Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G259300.1
Synonym Sb09g030850
Functional annotation rhamnogalacturonate lyase, putative, expressed
UniProt A0A1B6PAI8
Pfam PF14686 PF14683 PF06045
Panther DB PTHR32018 PTHR32018:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology K18195; RGL4, rhamnogalacturonan endolyase
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G09890 : Rhamnogalacturonate lyase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g03790.1 : rhamnogalacturonate lyase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a019504 , Zm00025a019503 , Zm00025a033385
Brachypodium -
Barley HORVU6Hr1G010870.8 , HORVU6Hr1G010870.9 , HORVU6Hr1G010870.1 , HORVU6Hr1G010870.2 , HORVU6Hr1G010870.4 , HORVU6Hr1G010870.5 , HORVU6Hr1G010870.6 , HORVU6Hr1G010870.7 , HORVU4Hr1G026250.3 , HORVU4Hr1G026250.2 , HORVU4Hr1G026250.1 , HORVU4Hr1G026250.6 , HORVU4Hr1G026250.5 , HORVU4Hr1G026250.4
Wheat TraesCS4A02G187200 , TraesCSU02G121100 , TraesCS6B02G078500 , TraesCS6A02G055300 , TraesCS6A02G055300 , TraesCS4B02G130900 , TraesCS4D02G126300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Gene co-expression network
sample Sobic009G259300 Sobic009G259300 Sobic003G440200 Sobic003G440200 Sobic009G259300--Sobic003G440200 Sobic006G159350 Sobic006G159350 Sobic009G259300--Sobic006G159350 Sobic006G060400 Sobic006G060400 Sobic009G259300--Sobic006G060400 Sobic003G034350 Sobic003G034350 Sobic009G259300--Sobic003G034350 Sobic008G134401 Sobic008G134401 Sobic009G259300--Sobic008G134401 Sobic001G042100 Sobic001G042100 Sobic009G259300--Sobic001G042100 Sobic001G334800 Sobic001G334800 Sobic009G259300--Sobic001G334800 Sobic004G091800 Sobic004G091800 Sobic009G259300--Sobic004G091800 Sobic008G174850 Sobic008G174850 Sobic009G259300--Sobic008G174850 Sobic003G440200--Sobic009G259300 Sobic003G109000 Sobic003G109000 Sobic003G440200--Sobic003G109000 Sobic001G377900 Sobic001G377900 Sobic003G440200--Sobic001G377900 Sobic010G127901 Sobic010G127901 Sobic003G440200--Sobic010G127901 Sobic004G173300 Sobic004G173300 Sobic003G440200--Sobic004G173300 Sobic002G280800 Sobic002G280800 Sobic003G440200--Sobic002G280800 Sobic003G440200--Sobic006G060400 Sobic006G214800 Sobic006G214800 Sobic003G440200--Sobic006G214800 Sobic005G131500 Sobic005G131500 Sobic003G440200--Sobic005G131500 Sobic006G159350--Sobic003G034350 Sobic002G145600 Sobic002G145600 Sobic006G159350--Sobic002G145600 Sobic004G313750 Sobic004G313750 Sobic006G159350--Sobic004G313750 Sobic004G248000 Sobic004G248000 Sobic006G159350--Sobic004G248000 Sobic001G377400 Sobic001G377400 Sobic006G159350--Sobic001G377400 Sobic006G159350--Sobic009G259300 Sobic007G177901 Sobic007G177901 Sobic006G159350--Sobic007G177901 Sobic006G159350--Sobic008G134401 Sobic004G149150 Sobic004G149150 Sobic006G159350--Sobic004G149150 Sobic005G161750 Sobic005G161750 Sobic006G060400--Sobic005G161750 Sobic007G050750 Sobic007G050750 Sobic006G060400--Sobic007G050750 Sobic001G112550 Sobic001G112550 Sobic006G060400--Sobic001G112550 Sobic002G018800 Sobic002G018800 Sobic006G060400--Sobic002G018800 Sobic006G113301 