Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G165032.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RIX6
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF90
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G38570 : F-box/RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g09474.1 : OsFBX400 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G181500 - -
2 Sobic.001G441900 oxidoreductase, putative, expressed -
3 Sobic.002G076300 - -
4 Sobic.003G338600 - -
5 Sobic.003G433000 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
6 Sobic.010G100700 HEAT repeat family protein, putative, expressed -
7 Sobic.003G023450 - -
8 Sobic.003G069601 - -
9 Sobic.001G498033 - -
10 Sobic.002G377501 - -
11 Sobic.009G055000 - -
12 Sobic.002G262850 - -
13 Sobic.008G137200 Mur ligase family protein, putative, expressed -
14 Sobic.010G195000 guanine nucleotide exchange family protein, putative, expressed K18442: ARFGEF, brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein
15 Sobic.002G307500 MATH domain containing protein, expressed -
16 Sobic.010G054700 - -
17 Sobic.008G046700 nodulation-signaling pathway 2 protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G236501 - -
19 Sobic.002G374000 - -
20 Sobic.006G235801 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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