Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G338600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q6S2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT73122
Barley HORVU3Hr1G081140.1
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G338600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G064300 cytokinin-O-glucosyltransferase 1, putative, expressed -
2 Sobic.002G181500 - -
3 Sobic.003G023450 - -
4 Sobic.005G152866 - -
5 Sobic.002G012100 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G281850 - -
7 Sobic.001G059001 - -
8 Sobic.007G078700 - -
9 Sobic.003G030450 - -
10 Sobic.010G100700 HEAT repeat family protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G213832 - -
12 Sobic.007G141900 resistance protein SlVe1 precursor, putative, expressed -
13 Sobic.008G047150 - -
14 Sobic.008G067000 syntaxin-related protein KNOLLE, putative, expressed K08486: syntaxin 1B/2/3
15 Sobic.008G072800 OsMADS33 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
16 Sobic.006G268900 "STKc_IRAK, catalytic domain of the serine/threonine kinases"(PubMedID : 29491869)@expressed protein -
17 Sobic.009G106601 - -
18 Sobic.009G087540 - -
19 Sobic.005G137500 - -
20 Sobic.004G242800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G338600 Sobic003G338600 Sobic009G064300 Sobic009G064300 Sobic003G338600--Sobic009G064300 Sobic002G181500 Sobic002G181500 Sobic003G338600--Sobic002G181500 Sobic003G023450 Sobic003G023450 Sobic003G338600--Sobic003G023450 Sobic005G152866 Sobic005G152866 Sobic003G338600--Sobic005G152866 Sobic002G012100 Sobic002G012100 Sobic003G338600--Sobic002G012100 Sobic002G281850 Sobic002G281850 Sobic003G338600--Sobic002G281850 Sobic001G059001 Sobic001G059001 Sobic003G338600--Sobic001G059001 Sobic007G078700 Sobic007G078700 Sobic003G338600--Sobic007G078700 Sobic003G030450 Sobic003G030450 Sobic003G338600--Sobic003G030450 Sobic009G064300--Sobic001G059001 Sobic009G064300--Sobic002G012100 Sobic009G064300--Sobic007G078700 Sobic007G141900 Sobic007G141900 Sobic009G064300--Sobic007G141900 Sobic009G064300--Sobic003G023450 Sobic009G064300--Sobic003G338600 Sobic008G072800 Sobic008G072800 Sobic009G064300--Sobic008G072800 Sobic005G137500 Sobic005G137500 Sobic009G064300--Sobic005G137500 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic009G064300--Sobic003G312900 Sobic008G046700 Sobic008G046700 Sobic002G181500--Sobic008G046700 Sobic002G181500--Sobic003G338600 Sobic001G261452 Sobic001G261452 Sobic002G181500--Sobic001G261452 Sobic002G181500--Sobic002G281850 Sobic003G263900 Sobic003G263900 Sobic002G181500--Sobic003G263900 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic002G181500--Sobic003G312800 Sobic010G100700 Sobic010G100700 Sobic002G181500--Sobic010G100700 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic002G181500--Sobic004G209100 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic002G181500--Sobic005G118800 Sobic003G023450--Sobic010G100700 Sobic003G023450--Sobic008G072800 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic003G023450--Sobic008G132500 Sobic003G023450--Sobic007G141900 Sobic003G023450--Sobic002G012100 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic003G023450--Sobic003G219300 Sobic004G150300 Sobic004G150300 Sobic003G023450--Sobic004G150300 Sobic003G023450--Sobic009G064300 Sobic003G023450--Sobic007G078700 Sobic005G152866--Sobic003G030450 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic005G152866--Sobic001G202450 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic005G152866--Sobic003G163000 Sobic005G152866--Sobic007G078700 Sobic006G052250 Sobic006G052250 Sobic005G152866--Sobic006G052250 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic005G152866--Sobic005G045250 Sobic001G136850 Sobic001G136850 Sobic005G152866--Sobic001G136850 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic005G152866--Sobic001G373850 Sobic005G152866--Sobic003G023450 Sobic002G012100--Sobic007G141900 Sobic001G167000 Sobic001G167000 Sobic002G012100--Sobic001G167000 Sobic002G012100--Sobic008G072800 Sobic004G206600 Sobic004G206600 Sobic002G012100--Sobic004G206600 Sobic008G067000 Sobic008G067000 Sobic002G012100--Sobic008G067000 Sobic004G242800 Sobic004G242800 Sobic002G012100--Sobic004G242800 Sobic010G196466 Sobic010G196466 Sobic002G012100--Sobic010G196466 Sobic002G012100--Sobic009G064300 Sobic002G012100--Sobic003G023450 Sobic002G281850--Sobic002G181500 Sobic005G180850 Sobic005G180850 Sobic002G281850--Sobic005G180850 Sobic002G281850--Sobic003G338600 Sobic002G281850--Sobic007G078700 Sobic002G281850--Sobic003G312900 Sobic002G281850--Sobic008G046700 Sobic004G169401 Sobic004G169401 Sobic002G281850--Sobic004G169401 Sobic002G281850--Sobic003G312800 Sobic009G037050 Sobic009G037050 Sobic002G281850--Sobic009G037050 Sobic001G059001--Sobic009G064300 Sobic001G059001--Sobic005G137500 Sobic001G190900 Sobic001G190900 Sobic001G059001--Sobic001G190900 Sobic001G059001--Sobic003G312900 Sobic001G059001--Sobic003G312800 Sobic001G059001--Sobic005G152866 Sobic001G059001--Sobic008G072800 Sobic001G059001--Sobic002G012100 Sobic010G183350 Sobic010G183350 Sobic001G059001--Sobic010G183350 Sobic007G078700--Sobic006G052250 Sobic006G146700 Sobic006G146700 Sobic007G078700--Sobic006G146700 Sobic007G078700--Sobic001G202450 Sobic007G078700--Sobic001G136850 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic007G078700--Sobic004G255550 Sobic007G078700--Sobic003G312900 Sobic007G078700--Sobic003G030450 Sobic006G162750 Sobic006G162750 Sobic007G078700--Sobic006G162750 Sobic008G083100 Sobic008G083100 Sobic007G078700--Sobic008G083100 Sobic003G030450--Sobic005G045250 Sobic003G030450--Sobic001G202450 Sobic003G030450--Sobic005G152866 Sobic003G030450--Sobic003G163000 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic003G030450--Sobic009G210250 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic003G030450--Sobic009G077000 Sobic007G115700 Sobic007G115700 Sobic003G030450--Sobic007G115700 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic003G030450--Sobic010G169950 Sobic001G107550 Sobic001G107550 Sobic003G030450--Sobic001G107550
Octagon: transcription factors


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