Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G134401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R7M4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G334800 - -
2 Sobic.004G171300 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
3 Sobic.001G042100 expressed protein -
4 Sobic.005G165300 cyclin-dependent kinase G-1, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
5 Sobic.005G216833 - -
6 Sobic.009G134700 - -
7 Sobic.002G018800 expressed protein -
8 Sobic.006G159500 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
9 Sobic.001G377400 expressed protein -
10 Sobic.004G248000 expressed protein -
11 Sobic.009G236150 - -
12 Sobic.003G261766 - -
13 Sobic.009G115800 REX1 DNA Repair family protein, expressed K10845: TTDA, GTF2H5, TFIIH basal transcription factor complex TTD-A subunit
14 Sobic.004G313000 leucine rich repeat containing protein, expressed -
15 Sobic.010G003800 expressed protein -
16 Sobic.007G132300 inactive receptor kinase At2g26730 precursor, putative, expressed -
17 Sobic.002G319900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@AAA family ATPase, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
18 Sobic.005G044101 - -
19 Sobic.003G267150 - -
20 Sobic.005G161750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G134401 Sobic008G134401 Sobic001G334800 Sobic001G334800 Sobic008G134401--Sobic001G334800 Sobic004G171300 Sobic004G171300 Sobic008G134401--Sobic004G171300 Sobic001G042100 Sobic001G042100 Sobic008G134401--Sobic001G042100 Sobic005G165300 Sobic005G165300 Sobic008G134401--Sobic005G165300 Sobic005G216833 Sobic005G216833 Sobic008G134401--Sobic005G216833 Sobic009G134700 Sobic009G134700 Sobic008G134401--Sobic009G134700 Sobic002G018800 Sobic002G018800 Sobic008G134401--Sobic002G018800 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic008G134401--Sobic006G159500 Sobic001G377400 Sobic001G377400 Sobic008G134401--Sobic001G377400 Sobic001G334800--Sobic005G165300 Sobic001G334800--Sobic002G018800 Sobic010G003800 Sobic010G003800 Sobic001G334800--Sobic010G003800 Sobic001G334800--Sobic005G216833 Sobic005G161750 Sobic005G161750 Sobic001G334800--Sobic005G161750 Sobic001G112550 Sobic001G112550 Sobic001G334800--Sobic001G112550 Sobic007G132300 Sobic007G132300 Sobic001G334800--Sobic007G132300 Sobic006G250350 Sobic006G250350 Sobic001G334800--Sobic006G250350 Sobic009G236150 Sobic009G236150 Sobic001G334800--Sobic009G236150 Sobic004G171300--Sobic008G134401 Sobic002G145600 Sobic002G145600 Sobic004G171300--Sobic002G145600 Sobic004G171300--Sobic001G377400 Sobic004G171300--Sobic009G134700 Sobic009G134450 Sobic009G134450 Sobic004G171300--Sobic009G134450 Sobic004G248000 Sobic004G248000 Sobic004G171300--Sobic004G248000 Sobic007G177901 Sobic007G177901 Sobic004G171300--Sobic007G177901 Sobic010G222300 Sobic010G222300 Sobic004G171300--Sobic010G222300 Sobic010G207175 Sobic010G207175 Sobic004G171300--Sobic010G207175 Sobic001G042100--Sobic006G250350 Sobic006G113301 Sobic006G113301 Sobic001G042100--Sobic006G113301 Sobic001G042100--Sobic001G112550 Sobic001G042100--Sobic002G018800 Sobic007G050750 Sobic007G050750 Sobic001G042100--Sobic007G050750 Sobic007G050650 Sobic007G050650 Sobic001G042100--Sobic007G050650 Sobic001G443400 Sobic001G443400 Sobic001G042100--Sobic001G443400 Sobic001G042100--Sobic005G165300 Sobic001G042100--Sobic010G003800 Sobic005G165300--Sobic001G334800 Sobic005G165300--Sobic002G018800 Sobic005G165300--Sobic005G216833 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic005G165300--Sobic003G261766 Sobic005G165300--Sobic010G003800 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic005G165300--Sobic009G115800 Sobic005G165300--Sobic006G250350 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic005G165300--Sobic006G083050 Sobic005G165300--Sobic009G236150 Sobic004G313000 Sobic004G313000 Sobic005G216833--Sobic004G313000 Sobic005G216833--Sobic009G115800 Sobic005G216833--Sobic009G236150 Sobic005G216833--Sobic003G261766 Sobic003G267150 Sobic003G267150 Sobic005G216833--Sobic003G267150 Sobic005G216833--Sobic006G159500 Sobic008G108100 Sobic008G108100 Sobic005G216833--Sobic008G108100 Sobic002G160500 Sobic002G160500 Sobic005G216833--Sobic002G160500 Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic009G134700--Sobic005G041150 Sobic009G134700--Sobic006G159500 Sobic009G134700--Sobic009G115800 Sobic009G134700--Sobic003G261766 Sobic009G134700--Sobic006G083050 Sobic009G134700--Sobic005G216833 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic009G134700--Sobic007G179100 Sobic002G319900 Sobic002G319900 Sobic009G134700--Sobic002G319900 Sobic009G134700--Sobic004G313000 Sobic002G018800--Sobic001G334800 Sobic002G018800--Sobic010G003800 Sobic002G018800--Sobic001G112550 Sobic002G018800--Sobic005G165300 Sobic002G018800--Sobic005G161750 Sobic002G018800--Sobic007G050750 Sobic002G018800--Sobic006G250350 Sobic002G018800--Sobic001G042100 Sobic002G018800--Sobic007G050650 Sobic006G159500--Sobic009G115800 Sobic006G159500--Sobic003G261766 Sobic006G159500--Sobic004G313000 Sobic006G159500--Sobic003G267150 Sobic006G159500--Sobic005G216833 Sobic006G159500--Sobic002G319900 Sobic006G159500--Sobic002G160500 Sobic001G377400--Sobic004G248000 Sobic001G377400--Sobic002G319900 Sobic001G377400--Sobic003G267150 Sobic001G377400--Sobic004G313000 Sobic001G377400--Sobic002G160500
Octagon: transcription factors


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