Sobic009G019900 Sobic005G064300--Sobic008G181600 Sobic005G064300--Sobic002G096400 Sobic005G064300--Sobic001G345700 Sobic005G064300--Sobic010G039600 Sobic005G064300--Sobic001G345600 Sobic001G312200 Sobic001G312200 Sobic005G064300--Sobic001G312200 Sobic005G152400 Sobic005G152400 Sobic005G064300--Sobic005G152400 Sobic008G122300 Sobic008G122300 Sobic005G064300--Sobic008G122300 Sobic005G131100 Sobic005G131100 Sobic005G064300--Sobic005G131100 Sobic004G314300 Sobic004G314300 Sobic008G135901--Sobic004G314300 Sobic008G135901--Sobic003G404700 Sobic008G135901--Sobic010G039600 Sobic008G135901--Sobic008G161201 Sobic008G135901--Sobic004G029601 Sobic008G135901--Sobic005G064300 Sobic008G188300 Sobic008G188300 Sobic008G135901--Sobic008G188300 Sobic008G135901--Sobic008G181600 Sobic008G135901--Sobic001G345700 Sobic008G181600--Sobic005G064300 Sobic008G181600--Sobic001G345700 Sobic008G181600--Sobic001G345600 Sobic008G181600--Sobic002G096400 Sobic008G181600--Sobic001G312200 Sobic008G181600--Sobic005G152400 Sobic008G181600--Sobic008G122300 Sobic008G181600--Sobic010G039600 Sobic008G181600--Sobic005G131100 Sobic002G096400--Sobic005G064300 Sobic002G096400--Sobic008G181600 Sobic002G096400--Sobic001G345700 Sobic002G096400--Sobic001G345600 Sobic002G096400--Sobic005G152400 Sobic002G096400--Sobic001G312200 Sobic002G332000 Sobic002G332000 Sobic002G096400--Sobic002G332000 Sobic002G096400--Sobic008G122300 Sobic002G096400--Sobic005G131100 Sobic001G345700--Sobic008G181600 Sobic001G345700--Sobic005G064300 Sobic001G345700--Sobic001G345600 Sobic001G345700--Sobic002G096400 Sobic001G345700--Sobic001G312200 Sobic001G345700--Sobic008G122300 Sobic001G345700--Sobic010G039600 Sobic001G345700--Sobic005G152400 Sobic001G345700--Sobic005G131100 Sobic004G321500--Sobic008G161201 Sobic004G321500--Sobic004G029601 Sobic004G321500--Sobic010G039600 Sobic004G321500--Sobic002G096400 Sobic004G321500--Sobic005G064300 Sobic004G321500--Sobic008G135901 Sobic003G443800 Sobic003G443800 Sobic004G321500--Sobic003G443800 Sobic008G143300 Sobic008G143300 Sobic004G321500--Sobic008G143300 Sobic004G321500--Sobic001G345700 Sobic009G039200 Sobic009G039200 Sobic003G404700--Sobic009G039200 Sobic003G404700--Sobic008G188300 Sobic003G404700--Sobic008G135901 Sobic005G027100 Sobic005G027100 Sobic003G404700--Sobic005G027100 Sobic005G098300 Sobic005G098300 Sobic003G404700--Sobic005G098300 Sobic006G022900 Sobic006G022900 Sobic003G404700--Sobic006G022900 Sobic006G227100 Sobic006G227100 Sobic003G404700--Sobic006G227100 Sobic003G404700--Sobic004G314300 Sobic003G404700--Sobic010G039600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.