Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G443800.1
Synonym DVL11, RTFL8
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q8G6
Pfam PF08137
Panther DB PTHR33102 PTHR33102:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G39705 : ROTUNDIFOLIA like 8
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g16600.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT73675 , PNT73677 , PNT73676 , KQK11755 , PNT73679 , PNT73678
Barley HORVU3Hr1G115060.2 , HORVU3Hr1G115060.1 , HORVU1Hr1G073570.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G321500 expressed protein -
2 Sobic.006G163200 COBRA, putative, expressed -
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5 Sobic.008G143300 - -
6 Sobic.003G063700 - -
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8 Sobic.004G195400 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
9 Sobic.005G070800 - -
10 Sobic.008G161201 - K16287: ubiquitin-like-specific protease 1C/D
11 Sobic.001G009100 expressed protein -
12 Sobic.007G125600 expressed protein -
13 Sobic.004G029601 - -
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17 Sobic.002G096400 expressed protein -
18 Sobic.006G213900 OsMADS31 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
19 Sobic.003G295100 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
20 Sobic.008G135901 - K01051: pectinesterase


Gene co-expression network
sample Sobic003G443800 Sobic003G443800 Sobic004G321500 Sobic004G321500 Sobic003G443800--Sobic004G321500 Sobic006G163200 Sobic006G163200 Sobic003G443800--Sobic006G163200 Sobic001G235200 Sobic001G235200 Sobic003G443800--Sobic001G235200 Sobic001G141900 Sobic001G141900 Sobic003G443800--Sobic001G141900 Sobic008G143300 Sobic008G143300 Sobic003G443800--Sobic008G143300 Sobic003G063700 Sobic003G063700 Sobic003G443800--Sobic003G063700 Sobic006G134700 Sobic006G134700 Sobic003G443800--Sobic006G134700 Sobic004G195400 Sobic004G195400 Sobic003G443800--Sobic004G195400 Sobic005G070800 Sobic005G070800 Sobic003G443800--Sobic005G070800 Sobic008G161201 Sobic008G161201 Sobic004G321500--Sobic008G161201 Sobic004G029601 Sobic004G029601 Sobic004G321500--Sobic004G029601 Sobic010G039600 Sobic010G039600 Sobic004G321500--Sobic010G039600 Sobic002G096400 Sobic002G096400 Sobic004G321500--Sobic002G096400 Sobic005G064300 Sobic005G064300 Sobic004G321500--Sobic005G064300 Sobic008G135901 Sobic008G135901 Sobic004G321500--Sobic008G135901 Sobic004G321500--Sobic003G443800 Sobic004G321500--Sobic008G143300 Sobic001G345700 Sobic001G345700 Sobic004G321500--Sobic001G345700 Sobic006G163200--Sobic005G070800 Sobic002G076600 Sobic002G076600 Sobic006G163200--Sobic002G076600 Sobic006G163200--Sobic001G235200 Sobic006G163200--Sobic004G195400 Sobic006G163200--Sobic008G143300 Sobic006G189500 Sobic006G189500 Sobic006G163200--Sobic006G189500 Sobic006G213900 Sobic006G213900 Sobic006G163200--Sobic006G213900 Sobic004G014700 Sobic004G014700 Sobic006G163200--Sobic004G014700 Sobic001G152901 Sobic001G152901 Sobic006G163200--Sobic001G152901 Sobic001G235200--Sobic006G213900 Sobic001G235200--Sobic003G063700 Sobic001G235200--Sobic006G134700 Sobic002G239101 Sobic002G239101 Sobic001G235200--Sobic002G239101 Sobic001G137800 Sobic001G137800 Sobic001G235200--Sobic001G137800 Sobic002G159000 Sobic002G159000 Sobic001G235200--Sobic002G159000 Sobic004G168000 Sobic004G168000 Sobic001G235200--Sobic004G168000 Sobic005G070101 Sobic005G070101 Sobic001G235200--Sobic005G070101 Sobic009G211300 Sobic009G211300 Sobic001G235200--Sobic009G211300 Sobic003G044800 Sobic003G044800 Sobic001G141900--Sobic003G044800 Sobic008G138200 Sobic008G138200 Sobic001G141900--Sobic008G138200 Sobic001G141900--Sobic003G063700 Sobic004G056000 Sobic004G056000 Sobic001G141900--Sobic004G056000 Sobic001G141900--Sobic001G235200 Sobic001G141900--Sobic006G163200 Sobic001G141900--Sobic002G239101 Sobic001G235100 Sobic001G235100 Sobic001G141900--Sobic001G235100 Sobic007G043000 Sobic007G043000 Sobic001G141900--Sobic007G043000 Sobic008G143300--Sobic005G070800 Sobic005G190300 Sobic005G190300 Sobic008G143300--Sobic005G190300 Sobic008G143300--Sobic002G096400 Sobic008G123350 Sobic008G123350 Sobic008G143300--Sobic008G123350 Sobic005G152400 Sobic005G152400 Sobic008G143300--Sobic005G152400 Sobic008G143300--Sobic002G076600 Sobic008G143300--Sobic006G163200 Sobic008G143300--Sobic005G064300 Sobic010G121800 Sobic010G121800 Sobic008G143300--Sobic010G121800 Sobic003G063700--Sobic001G235200 Sobic003G063700--Sobic009G211300 Sobic003G063700--Sobic006G134700 Sobic003G063700--Sobic006G213900 Sobic001G158100 Sobic001G158100 Sobic003G063700--Sobic001G158100 Sobic001G216400 Sobic001G216400 Sobic003G063700--Sobic001G216400 Sobic003G063700--Sobic002G239101 Sobic003G063700--Sobic001G141900 Sobic003G063700--Sobic008G138200 Sobic006G134700--Sobic002G239101 Sobic006G134700--Sobic005G070101 Sobic006G134700--Sobic004G168000 Sobic006G134700--Sobic002G159000 Sobic006G134700--Sobic001G235200 Sobic006G134700--Sobic006G213900 Sobic006G134700--Sobic003G063700 Sobic006G134700--Sobic009G211300 Sobic001G459400 Sobic001G459400 Sobic006G134700--Sobic001G459400 Sobic004G195400--Sobic004G014700 Sobic008G048600 Sobic008G048600 Sobic004G195400--Sobic008G048600 Sobic004G195400--Sobic006G189500 Sobic003G411100 Sobic003G411100 Sobic004G195400--Sobic003G411100 Sobic006G131100 Sobic006G131100 Sobic004G195400--Sobic006G131100 Sobic004G195400--Sobic002G076600 Sobic001G324600 Sobic001G324600 Sobic004G195400--Sobic001G324600 Sobic006G006100 Sobic006G006100 Sobic004G195400--Sobic006G006100 Sobic006G144101 Sobic006G144101 Sobic004G195400--Sobic006G144101 Sobic005G070800--Sobic006G163200 Sobic005G070800--Sobic002G076600 Sobic005G070800--Sobic008G123350 Sobic005G070800--Sobic005G190300 Sobic005G070800--Sobic008G143300 Sobic005G070800--Sobic006G189500 Sobic005G070800--Sobic004G014700 Sobic005G070800--Sobic004G195400 Sobic005G070800--Sobic010G121800
Octagon: transcription factors


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