Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G143300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PDP3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G070800 - -
2 Sobic.005G190300 - -
3 Sobic.002G096400 expressed protein -
4 Sobic.008G123350 - -
5 Sobic.005G152400 - -
6 Sobic.002G076600 rc - bHLH transcription factor regulating proanthocyanidin production in seeds, expressed -
7 Sobic.006G163200 COBRA, putative, expressed -
8 Sobic.005G064300 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
9 Sobic.010G121800 expansin precursor, putative, expressed -
10 Sobic.004G195400 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G332000 CRP8 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -
12 Sobic.006G189500 OsMADS17 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
13 Sobic.006G178900 polygalacturonase, putative, expressed -
14 Sobic.004G014700 THION20 - Plant thionin family protein precursor, putative, expressed -
15 Sobic.005G071250 - -
16 Sobic.008G181600 thaumatin, putative, expressed -
17 Sobic.001G200800 LTPL160 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
18 Sobic.008G143200 - -
19 Sobic.001G345600 zinc-binding protein, putative, expressed -
20 Sobic.008G122300 OsSub63 - Putative Subtilisin homologue, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G143300 Sobic008G143300 Sobic005G070800 Sobic005G070800 Sobic008G143300--Sobic005G070800 Sobic005G190300 Sobic005G190300 Sobic008G143300--Sobic005G190300 Sobic002G096400 Sobic002G096400 Sobic008G143300--Sobic002G096400 Sobic008G123350 Sobic008G123350 Sobic008G143300--Sobic008G123350 Sobic005G152400 Sobic005G152400 Sobic008G143300--Sobic005G152400 Sobic002G076600 Sobic002G076600 Sobic008G143300--Sobic002G076600 Sobic006G163200 Sobic006G163200 Sobic008G143300--Sobic006G163200 Sobic005G064300 Sobic005G064300 Sobic008G143300--Sobic005G064300 Sobic010G121800 Sobic010G121800 Sobic008G143300--Sobic010G121800 Sobic005G070800--Sobic006G163200 Sobic005G070800--Sobic002G076600 Sobic005G070800--Sobic008G123350 Sobic005G070800--Sobic005G190300 Sobic005G070800--Sobic008G143300 Sobic006G189500 Sobic006G189500 Sobic005G070800--Sobic006G189500 Sobic004G014700 Sobic004G014700 Sobic005G070800--Sobic004G014700 Sobic004G195400 Sobic004G195400 Sobic005G070800--Sobic004G195400 Sobic005G070800--Sobic010G121800 Sobic005G190300--Sobic008G123350 Sobic005G190300--Sobic010G121800 Sobic002G332000 Sobic002G332000 Sobic005G190300--Sobic002G332000 Sobic001G200800 Sobic001G200800 Sobic005G190300--Sobic001G200800 Sobic008G143200 Sobic008G143200 Sobic005G190300--Sobic008G143200 Sobic002G103000 Sobic002G103000 Sobic005G190300--Sobic002G103000 Sobic008G122300 Sobic008G122300 Sobic005G190300--Sobic008G122300 Sobic001G209701 Sobic001G209701 Sobic005G190300--Sobic001G209701 Sobic002G096400--Sobic005G064300 Sobic008G181600 Sobic008G181600 Sobic002G096400--Sobic008G181600 Sobic001G345700 Sobic001G345700 Sobic002G096400--Sobic001G345700 Sobic001G345600 Sobic001G345600 Sobic002G096400--Sobic001G345600 Sobic002G096400--Sobic005G152400 Sobic001G312200 Sobic001G312200 Sobic002G096400--Sobic001G312200 Sobic002G096400--Sobic002G332000 Sobic002G096400--Sobic008G122300 Sobic005G131100 Sobic005G131100 Sobic002G096400--Sobic005G131100 Sobic008G123350--Sobic005G190300 Sobic008G123350--Sobic010G121800 Sobic008G123350--Sobic001G200800 Sobic008G123350--Sobic002G332000 Sobic008G123350--Sobic008G143200 Sobic008G123350--Sobic002G103000 Sobic007G040400 Sobic007G040400 Sobic008G123350--Sobic007G040400 Sobic005G147400 Sobic005G147400 Sobic008G123350--Sobic005G147400 Sobic005G196400 Sobic005G196400 Sobic008G123350--Sobic005G196400 Sobic005G152400--Sobic001G312200 Sobic005G153100 Sobic005G153100 Sobic005G152400--Sobic005G153100 Sobic005G152400--Sobic001G345600 Sobic004G015200 Sobic004G015200 Sobic005G152400--Sobic004G015200 Sobic002G399700 Sobic002G399700 Sobic005G152400--Sobic002G399700 Sobic005G152400--Sobic008G122300 Sobic008G188300 Sobic008G188300 Sobic005G152400--Sobic008G188300 Sobic005G152400--Sobic005G131100 Sobic005G152400--Sobic002G332000 Sobic002G076600--Sobic004G014700 Sobic002G076600--Sobic008G123350 Sobic002G076600--Sobic006G189500 Sobic006G131100 Sobic006G131100 Sobic002G076600--Sobic006G131100 Sobic002G076600--Sobic005G070800 Sobic002G076600--Sobic004G195400 Sobic002G076600--Sobic005G190300 Sobic008G048600 Sobic008G048600 Sobic002G076600--Sobic008G048600 Sobic002G076600--Sobic006G163200 Sobic006G163200--Sobic005G070800 Sobic006G163200--Sobic002G076600 Sobic001G235200 Sobic001G235200 Sobic006G163200--Sobic001G235200 Sobic006G163200--Sobic004G195400 Sobic006G163200--Sobic008G143300 Sobic006G163200--Sobic006G189500 Sobic006G213900 Sobic006G213900 Sobic006G163200--Sobic006G213900 Sobic006G163200--Sobic004G014700 Sobic001G152901 Sobic001G152901 Sobic006G163200--Sobic001G152901 Sobic005G064300--Sobic008G181600 Sobic005G064300--Sobic002G096400 Sobic005G064300--Sobic001G345700 Sobic010G039600 Sobic010G039600 Sobic005G064300--Sobic010G039600 Sobic005G064300--Sobic001G345600 Sobic005G064300--Sobic001G312200 Sobic005G064300--Sobic005G152400 Sobic005G064300--Sobic008G122300 Sobic005G064300--Sobic005G131100 Sobic010G121800--Sobic008G143200 Sobic010G121800--Sobic002G332000 Sobic010G121800--Sobic002G103000 Sobic010G121800--Sobic001G200800 Sobic010G121800--Sobic001G209701
Octagon: transcription factors


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