Sobic006G113301 Sobic006G060400--Sobic006G113301 Sobic006G060400--Sobic001G334800 Sobic010G003800 Sobic010G003800 Sobic006G060400--Sobic010G003800 Sobic006G250350 Sobic006G250350 Sobic006G060400--Sobic006G250350 Sobic007G050650 Sobic007G050650 Sobic006G060400--Sobic007G050650 Sobic004G176550 Sobic004G176550 Sobic003G034350--Sobic004G176550 Sobic010G241400 Sobic010G241400 Sobic003G034350--Sobic010G241400 Sobic003G034350--Sobic004G313750 Sobic005G168900 Sobic005G168900 Sobic003G034350--Sobic005G168900 Sobic001G217850 Sobic001G217850 Sobic003G034350--Sobic001G217850 Sobic006G192900 Sobic006G192900 Sobic003G034350--Sobic006G192900 Sobic006G009200 Sobic006G009200 Sobic003G034350--Sobic006G009200 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic003G034350--Sobic002G062400 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic003G034350--Sobic007G045750 Sobic008G134401--Sobic001G334800 Sobic004G171300 Sobic004G171300 Sobic008G134401--Sobic004G171300 Sobic008G134401--Sobic001G042100 Sobic005G165300 Sobic005G165300 Sobic008G134401--Sobic005G165300 Sobic005G216833 Sobic005G216833 Sobic008G134401--Sobic005G216833 Sobic009G134700 Sobic009G134700 Sobic008G134401--Sobic009G134700 Sobic008G134401--Sobic002G018800 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic008G134401--Sobic006G159500 Sobic008G134401--Sobic001G377400 Sobic001G042100--Sobic006G250350 Sobic001G042100--Sobic006G113301 Sobic001G042100--Sobic001G112550 Sobic001G042100--Sobic002G018800 Sobic001G042100--Sobic007G050750 Sobic001G042100--Sobic007G050650 Sobic001G443400 Sobic001G443400 Sobic001G042100--Sobic001G443400 Sobic001G042100--Sobic005G165300 Sobic001G042100--Sobic010G003800 Sobic001G334800--Sobic005G165300 Sobic001G334800--Sobic002G018800 Sobic001G334800--Sobic010G003800 Sobic001G334800--Sobic005G216833 Sobic001G334800--Sobic005G161750 Sobic001G334800--Sobic001G112550 Sobic007G132300 Sobic007G132300 Sobic001G334800--Sobic007G132300 Sobic001G334800--Sobic006G250350 Sobic009G236150 Sobic009G236150 Sobic001G334800--Sobic009G236150 Sobic004G091800--Sobic001G334800 Sobic004G091800--Sobic005G216833 Sobic004G091800--Sobic009G236150 Sobic004G091800--Sobic005G165300 Sobic004G091800--Sobic002G018800 Sobic005G044101 Sobic005G044101 Sobic004G091800--Sobic005G044101 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic004G091800--Sobic003G261766 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic004G091800--Sobic009G115800 Sobic004G091800--Sobic005G161750 Sobic001G376332 Sobic001G376332 Sobic008G174850--Sobic001G376332 Sobic008G174850--Sobic006G113301 Sobic007G182700 Sobic007G182700 Sobic008G174850--Sobic007G182700 Sobic001G235600 Sobic001G235600 Sobic008G174850--Sobic001G235600 Sobic008G174850--Sobic006G250350 Sobic008G081100 Sobic008G081100 Sobic008G174850--Sobic008G081100 Sobic008G174200 Sobic008G174200 Sobic008G174850--Sobic008G174200 Sobic004G259800 Sobic004G259800 Sobic008G174850--Sobic004G259800 Sobic009G078401 Sobic009G078401 Sobic008G174850--Sobic009G078401
Octagon: transcription factors


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