Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G321500.1
Synonym Sb04g035190
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XTQ0
Pfam -
Panther DB PTHR34206 PTHR34206:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14280 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g54180.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK19170 , PNT76280 , PNT76279
Barley -
Wheat TraesCS7B02G061700 , TraesCS7A02G157400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G161201 - K16287: ubiquitin-like-specific protease 1C/D
2 Sobic.004G029601 - -
3 Sobic.010G039600 - -
4 Sobic.002G096400 expressed protein -
5 Sobic.005G064300 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
6 Sobic.008G135901 - K01051: pectinesterase
7 Sobic.003G443800 expressed protein -
8 Sobic.008G143300 - -
9 Sobic.001G345700 zinc-binding protein, putative, expressed -
10 Sobic.008G181600 thaumatin, putative, expressed -
11 Sobic.003G404700 regulatory protein, putative, expressed -
12 Sobic.005G152400 - -
13 Sobic.004G195400 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
14 Sobic.006G022900 cytochrome P450, putative, expressed -
15 Sobic.009G019900 - -
16 Sobic.001G345600 zinc-binding protein, putative, expressed -
17 Sobic.010G121900 expressed protein -
18 Sobic.001G009100 expressed protein -
19 Sobic.006G163200 COBRA, putative, expressed -
20 Sobic.004G314300 laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase


Gene co-expression network
sample Sobic004G321500 Sobic004G321500 Sobic008G161201 Sobic008G161201 Sobic004G321500--Sobic008G161201 Sobic004G029601 Sobic004G029601 Sobic004G321500--Sobic004G029601 Sobic010G039600 Sobic010G039600 Sobic004G321500--Sobic010G039600 Sobic002G096400 Sobic002G096400 Sobic004G321500--Sobic002G096400 Sobic005G064300 Sobic005G064300 Sobic004G321500--Sobic005G064300 Sobic008G135901 Sobic008G135901 Sobic004G321500--Sobic008G135901 Sobic003G443800 Sobic003G443800 Sobic004G321500--Sobic003G443800 Sobic008G143300 Sobic008G143300 Sobic004G321500--Sobic008G143300 Sobic001G345700 Sobic001G345700 Sobic004G321500--Sobic001G345700 Sobic008G161201--Sobic004G029601 Sobic008G161201--Sobic010G039600 Sobic008G161201--Sobic005G064300 Sobic008G161201--Sobic008G135901 Sobic008G181600 Sobic008G181600 Sobic008G161201--Sobic008G181600 Sobic008G161201--Sobic002G096400 Sobic008G161201--Sobic001G345700 Sobic008G161201--Sobic004G321500 Sobic003G404700 Sobic003G404700 Sobic008G161201--Sobic003G404700 Sobic004G029601--Sobic008G161201 Sobic004G029601--Sobic010G039600 Sobic004G029601--Sobic008G135901 Sobic010G121900 Sobic010G121900 Sobic004G029601--Sobic010G121900 Sobic004G029601--Sobic005G064300 Sobic004G029601--Sobic004G321500 Sobic004G029601--Sobic008G181600 Sobic004G029601--Sobic001G345700 Sobic004G015150 Sobic004G015150 Sobic004G029601--Sobic004G015150 Sobic010G039600--Sobic005G064300 Sobic010G039600--Sobic008G181600 Sobic010G039600--Sobic008G161201 Sobic010G039600--Sobic001G345700 Sobic010G039600--Sobic002G096400 Sobic010G039600--Sobic004G029601 Sobic001G345600 Sobic001G345600 Sobic010G039600--Sobic001G345600 Sobic010G039600--Sobic008G135901 Sobic009G019900 Sobic009G019900 Sobic010G039600--Sobic009G019900 Sobic002G096400--Sobic005G064300 Sobic002G096400--Sobic008G181600 Sobic002G096400--Sobic001G345700 Sobic002G096400--Sobic001G345600 Sobic005G152400 Sobic005G152400 Sobic002G096400--Sobic005G152400 Sobic001G312200 Sobic001G312200 Sobic002G096400--Sobic001G312200 Sobic002G332000 Sobic002G332000 Sobic002G096400--Sobic002G332000 Sobic008G122300 Sobic008G122300 Sobic002G096400--Sobic008G122300 Sobic005G131100 Sobic005G131100 Sobic002G096400--Sobic005G131100 Sobic005G064300--Sobic008G181600 Sobic005G064300--Sobic002G096400 Sobic005G064300--Sobic001G345700 Sobic005G064300--Sobic010G039600 Sobic005G064300--Sobic001G345600 Sobic005G064300--Sobic001G312200 Sobic005G064300--Sobic005G152400 Sobic005G064300--Sobic008G122300 Sobic005G064300--Sobic005G131100 Sobic004G314300 Sobic004G314300 Sobic008G135901--Sobic004G314300 Sobic008G135901--Sobic003G404700 Sobic008G135901--Sobic010G039600 Sobic008G135901--Sobic008G161201 Sobic008G135901--Sobic004G029601 Sobic008G135901--Sobic005G064300 Sobic008G188300 Sobic008G188300 Sobic008G135901--Sobic008G188300 Sobic008G135901--Sobic008G181600 Sobic008G135901--Sobic001G345700 Sobic003G443800--Sobic004G321500 Sobic006G163200 Sobic006G163200 Sobic003G443800--Sobic006G163200 Sobic001G235200 Sobic001G235200 Sobic003G443800--Sobic001G235200 Sobic001G141900 Sobic001G141900 Sobic003G443800--Sobic001G141900 Sobic003G443800--Sobic008G143300 Sobic003G063700 Sobic003G063700 Sobic003G443800--Sobic003G063700 Sobic006G134700 Sobic006G134700 Sobic003G443800--Sobic006G134700 Sobic004G195400 Sobic004G195400 Sobic003G443800--Sobic004G195400 Sobic005G070800 Sobic005G070800 Sobic003G443800--Sobic005G070800 Sobic008G143300--Sobic005G070800 Sobic005G190300 Sobic005G190300 Sobic008G143300--Sobic005G190300 Sobic008G143300--Sobic002G096400 Sobic008G123350 Sobic008G123350 Sobic008G143300--Sobic008G123350 Sobic008G143300--Sobic005G152400 Sobic002G076600 Sobic002G076600 Sobic008G143300--Sobic002G076600 Sobic008G143300--Sobic006G163200 Sobic008G143300--Sobic005G064300 Sobic010G121800 Sobic010G121800 Sobic008G143300--Sobic010G121800 Sobic001G345700--Sobic008G181600 Sobic001G345700--Sobic005G064300 Sobic001G345700--Sobic001G345600 Sobic001G345700--Sobic002G096400 Sobic001G345700--Sobic001G312200 Sobic001G345700--Sobic008G122300 Sobic001G345700--Sobic010G039600 Sobic001G345700--Sobic005G152400 Sobic001G345700--Sobic005G131100
Octagon: transcription factors


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