Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G125600.1
Synonym Sb07g020230
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YKV4
Pfam -
Panther DB PTHR33124 PTHR33124:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G57780 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g31950.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a006082
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G076600 rc - bHLH transcription factor regulating proanthocyanidin production in seeds, expressed -
2 Sobic.005G070800 - -
3 Sobic.001G152901 "YABBY transcription factor, "(PubMedID : 22581231) -
4 Sobic.008G123350 - -
5 Sobic.005G190300 - -
6 Sobic.006G163200 COBRA, putative, expressed -
7 Sobic.004G215500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
8 Sobic.002G096400 expressed protein -
9 Sobic.008G143300 - -
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12 Sobic.001G200800 LTPL160 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
13 Sobic.004G014700 THION20 - Plant thionin family protein precursor, putative, expressed -
14 Sobic.001G009100 expressed protein -
15 Sobic.010G121800 expansin precursor, putative, expressed -
16 Sobic.002G332000 CRP8 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -
17 Sobic.005G064300 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G183200 methyl-CpG binding domain containing protein, expressed -
19 Sobic.003G443800 expressed protein -
20 Sobic.002G103000 PME/invertase inhibitor, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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