Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G440200.2,Sobic.003G440200.1
Synonym Sb03g046990
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W1L9 , A0A1W0W1K7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g73490.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G259300 rhamnogalacturonate lyase, putative, expressed K18195: RGL4, rhamnogalacturonan endolyase
2 Sobic.003G109000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
3 Sobic.001G377900 OsFBX9 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.010G127901 - -
5 Sobic.004G173300 expressed protein -
6 Sobic.002G280800 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
7 Sobic.006G060400 expressed protein -
8 Sobic.006G214800 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
9 Sobic.005G131500 - -
10 Sobic.010G229025 - -
11 Sobic.005G165032 - -
12 Sobic.009G045400 - K10900: WRN, werner syndrome ATP-dependent helicase
13 Sobic.001G490800 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
14 Sobic.010G066100 BTBN14 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 domain, expressed -
15 Sobic.001G334800 - -
16 Sobic.009G189600 - -
17 Sobic.010G174900 S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed -
18 Sobic.006G089266 - -
19 Sobic.003G125801 - -
20 Sobic.006G113301 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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