Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G242800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YRC9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G167000 HEAT repeat family protein, putative, expressed K11492: NCAPG2, condensin-2 complex subunit G2
2 Sobic.002G012100 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
3 Sobic.004G206600 osFTL5 FT-Like5 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T
4 Sobic.010G196466 - -
5 Sobic.009G175800 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G270800 ras-related protein, putative, expressed K07933: Rab-like protein 3
7 Sobic.003G330350 - -
8 Sobic.009G102250 - -
9 Sobic.009G087540 - -
10 Sobic.002G076300 - -
11 Sobic.004G299850 - -
12 Sobic.003G064901 - -
13 Sobic.010G100700 HEAT repeat family protein, putative, expressed -
14 Sobic.009G236900 - -
15 Sobic.007G141900 resistance protein SlVe1 precursor, putative, expressed -
16 Sobic.008G072800 OsMADS33 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
17 Sobic.004G248200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
18 Sobic.008G067000 syntaxin-related protein KNOLLE, putative, expressed K08486: syntaxin 1B/2/3
19 Sobic.006G131700 CRS1/YhbY domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G091900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G242800 Sobic004G242800 Sobic001G167000 Sobic001G167000 Sobic004G242800--Sobic001G167000 Sobic002G012100 Sobic002G012100 Sobic004G242800--Sobic002G012100 Sobic004G206600 Sobic004G206600 Sobic004G242800--Sobic004G206600 Sobic010G196466 Sobic010G196466 Sobic004G242800--Sobic010G196466 Sobic009G175800 Sobic009G175800 Sobic004G242800--Sobic009G175800 Sobic001G270800 Sobic001G270800 Sobic004G242800--Sobic001G270800 Sobic003G330350 Sobic003G330350 Sobic004G242800--Sobic003G330350 Sobic009G102250 Sobic009G102250 Sobic004G242800--Sobic009G102250 Sobic009G087540 Sobic009G087540 Sobic004G242800--Sobic009G087540 Sobic001G167000--Sobic002G012100 Sobic001G167000--Sobic004G242800 Sobic001G167000--Sobic001G270800 Sobic001G182800 Sobic001G182800 Sobic001G167000--Sobic001G182800 Sobic001G167000--Sobic003G330350 Sobic004G299850 Sobic004G299850 Sobic001G167000--Sobic004G299850 Sobic003G064901 Sobic003G064901 Sobic001G167000--Sobic003G064901 Sobic001G167000--Sobic010G196466 Sobic001G167000--Sobic009G102250 Sobic007G141900 Sobic007G141900 Sobic002G012100--Sobic007G141900 Sobic002G012100--Sobic001G167000 Sobic008G072800 Sobic008G072800 Sobic002G012100--Sobic008G072800 Sobic002G012100--Sobic004G206600 Sobic008G067000 Sobic008G067000 Sobic002G012100--Sobic008G067000 Sobic002G012100--Sobic004G242800 Sobic002G012100--Sobic010G196466 Sobic009G064300 Sobic009G064300 Sobic002G012100--Sobic009G064300 Sobic003G023450 Sobic003G023450 Sobic002G012100--Sobic003G023450 Sobic004G206600--Sobic010G196466 Sobic003G267200 Sobic003G267200 Sobic004G206600--Sobic003G267200 Sobic004G206600--Sobic002G012100 Sobic004G206600--Sobic004G242800 Sobic004G206600--Sobic001G167000 Sobic004G206600--Sobic007G141900 Sobic002G324801 Sobic002G324801 Sobic004G206600--Sobic002G324801 Sobic004G206600--Sobic009G087540 Sobic009G236900 Sobic009G236900 Sobic004G206600--Sobic009G236900 Sobic010G196466--Sobic004G206600 Sobic010G196466--Sobic007G141900 Sobic010G196466--Sobic002G012100 Sobic010G196466--Sobic001G167000 Sobic010G196466--Sobic002G324801 Sobic010G196466--Sobic003G267200 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic010G196466--Sobic002G009000 Sobic010G196466--Sobic004G242800 Sobic010G196466--Sobic008G072800 Sobic009G230600 Sobic009G230600 Sobic009G175800--Sobic009G230600 Sobic009G175800--Sobic004G242800 Sobic002G287600 Sobic002G287600 Sobic009G175800--Sobic002G287600 Sobic009G175800--Sobic008G072800 Sobic009G175800--Sobic004G299850 Sobic009G175800--Sobic002G012100 Sobic009G175800--Sobic001G167000 Sobic004G342200 Sobic004G342200 Sobic009G175800--Sobic004G342200 Sobic006G268900 Sobic006G268900 Sobic009G175800--Sobic006G268900 Sobic001G270800--Sobic003G330350 Sobic009G175700 Sobic009G175700 Sobic001G270800--Sobic009G175700 Sobic001G270800--Sobic001G167000 Sobic004G091900 Sobic004G091900 Sobic001G270800--Sobic004G091900 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic001G270800--Sobic006G131700 Sobic001G270800--Sobic003G064901 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic001G270800--Sobic003G169000 Sobic003G233266 Sobic003G233266 Sobic001G270800--Sobic003G233266 Sobic009G101500 Sobic009G101500 Sobic001G270800--Sobic009G101500 Sobic003G330350--Sobic001G270800 Sobic003G050100 Sobic003G050100 Sobic003G330350--Sobic003G050100 Sobic003G330350--Sobic006G131700 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic003G330350--Sobic003G218950 Sobic001G098700 Sobic001G098700 Sobic003G330350--Sobic001G098700 Sobic003G330350--Sobic004G091900 Sobic006G057100 Sobic006G057100 Sobic003G330350--Sobic006G057100 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic003G330350--Sobic009G192200 Sobic003G330350--Sobic001G167000 Sobic009G102250--Sobic003G064901 Sobic002G138400 Sobic002G138400 Sobic009G102250--Sobic002G138400 Sobic004G032200 Sobic004G032200 Sobic009G102250--Sobic004G032200 Sobic009G102250--Sobic001G167000 Sobic004G111200 Sobic004G111200 Sobic009G102250--Sobic004G111200 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic009G102250--Sobic001G182700 Sobic009G102250--Sobic010G196466 Sobic009G102250--Sobic001G270800 Sobic009G102250--Sobic001G182800 Sobic009G087540--Sobic001G270800 Sobic009G087540--Sobic003G267200 Sobic009G087540--Sobic004G206600 Sobic009G087540--Sobic002G012100 Sobic009G087540--Sobic009G175700 Sobic001G107550 Sobic001G107550 Sobic009G087540--Sobic001G107550 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic009G087540--Sobic009G210250 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic009G087540--Sobic005G045250 Sobic003G030450 Sobic003G030450 Sobic009G087540--Sobic003G030450
Octagon: transcription factors


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