Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G135901.4,Sobic.008G135901.3,Sobic.008G135901.2,Sobic.008G135901.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R725 , A0A1Z5R7N4 , A0A1Z5R6I9 , A0A1Z5R6M9
Pfam PF01095
Panther DB PTHR31321 PTHR31321:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology K01051; pectinesterase
Gene Ontology GO:0005618; cell wall


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G21610 : pectinesterase 11
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g44340.1 : pectinesterase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G314300 laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase
2 Sobic.003G404700 regulatory protein, putative, expressed -
3 Sobic.010G039600 - -
4 Sobic.008G161201 - K16287: ubiquitin-like-specific protease 1C/D
5 Sobic.004G029601 - -
6 Sobic.005G064300 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
7 Sobic.008G188300 - -
8 Sobic.008G181600 thaumatin, putative, expressed -
9 Sobic.001G345700 zinc-binding protein, putative, expressed -
10 Sobic.006G194900 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G096400 expressed protein -
12 Sobic.005G027100 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
13 Sobic.004G316400 - -
14 Sobic.005G152400 - -
15 Sobic.009G019900 - -
16 Sobic.002G352501 - -
17 Sobic.001G312200 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
18 Sobic.004G309200 alpha-amylase precursor, putative, expressed K01176: AMY, amyA, alpha-amylase
19 Sobic.006G022900 cytochrome P450, putative, expressed -
20 Sobic.001G345600 zinc-binding protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G135901 Sobic008G135901 Sobic004G314300 Sobic004G314300 Sobic008G135901--Sobic004G314300 Sobic003G404700 Sobic003G404700 Sobic008G135901--Sobic003G404700 Sobic010G039600 Sobic010G039600 Sobic008G135901--Sobic010G039600 Sobic008G161201 Sobic008G161201 Sobic008G135901--Sobic008G161201 Sobic004G029601 Sobic004G029601 Sobic008G135901--Sobic004G029601 Sobic005G064300 Sobic005G064300 Sobic008G135901--Sobic005G064300 Sobic008G188300 Sobic008G188300 Sobic008G135901--Sobic008G188300 Sobic008G181600 Sobic008G181600 Sobic008G135901--Sobic008G181600 Sobic001G345700 Sobic001G345700 Sobic008G135901--Sobic001G345700 Sobic004G314300--Sobic008G135901 Sobic005G027100 Sobic005G027100 Sobic004G314300--Sobic005G027100 Sobic002G352501 Sobic002G352501 Sobic004G314300--Sobic002G352501 Sobic006G194900 Sobic006G194900 Sobic004G314300--Sobic006G194900 Sobic002G345500 Sobic002G345500 Sobic004G314300--Sobic002G345500 Sobic001G324600 Sobic001G324600 Sobic004G314300--Sobic001G324600 Sobic004G314300--Sobic003G404700 Sobic005G200400 Sobic005G200400 Sobic004G314300--Sobic005G200400 Sobic006G144101 Sobic006G144101 Sobic004G314300--Sobic006G144101 Sobic009G039200 Sobic009G039200 Sobic003G404700--Sobic009G039200 Sobic003G404700--Sobic008G188300 Sobic003G404700--Sobic008G135901 Sobic003G404700--Sobic005G027100 Sobic005G098300 Sobic005G098300 Sobic003G404700--Sobic005G098300 Sobic006G022900 Sobic006G022900 Sobic003G404700--Sobic006G022900 Sobic006G227100 Sobic006G227100 Sobic003G404700--Sobic006G227100 Sobic003G404700--Sobic004G314300 Sobic003G404700--Sobic010G039600 Sobic010G039600--Sobic005G064300 Sobic010G039600--Sobic008G181600 Sobic010G039600--Sobic008G161201 Sobic010G039600--Sobic001G345700 Sobic002G096400 Sobic002G096400 Sobic010G039600--Sobic002G096400 Sobic010G039600--Sobic004G029601 Sobic001G345600 Sobic001G345600 Sobic010G039600--Sobic001G345600 Sobic010G039600--Sobic008G135901 Sobic009G019900 Sobic009G019900 Sobic010G039600--Sobic009G019900 Sobic008G161201--Sobic004G029601 Sobic008G161201--Sobic010G039600 Sobic008G161201--Sobic005G064300 Sobic008G161201--Sobic008G135901 Sobic008G161201--Sobic008G181600 Sobic008G161201--Sobic002G096400 Sobic008G161201--Sobic001G345700 Sobic004G321500 Sobic004G321500 Sobic008G161201--Sobic004G321500 Sobic008G161201--Sobic003G404700 Sobic004G029601--Sobic008G161201 Sobic004G029601--Sobic010G039600 Sobic004G029601--Sobic008G135901 Sobic010G121900 Sobic010G121900 Sobic004G029601--Sobic010G121900 Sobic004G029601--Sobic005G064300 Sobic004G029601--Sobic004G321500 Sobic004G029601--Sobic008G181600 Sobic004G029601--Sobic001G345700 Sobic004G015150 Sobic004G015150 Sobic004G029601--Sobic004G015150 Sobic005G064300--Sobic008G181600 Sobic005G064300--Sobic002G096400 Sobic005G064300--Sobic001G345700 Sobic005G064300--Sobic010G039600 Sobic005G064300--Sobic001G345600 Sobic001G312200 Sobic001G312200 Sobic005G064300--Sobic001G312200 Sobic005G152400 Sobic005G152400 Sobic005G064300--Sobic005G152400 Sobic008G122300 Sobic008G122300 Sobic005G064300--Sobic008G122300 Sobic005G131100 Sobic005G131100 Sobic005G064300--Sobic005G131100 Sobic004G316400 Sobic004G316400 Sobic008G188300--Sobic004G316400 Sobic005G153100 Sobic005G153100 Sobic008G188300--Sobic005G153100 Sobic010G129300 Sobic010G129300 Sobic008G188300--Sobic010G129300 Sobic002G058100 Sobic002G058100 Sobic008G188300--Sobic002G058100 Sobic005G154000 Sobic005G154000 Sobic008G188300--Sobic005G154000 Sobic005G027200 Sobic005G027200 Sobic008G188300--Sobic005G027200 Sobic002G399700 Sobic002G399700 Sobic008G188300--Sobic002G399700 Sobic008G188300--Sobic001G312200 Sobic002G095000 Sobic002G095000 Sobic008G188300--Sobic002G095000 Sobic008G181600--Sobic005G064300 Sobic008G181600--Sobic001G345700 Sobic008G181600--Sobic001G345600 Sobic008G181600--Sobic002G096400 Sobic008G181600--Sobic001G312200 Sobic008G181600--Sobic005G152400 Sobic008G181600--Sobic008G122300 Sobic008G181600--Sobic010G039600 Sobic008G181600--Sobic005G131100 Sobic001G345700--Sobic008G181600 Sobic001G345700--Sobic005G064300 Sobic001G345700--Sobic001G345600 Sobic001G345700--Sobic002G096400 Sobic001G345700--Sobic001G312200 Sobic001G345700--Sobic008G122300 Sobic001G345700--Sobic010G039600 Sobic001G345700--Sobic005G152400 Sobic001G345700--Sobic005G131100
Octagon: transcription factors


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