Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G009100.3,Sobic.001G009100.1,Sobic.001G009100.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S4D3 , A0A1Z5S3U8 , A0A1B6QGS1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g46690.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G195400 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
2 Sobic.004G014700 THION20 - Plant thionin family protein precursor, putative, expressed -
3 Sobic.008G048600 - -
4 Sobic.006G189500 OsMADS17 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
5 Sobic.003G411100 transferase family protein, putative, expressed K15400: omega-hydroxypalmitate O-feruloyl transferase
6 Sobic.006G131100 - -
7 Sobic.002G076600 rc - bHLH transcription factor regulating proanthocyanidin production in seeds, expressed -
8 Sobic.001G324600 cysteine proteinase inhibitor 8 precursor, putative, expressed -
9 Sobic.008G123350 - -
10 Sobic.006G006100 expressed protein -
11 Sobic.006G144101 - -
12 Sobic.005G064400 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
13 Sobic.002G352501 - -
14 Sobic.004G316400 - -
15 Sobic.006G194900 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
16 Sobic.002G345500 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
17 Sobic.008G143300 - -
18 Sobic.006G006000 expressed protein -
19 Sobic.005G179700 OsMADS89 - MADS-box family gene with M-gamma type-box, expressed -
20 Sobic.008G188300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G009100 Sobic001G009100 Sobic004G195400 Sobic004G195400 Sobic001G009100--Sobic004G195400 Sobic004G014700 Sobic004G014700 Sobic001G009100--Sobic004G014700 Sobic008G048600 Sobic008G048600 Sobic001G009100--Sobic008G048600 Sobic006G189500 Sobic006G189500 Sobic001G009100--Sobic006G189500 Sobic003G411100 Sobic003G411100 Sobic001G009100--Sobic003G411100 Sobic006G131100 Sobic006G131100 Sobic001G009100--Sobic006G131100 Sobic002G076600 Sobic002G076600 Sobic001G009100--Sobic002G076600 Sobic001G324600 Sobic001G324600 Sobic001G009100--Sobic001G324600 Sobic008G123350 Sobic008G123350 Sobic001G009100--Sobic008G123350 Sobic004G195400--Sobic004G014700 Sobic004G195400--Sobic008G048600 Sobic004G195400--Sobic006G189500 Sobic004G195400--Sobic003G411100 Sobic004G195400--Sobic006G131100 Sobic004G195400--Sobic002G076600 Sobic004G195400--Sobic001G324600 Sobic006G006100 Sobic006G006100 Sobic004G195400--Sobic006G006100 Sobic006G144101 Sobic006G144101 Sobic004G195400--Sobic006G144101 Sobic004G014700--Sobic008G048600 Sobic004G014700--Sobic004G195400 Sobic004G014700--Sobic006G189500 Sobic004G014700--Sobic003G411100 Sobic004G014700--Sobic006G131100 Sobic004G014700--Sobic002G076600 Sobic004G014700--Sobic008G123350 Sobic004G014700--Sobic006G006100 Sobic005G064400 Sobic005G064400 Sobic004G014700--Sobic005G064400 Sobic008G048600--Sobic003G411100 Sobic008G048600--Sobic004G014700 Sobic008G048600--Sobic004G195400 Sobic008G048600--Sobic006G144101 Sobic008G048600--Sobic006G189500 Sobic008G048600--Sobic006G131100 Sobic002G345500 Sobic002G345500 Sobic008G048600--Sobic002G345500 Sobic005G179700 Sobic005G179700 Sobic008G048600--Sobic005G179700 Sobic005G200400 Sobic005G200400 Sobic008G048600--Sobic005G200400 Sobic006G189500--Sobic004G195400 Sobic006G189500--Sobic004G014700 Sobic006G189500--Sobic008G048600 Sobic006G189500--Sobic006G131100 Sobic006G189500--Sobic002G076600 Sobic006G189500--Sobic003G411100 Sobic006G189500--Sobic008G123350 Sobic006G189500--Sobic006G006100 Sobic006G189500--Sobic005G064400 Sobic003G411100--Sobic006G144101 Sobic003G411100--Sobic008G048600 Sobic003G411100--Sobic002G345500 Sobic004G090400 Sobic004G090400 Sobic003G411100--Sobic004G090400 Sobic003G411100--Sobic005G200400 Sobic002G352501 Sobic002G352501 Sobic003G411100--Sobic002G352501 Sobic003G411100--Sobic005G179700 Sobic002G162100 Sobic002G162100 Sobic003G411100--Sobic002G162100 Sobic003G411100--Sobic004G014700 Sobic006G131100--Sobic004G014700 Sobic006G131100--Sobic008G048600 Sobic006G131100--Sobic006G189500 Sobic006G131100--Sobic004G195400 Sobic006G131100--Sobic003G411100 Sobic006G131100--Sobic002G076600 Sobic006G131100--Sobic006G144101 Sobic006G131100--Sobic006G006100 Sobic006G131100--Sobic005G064400 Sobic002G076600--Sobic004G014700 Sobic002G076600--Sobic008G123350 Sobic002G076600--Sobic006G189500 Sobic002G076600--Sobic006G131100 Sobic005G070800 Sobic005G070800 Sobic002G076600--Sobic005G070800 Sobic002G076600--Sobic004G195400 Sobic005G190300 Sobic005G190300 Sobic002G076600--Sobic005G190300 Sobic002G076600--Sobic008G048600 Sobic006G163200 Sobic006G163200 Sobic002G076600--Sobic006G163200 Sobic001G324600--Sobic006G144101 Sobic001G324600--Sobic003G411100 Sobic001G324600--Sobic002G345500 Sobic008G071200 Sobic008G071200 Sobic001G324600--Sobic008G071200 Sobic002G162200 Sobic002G162200 Sobic001G324600--Sobic002G162200 Sobic005G153300 Sobic005G153300 Sobic001G324600--Sobic005G153300 Sobic008G182200 Sobic008G182200 Sobic001G324600--Sobic008G182200 Sobic001G324600--Sobic008G048600 Sobic004G015100 Sobic004G015100 Sobic001G324600--Sobic004G015100 Sobic008G123350--Sobic005G190300 Sobic010G121800 Sobic010G121800 Sobic008G123350--Sobic010G121800 Sobic001G200800 Sobic001G200800 Sobic008G123350--Sobic001G200800 Sobic002G332000 Sobic002G332000 Sobic008G123350--Sobic002G332000 Sobic008G143200 Sobic008G143200 Sobic008G123350--Sobic008G143200 Sobic002G103000 Sobic002G103000 Sobic008G123350--Sobic002G103000 Sobic007G040400 Sobic007G040400 Sobic008G123350--Sobic007G040400 Sobic005G147400 Sobic005G147400 Sobic008G123350--Sobic005G147400 Sobic005G196400 Sobic005G196400 Sobic008G123350--Sobic005G196400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.