Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G131100.1
Synonym Sb06g021110
Functional annotation -
UniProt C5YBD8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010893
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G014700 THION20 - Plant thionin family protein precursor, putative, expressed -
2 Sobic.008G048600 - -
3 Sobic.006G189500 OsMADS17 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
4 Sobic.004G195400 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
5 Sobic.003G411100 transferase family protein, putative, expressed K15400: omega-hydroxypalmitate O-feruloyl transferase
6 Sobic.002G076600 rc - bHLH transcription factor regulating proanthocyanidin production in seeds, expressed -
7 Sobic.006G144101 - -
8 Sobic.006G006100 expressed protein -
9 Sobic.005G064400 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
10 Sobic.005G179700 OsMADS89 - MADS-box family gene with M-gamma type-box, expressed -
11 Sobic.002G345500 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
12 Sobic.002G151700 alpha-galactosidase precursor, putative, expressed K07407: E3.2.1.22B, galA, alpha-galactosidase
13 Sobic.002G352501 - -
14 Sobic.008G123350 - -
15 Sobic.006G006000 expressed protein -
16 Sobic.006G007001 - -
17 Sobic.005G200400 - -
18 Sobic.004G221700 expressed protein -
19 Sobic.002G352401 - -
20 Sobic.001G324600 cysteine proteinase inhibitor 8 precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G131100 Sobic006G131100 Sobic004G014700 Sobic004G014700 Sobic006G131100--Sobic004G014700 Sobic008G048600 Sobic008G048600 Sobic006G131100--Sobic008G048600 Sobic006G189500 Sobic006G189500 Sobic006G131100--Sobic006G189500 Sobic004G195400 Sobic004G195400 Sobic006G131100--Sobic004G195400 Sobic003G411100 Sobic003G411100 Sobic006G131100--Sobic003G411100 Sobic002G076600 Sobic002G076600 Sobic006G131100--Sobic002G076600 Sobic006G144101 Sobic006G144101 Sobic006G131100--Sobic006G144101 Sobic006G006100 Sobic006G006100 Sobic006G131100--Sobic006G006100 Sobic005G064400 Sobic005G064400 Sobic006G131100--Sobic005G064400 Sobic004G014700--Sobic008G048600 Sobic004G014700--Sobic004G195400 Sobic004G014700--Sobic006G189500 Sobic004G014700--Sobic003G411100 Sobic004G014700--Sobic006G131100 Sobic004G014700--Sobic002G076600 Sobic008G123350 Sobic008G123350 Sobic004G014700--Sobic008G123350 Sobic004G014700--Sobic006G006100 Sobic004G014700--Sobic005G064400 Sobic008G048600--Sobic003G411100 Sobic008G048600--Sobic004G014700 Sobic008G048600--Sobic004G195400 Sobic008G048600--Sobic006G144101 Sobic008G048600--Sobic006G189500 Sobic008G048600--Sobic006G131100 Sobic002G345500 Sobic002G345500 Sobic008G048600--Sobic002G345500 Sobic005G179700 Sobic005G179700 Sobic008G048600--Sobic005G179700 Sobic005G200400 Sobic005G200400 Sobic008G048600--Sobic005G200400 Sobic006G189500--Sobic004G195400 Sobic006G189500--Sobic004G014700 Sobic006G189500--Sobic008G048600 Sobic006G189500--Sobic006G131100 Sobic006G189500--Sobic002G076600 Sobic006G189500--Sobic003G411100 Sobic006G189500--Sobic008G123350 Sobic006G189500--Sobic006G006100 Sobic006G189500--Sobic005G064400 Sobic004G195400--Sobic004G014700 Sobic004G195400--Sobic008G048600 Sobic004G195400--Sobic006G189500 Sobic004G195400--Sobic003G411100 Sobic004G195400--Sobic006G131100 Sobic004G195400--Sobic002G076600 Sobic001G324600 Sobic001G324600 Sobic004G195400--Sobic001G324600 Sobic004G195400--Sobic006G006100 Sobic004G195400--Sobic006G144101 Sobic003G411100--Sobic006G144101 Sobic003G411100--Sobic008G048600 Sobic003G411100--Sobic002G345500 Sobic004G090400 Sobic004G090400 Sobic003G411100--Sobic004G090400 Sobic003G411100--Sobic005G200400 Sobic002G352501 Sobic002G352501 Sobic003G411100--Sobic002G352501 Sobic003G411100--Sobic005G179700 Sobic002G162100 Sobic002G162100 Sobic003G411100--Sobic002G162100 Sobic003G411100--Sobic004G014700 Sobic002G076600--Sobic004G014700 Sobic002G076600--Sobic008G123350 Sobic002G076600--Sobic006G189500 Sobic002G076600--Sobic006G131100 Sobic005G070800 Sobic005G070800 Sobic002G076600--Sobic005G070800 Sobic002G076600--Sobic004G195400 Sobic005G190300 Sobic005G190300 Sobic002G076600--Sobic005G190300 Sobic002G076600--Sobic008G048600 Sobic006G163200 Sobic006G163200 Sobic002G076600--Sobic006G163200 Sobic006G144101--Sobic002G345500 Sobic006G144101--Sobic005G200400 Sobic006G144101--Sobic002G162100 Sobic006G144101--Sobic004G090400 Sobic006G144101--Sobic003G411100 Sobic005G153300 Sobic005G153300 Sobic006G144101--Sobic005G153300 Sobic006G144101--Sobic002G352501 Sobic006G144101--Sobic005G179700 Sobic008G071200 Sobic008G071200 Sobic006G144101--Sobic008G071200 Sobic006G006000 Sobic006G006000 Sobic006G006100--Sobic006G006000 Sobic005G081800 Sobic005G081800 Sobic006G006100--Sobic005G081800 Sobic010G129300 Sobic010G129300 Sobic006G006100--Sobic010G129300 Sobic006G007001 Sobic006G007001 Sobic006G006100--Sobic006G007001 Sobic002G095000 Sobic002G095000 Sobic006G006100--Sobic002G095000 Sobic004G029500 Sobic004G029500 Sobic006G006100--Sobic004G029500 Sobic006G006100--Sobic005G064400 Sobic002G058100 Sobic002G058100 Sobic006G006100--Sobic002G058100 Sobic010G191400 Sobic010G191400 Sobic006G006100--Sobic010G191400 Sobic005G064400--Sobic006G007001 Sobic005G064400--Sobic010G129300 Sobic005G064400--Sobic006G006100 Sobic005G064400--Sobic005G081800 Sobic002G352401 Sobic002G352401 Sobic005G064400--Sobic002G352401 Sobic005G064400--Sobic004G029500 Sobic005G064400--Sobic002G095000 Sobic004G316400 Sobic004G316400 Sobic005G064400--Sobic004G316400 Sobic005G064400--Sobic002G058100
Octagon: transcription factors


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