Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G070800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PQN1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Barley -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G163200 COBRA, putative, expressed -
2 Sobic.002G076600 rc - bHLH transcription factor regulating proanthocyanidin production in seeds, expressed -
3 Sobic.008G123350 - -
4 Sobic.005G190300 - -
5 Sobic.008G143300 - -
6 Sobic.006G189500 OsMADS17 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
7 Sobic.004G014700 THION20 - Plant thionin family protein precursor, putative, expressed -
8 Sobic.004G195400 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
9 Sobic.010G121800 expansin precursor, putative, expressed -
10 Sobic.001G200800 LTPL160 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
11 Sobic.002G332000 CRP8 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -
12 Sobic.008G143200 - -
13 Sobic.002G096400 expressed protein -
14 Sobic.006G131100 - -
15 Sobic.002G103000 PME/invertase inhibitor, putative, expressed -
16 Sobic.003G015950 - -
17 Sobic.001G152901 "YABBY transcription factor, "(PubMedID : 22581231) -
18 Sobic.008G048600 - -
19 Sobic.008G122300 OsSub63 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
20 Sobic.001G209701 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G070800 Sobic005G070800 Sobic006G163200 Sobic006G163200 Sobic005G070800--Sobic006G163200 Sobic002G076600 Sobic002G076600 Sobic005G070800--Sobic002G076600 Sobic008G123350 Sobic008G123350 Sobic005G070800--Sobic008G123350 Sobic005G190300 Sobic005G190300 Sobic005G070800--Sobic005G190300 Sobic008G143300 Sobic008G143300 Sobic005G070800--Sobic008G143300 Sobic006G189500 Sobic006G189500 Sobic005G070800--Sobic006G189500 Sobic004G014700 Sobic004G014700 Sobic005G070800--Sobic004G014700 Sobic004G195400 Sobic004G195400 Sobic005G070800--Sobic004G195400 Sobic010G121800 Sobic010G121800 Sobic005G070800--Sobic010G121800 Sobic006G163200--Sobic005G070800 Sobic006G163200--Sobic002G076600 Sobic001G235200 Sobic001G235200 Sobic006G163200--Sobic001G235200 Sobic006G163200--Sobic004G195400 Sobic006G163200--Sobic008G143300 Sobic006G163200--Sobic006G189500 Sobic006G213900 Sobic006G213900 Sobic006G163200--Sobic006G213900 Sobic006G163200--Sobic004G014700 Sobic001G152901 Sobic001G152901 Sobic006G163200--Sobic001G152901 Sobic002G076600--Sobic004G014700 Sobic002G076600--Sobic008G123350 Sobic002G076600--Sobic006G189500 Sobic006G131100 Sobic006G131100 Sobic002G076600--Sobic006G131100 Sobic002G076600--Sobic005G070800 Sobic002G076600--Sobic004G195400 Sobic002G076600--Sobic005G190300 Sobic008G048600 Sobic008G048600 Sobic002G076600--Sobic008G048600 Sobic002G076600--Sobic006G163200 Sobic008G123350--Sobic005G190300 Sobic008G123350--Sobic010G121800 Sobic001G200800 Sobic001G200800 Sobic008G123350--Sobic001G200800 Sobic002G332000 Sobic002G332000 Sobic008G123350--Sobic002G332000 Sobic008G143200 Sobic008G143200 Sobic008G123350--Sobic008G143200 Sobic002G103000 Sobic002G103000 Sobic008G123350--Sobic002G103000 Sobic007G040400 Sobic007G040400 Sobic008G123350--Sobic007G040400 Sobic005G147400 Sobic005G147400 Sobic008G123350--Sobic005G147400 Sobic005G196400 Sobic005G196400 Sobic008G123350--Sobic005G196400 Sobic005G190300--Sobic008G123350 Sobic005G190300--Sobic010G121800 Sobic005G190300--Sobic002G332000 Sobic005G190300--Sobic001G200800 Sobic005G190300--Sobic008G143200 Sobic005G190300--Sobic002G103000 Sobic008G122300 Sobic008G122300 Sobic005G190300--Sobic008G122300 Sobic001G209701 Sobic001G209701 Sobic005G190300--Sobic001G209701 Sobic008G143300--Sobic005G070800 Sobic008G143300--Sobic005G190300 Sobic002G096400 Sobic002G096400 Sobic008G143300--Sobic002G096400 Sobic008G143300--Sobic008G123350 Sobic005G152400 Sobic005G152400 Sobic008G143300--Sobic005G152400 Sobic008G143300--Sobic002G076600 Sobic008G143300--Sobic006G163200 Sobic005G064300 Sobic005G064300 Sobic008G143300--Sobic005G064300 Sobic008G143300--Sobic010G121800 Sobic006G189500--Sobic004G195400 Sobic006G189500--Sobic004G014700 Sobic006G189500--Sobic008G048600 Sobic006G189500--Sobic006G131100 Sobic006G189500--Sobic002G076600 Sobic003G411100 Sobic003G411100 Sobic006G189500--Sobic003G411100 Sobic006G189500--Sobic008G123350 Sobic006G006100 Sobic006G006100 Sobic006G189500--Sobic006G006100 Sobic005G064400 Sobic005G064400 Sobic006G189500--Sobic005G064400 Sobic004G014700--Sobic008G048600 Sobic004G014700--Sobic004G195400 Sobic004G014700--Sobic006G189500 Sobic004G014700--Sobic003G411100 Sobic004G014700--Sobic006G131100 Sobic004G014700--Sobic002G076600 Sobic004G014700--Sobic008G123350 Sobic004G014700--Sobic006G006100 Sobic004G014700--Sobic005G064400 Sobic004G195400--Sobic004G014700 Sobic004G195400--Sobic008G048600 Sobic004G195400--Sobic006G189500 Sobic004G195400--Sobic003G411100 Sobic004G195400--Sobic006G131100 Sobic004G195400--Sobic002G076600 Sobic001G324600 Sobic001G324600 Sobic004G195400--Sobic001G324600 Sobic004G195400--Sobic006G006100 Sobic006G144101 Sobic006G144101 Sobic004G195400--Sobic006G144101 Sobic010G121800--Sobic008G143200 Sobic010G121800--Sobic002G332000 Sobic010G121800--Sobic002G103000 Sobic010G121800--Sobic001G200800 Sobic010G121800--Sobic001G209701
Octagon: transcription factors


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