Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G067000.1
Synonym SYP111, KN, ATSYP111, Sb08g005550
Functional annotation syntaxin-related protein KNOLLE, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R584
Pfam PF00804
Panther DB PTHR19957 PTHR19957:SF91
NCBI CDD KOG0810; SNARE protein Syntaxin 1 and related proteins
KEGG Orthology K08486; syntaxin 1B/2/3
Gene Ontology GO:0016020; membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G03330 : syntaxin of plants 123
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g08980.1 : syntaxin-related protein KNOLLE, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040674
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G067000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.010G196466 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G067000 Sobic008G067000 Sobic002G012100 Sobic002G012100 Sobic008G067000--Sobic002G012100 Sobic008G072800 Sobic008G072800 Sobic008G067000--Sobic008G072800 Sobic003G096950 Sobic003G096950 Sobic008G067000--Sobic003G096950 Sobic001G523150 Sobic001G523150 Sobic008G067000--Sobic001G523150 Sobic003G030450 Sobic003G030450 Sobic008G067000--Sobic003G030450 Sobic001G094550 Sobic001G094550 Sobic008G067000--Sobic001G094550 Sobic007G141900 Sobic007G141900 Sobic008G067000--Sobic007G141900 Sobic009G101500 Sobic009G101500 Sobic008G067000--Sobic009G101500 Sobic001G107550 Sobic001G107550 Sobic008G067000--Sobic001G107550 Sobic002G012100--Sobic007G141900 Sobic001G167000 Sobic001G167000 Sobic002G012100--Sobic001G167000 Sobic002G012100--Sobic008G072800 Sobic004G206600 Sobic004G206600 Sobic002G012100--Sobic004G206600 Sobic002G012100--Sobic008G067000 Sobic004G242800 Sobic004G242800 Sobic002G012100--Sobic004G242800 Sobic010G196466 Sobic010G196466 Sobic002G012100--Sobic010G196466 Sobic009G064300 Sobic009G064300 Sobic002G012100--Sobic009G064300 Sobic003G023450 Sobic003G023450 Sobic002G012100--Sobic003G023450 Sobic008G072800--Sobic007G141900 Sobic010G100700 Sobic010G100700 Sobic008G072800--Sobic010G100700 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic008G072800--Sobic008G142200 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic008G072800--Sobic006G072701 Sobic008G072800--Sobic002G012100 Sobic008G072800--Sobic003G023450 Sobic002G324801 Sobic002G324801 Sobic008G072800--Sobic002G324801 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic008G072800--Sobic008G132500 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic008G072800--Sobic001G191500 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic003G096950--Sobic007G182300 Sobic003G096950--Sobic006G072701 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic003G096950--Sobic004G084600 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic003G096950--Sobic006G111000 Sobic009G146500 Sobic009G146500 Sobic003G096950--Sobic009G146500 Sobic001G037033 Sobic001G037033 Sobic003G096950--Sobic001G037033 Sobic008G083100 Sobic008G083100 Sobic003G096950--Sobic008G083100 Sobic003G096950--Sobic008G067000 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic003G096950--Sobic006G041200 Sobic008G039200 Sobic008G039200 Sobic001G523150--Sobic008G039200 Sobic001G523150--Sobic001G094550 Sobic003G253100 Sobic003G253100 Sobic001G523150--Sobic003G253100 Sobic006G162750 Sobic006G162750 Sobic001G523150--Sobic006G162750 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic001G523150--Sobic007G052500 Sobic001G523150--Sobic001G037033 Sobic001G358366 Sobic001G358366 Sobic001G523150--Sobic001G358366 Sobic001G523150--Sobic009G101500 Sobic002G274300 Sobic002G274300 Sobic001G523150--Sobic002G274300 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic003G030450--Sobic005G045250 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic003G030450--Sobic001G202450 Sobic005G152866 Sobic005G152866 Sobic003G030450--Sobic005G152866 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic003G030450--Sobic003G163000 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic003G030450--Sobic009G210250 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic003G030450--Sobic009G077000 Sobic007G115700 Sobic007G115700 Sobic003G030450--Sobic007G115700 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic003G030450--Sobic010G169950 Sobic003G030450--Sobic001G107550 Sobic001G094550--Sobic002G274300 Sobic001G094550--Sobic001G037033 Sobic001G094550--Sobic001G523150 Sobic001G094550--Sobic009G101500 Sobic001G094550--Sobic006G162750 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic001G094550--Sobic004G077700 Sobic001G094550--Sobic001G358366 Sobic001G094550--Sobic008G039200 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic001G094550--Sobic004G207800 Sobic007G141900--Sobic008G072800 Sobic007G141900--Sobic002G012100 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic007G141900--Sobic002G009000 Sobic007G141900--Sobic008G132500 Sobic007G141900--Sobic010G196466 Sobic007G141900--Sobic010G100700 Sobic007G141900--Sobic006G072701 Sobic004G033650 Sobic004G033650 Sobic007G141900--Sobic004G033650 Sobic007G141900--Sobic008G083100 Sobic009G101500--Sobic004G077700 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic009G101500--Sobic005G139750 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic009G101500--Sobic001G022700 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic009G101500--Sobic006G131700 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic009G101500--Sobic007G145801 Sobic009G101500--Sobic001G094550 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic009G101500--Sobic004G337850 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic009G101500--Sobic001G182700 Sobic001G182800 Sobic001G182800 Sobic009G101500--Sobic001G182800 Sobic001G107550--Sobic009G077000 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic001G107550--Sobic002G401533 Sobic001G107550--Sobic009G210250 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic001G107550--Sobic006G107700 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic001G107550--Sobic003G056200 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic001G107550--Sobic003G161900 Sobic001G107550--Sobic004G077700 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic001G107550--Sobic002G358450 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic001G107550--Sobic002G214000
Octagon: transcription factors


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